Синдекан 4

Синдекан 4 (англ. syndecan 4) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Продукт гена человека SDC4. Подобно синдекану 2 несёт на поверхности гепарансульфатные цепи.

Синдекан 4
PDB прорисовано на основе 1ejp.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 1EJP, 1EJQ, 1OBY, 1YBO
Идентификаторы
Символ	SDC4 ; SYND4
Внешние ID	OMIM: 600017 MGI: 1349164 HomoloGene: 31121 GeneCards: Ген SDC4
Генная онтология Функция • fibronectin binding • protein kinase C binding • protein binding • cytoskeletal protein binding • thrombospondin receptor activity Компонент клетки • Golgi lumen • plasma membrane • integral component of plasma membrane • focal adhesion • cell surface • costamere • lysosomal lumen • membrane raft • extracellular vesicular exosome Биологический процесс • retinoid metabolic process • ureteric bud development • carbohydrate metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • phototransduction, visible light • biological_process • extracellular matrix organization • glycosaminoglycan metabolic process • chondroitin sulfate metabolic process • small molecule metabolic process • positive regulation of protein kinase activity • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of focal adhesion assembly Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	6385	20971
Ensembl	ENSG00000124145	ENSMUSG00000017009
UniProt	P31431	O35988
RefSeq (мРНК)	NM_002999	NM_011521
RefSeq (белок)	NP_002990	NP_035651
Локус (UCSC)	Chr 20: 43.95 – 43.98 Mb	Chr 2: 164.42 – 164.44 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Функции

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 4, также как синдекан 2, несёт гепарансульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом.

Взаимодействует с белками GIPC, NUDT16L1, CDCP1 и SDCBP.

Структура

Зрелый белок состоит из 180 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 21,6 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (127 аминокислот), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 3 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей.

• 
  Структура растворимого фрагмента синдекана 4 (16-мер).
• 
  Изменение структуры растворимого фрагмента синдекана 4 в присутствии фосфатидилинозитола-4,5-дифосфата.

Тканевая специфичность

Экспрессирован на эпителиальных клетках и фибробластах.

Остеоартрит

Уровень синдекана 4 повышен при остеоартрите. В модельных экспериментах на мышах было показано, что ингибирование этого белка снижает разрушение хряща, вызванного остеоартритом.

См. также

• Синдекан 1
• Синдекан 2
• Синдекан 3

Литература

• Oh E.S., Couchman J.R. Syndecans-2 and -4; close cousins, but not identical twins (англ.) // Mol. Cells : journal. — 2004. — April (vol. 17, no. 2). — P. 181—187. — PMID 15179029.
• Wilcox-Adelman S.A., Denhez F., Iwabuchi T., Saoncella S., Calautti E., Goetinck P.F. Syndecan-4: dispensable or indispensable? (неопр.) // Glycoconj. J.. — 2002. — Т. 19, № 4—5. — С. 305—313. — doi:10.1023/A:1025304602057. — PMID 12975609.
• Bass M.D., Humphries M.J. Cytoplasmic interactions of syndecan-4 orchestrate adhesion receptor and growth factor receptor signalling (англ.) // Biochem. J. : journal. — 2002. — November (vol. 368, no. Pt 1). — P. 1—15. — doi:10.1042/BJ20021228. — PMID 12241528. — PMC 1222989.
• Woods A., Couchman J.R. Syndecan-4 and focal adhesion function (англ.) // Curr. Opin. Cell Biol.. — Elsevier, 2001. — October (vol. 13, no. 5). — P. 578—583. — PMID 11544026.

Ссылки

• Клеточный матрикс. Синдекан.