Завершённые обсуждения кандидатов в добротные статьи

Здесь находятся завершившиеся обсуждения. Просьба не вносить изменений.

Статья обобщает информацию о появлении и развитии пангеномного подхода в сравнительной геномике. — Andrey Sigorskikh (обс.) 19:51, 21 апреля 2018 (UTC)

Итог править

× Статья не избрана. Статья слишком велика для ДС (несоответствие п. 8 ВП:ТДС). Рекомендуется доработать её и номинировать в хорошие/избранные. — с уважением, Lapsy 20:36, 21 апреля 2018 (UTC)

Статья была ранее кандидатом в добротные статьи, см.: Википедия:Кандидаты в добротные статьи/1 апреля 2017#Тепловая карта. -- DimaBot 00:32, 22 апреля 2018 (UTC)
Выдвигаю статью в добротные. Исправлены недочеты, из-за которых прошлое выдвижение статьи 27 мая 2017 года не было удовлетворено — Aleks.a.efremov (обс.) 20:08, 21 апреля 2018 (UTC)

  • (!) Комментарий: Тепловая карта (англ. heatmap) — графическое представление данных, где индивидуальные значения в таблице отображаются при помощи цвета. Как-то не по-русски: слово «где» ни с каким другим не согласуется, термин «индивидуальные значения» не совсем понятен. Статья, на которую дана ссылка как на источник для определения термина «тепловая карта», начинается с The cluster heat map is an ingenious display that simultaneously reveals row and column hierarchical cluster structure in a data matrix, то есть дано несколько иное определение, нежели сейчас в википедийной статье. Ещё один вопрос: heatmap (термин, указанный в википедийной статье сейчас) = cluster heat map? --Bff (обс.) 23:10, 21 апреля 2018 (UTC)
  • Весьма вероятно, что File:PriceMapMoscow.png построен на гугловской основе - и потому, при выносе его на удаление, шансов иметь не будет. Retired electrician (обс.) 15:51, 22 апреля 2018 (UTC)
  • Из статьи не ясно, где лежит грань между картами тепловыми и географическими. Ведь на обычной топокарте тоже цветовая кодировка - высот, глубин, видов ландшафтов... - ? Retired electrician (обс.) 15:54, 22 апреля 2018 (UTC)

Итог править

× Статья не избрана. Реакции на замечания нет, в статусе отказано. — с уважением, Lapsy 16:07, 4 мая 2018 (UTC)

Статья является переводом аналогичной английской статьи с модификациями и выдвигается на статус добротной впервые. --Boiko.sash (обс.) 20:48, 21 апреля 2018 (UTC)

Итог править

× Статья не избрана. Статья слишком велика для ДС (несоответствие п. 8 ВП:ТДС). Рекомендуется доработать её и номинировать в хорошие/избранные. — с уважением, Lapsy 10:21, 22 апреля 2018 (UTC)

В момент номинации статья называлась «Групповой анализ дифференциальной экспрессии», была переименована 22 апреля 2018.

Номинирую статью в добротные впервые, в рамках проекта "Биоинформатика" (https://ru.wikipedia.org/wiki/Проект:Биоинформатика). — P.baikuzina (обс.) 20:52, 21 апреля 2018 (UTC)

  • (!) Комментарий: Статья называется «Групповой анализ дифференциальной экспрессии», а начинается с определения термина «Анализ представленности функциональных групп генов». В любом случае, сейчас из текста статьи непонятно, откуда взялся что первый термин, что второй. --Bff (обс.) 12:12, 22 апреля 2018 (UTC)
    Статья была переименована, но происхождение термина так и осталось неясным (лучше всего сделать так, как это сделано в добротной статье Полинтоны). --Bff (обс.) 13:56, 1 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: Преамбула — часть статьи, которая должны быть написана так, чтобы при желании её мог понять человек, не разбирающийся в предмете. Для этого надо сделать ссылки с терминов (хотя бы с наиболее непонятных) на статьи, в которых эти термины объясняются. Если таких статей в русском разделе Википедии нет, можно дать ссылки на статьи об этих терминах в других языковых разделах. Если и там таких статей нет, то надо эти термины пояснить (но делать это, наверно, лучше не в преамбуле, а в теле статьи). Сейчас я вижу три таких термина: «недопредставленная функциональная группа», «перепредставленная функциональная группа», «профиль экспрессии». — Bff (обс.) 13:47, 1 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: дал исследователям огромное количество новой информации, невероятное количество данных. Неэнциклопедично. Количество информации, ещё вчера считавшееся огромным, сегодня уже воспринимается как крошечное. Для измерения информации есть свои единицы, лучше сведения о количестве информации давать в них. --Bff (обс.) 14:01, 1 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: Поскольку «анализ представленности функциональных групп генов» определён в преамбуле как «метод», то в разделе «Подходы» для его составных частей требуется другой термин (что-то типа «разновидности метода» — но лучше так, как в источниках). Возможно, «анализ представленности функциональных групп генов» — это не метод, а совокупность методов? --Bff (обс.) 14:07, 1 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: В разделе «Подходы» вся вводная часть раздела «Подходы» состоит из одного предложения: В настоящее время существует несколько методов анализа представленности функциональных групп генов. Здесь должно быть пояснено, почему из множества методов выбраны именно эти три. Возможно, это наиболее часто используемые методы? Или наиболее эффективные? Это должно быть написано перед началось описания самых методов.
  • (!) Комментарий: Раздел «Успехи применения». В вводной части к этому разделу следует дать некую общую (обобщающую) информацию, а потом уже переходить к частным случаям. Ещё одна проблема в этом разделе — отсутствие критерия отбора этих частных случаев. --Bff (обс.) 14:17, 1 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: Про историю исследований (организации, персоналии) в статье ничего нет, хотя бы несколько предложений на эту тему надо бы добавить. --Bff (обс.) 15:09, 1 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: Таким образом создаётся уникальный биологический смысл. Философские термины в таком контексте употреблять следует с осторожностью, поскольку смысл («сущность феномена в более широком контексте реальности») предложений с такими терминами становится весьма расплывчатым и малопонимаемым. --Bff (обс.) 15:14, 1 мая 2018 (UTC)

Итог править

× Статья не избрана. Реакции на замечания нет, в статусе отказано. — с уважением, Lapsy 13:31, 12 мая 2018 (UTC)

Статья была ранее кандидатом в добротные статьи, см.: Википедия:Кандидаты в добротные статьи/1 апреля 2017#FAIRE-Seq. -- DimaBot 00:32, 22 апреля 2018 (UTC)
Номинирую статью во второй раз после исправления замечаний — Naguest (обс.) 21:22, 21 апреля 2018 (UTC)

  • (!) Комментарий: Рекомендуется иметь хотя бы одну сноску на абзац и, желательно, чтобы сноска закрывала хвост абзаца. Прямые ссылки из текста лучше убрать (Bowtie и другие). — с уважением, Lapsy 10:24, 22 апреля 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: После первого предложения статьи (в котором даётся определение, что такое FAIRE-Seq) стоит ссылка на статью Giresi и др. FAIRE..., однако в тексте той статьи сокращение FAIRE-Seq не встречается ни разу. — Bff (обс.) 23:36, 22 апреля 2018 (UTC)
    • Вы правы, была дана ссылка на метод FAIRE, а не на его подразновидность FAIRE-seq. Сейчас добавлены ссылки на первоисточники по методу FAIRE-seq — с уважением, Naguest (обс.) 09:02, 23 апреля 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: Из раздела "Стадии" список процедур надо удалить: ВП:НЕИНСТРУКЦИЯ. — Eruvanda (обс.) 08:39, 27 апреля 2018 (UTC)
  • (+) ЗаEruvanda (обс.) 08:41, 27 апреля 2018 (UTC)
  • Первый раздел называется «Описание метода». Логично предположить, что это раздел описания метода FAIRE-Seq, которому посвящена статья, однако этот раздел посвящён описанию метода FAIRE (одной из составляющих метода FAIRE-Seq). Возможно, для избежания путаницы следует разделы назвать более развёрнуто (это же касается с раздела «Идея метода»). --Bff (обс.) 23:15, 27 апреля 2018 (UTC)
  • А из картинки Commons:File:FAIRE.png с подписью «Схематичное представление метода FAIRE» получается, что FAIRE-Seq — не FAIRE + секвенирование, а одна из составных частей метода FAIRE. Или нижняя часть картинки уже не относится к методу FAIRE? --Bff (обс.) 23:20, 27 апреля 2018 (UTC)
    • Да, FAIRE-seq - это комбинация двух методов: FAIRE и секвенирование, сначала используется FAIRE, потом секвенирование. С другой стороны, метод FAIRE, как правило, не выполняют без последующих методов seq, qPCR или chip, поэтому с этой точки зрения можно рассматривать FAIRE-seq как разновидность метода FAIRE, Mmutilda (обс.) 11:48, 28 апреля 2018 (UTC)
      • Чтобы читателю разобраться с этой двойственностью, надо, чтобы об этом было написано в статье. --Bff (обс.) 15:18, 1 мая 2018 (UTC)
        • Расширили описание метода, чтобы объяснить первоначальный смысл термина FAIRE - с уважением, Naguest (обс.) 15:33, 3 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: FAIRE-Seq … — метод молекулярной биологии, используемый для определения регуляторных участков последовательности ДНК. Можно ли с термина «регуляторные участки» сделать ссылку на какую-нибудь статью Википедии? --Bff (обс.) 22:19, 7 мая 2018 (UTC)
    • Статья о регуляторных участках ДНК есть только в англоязычной Википедии - с уважением, Naguest (обс.) 21:11, 8 мая 2018 (UTC)
      • Если речь идёт о термине regulatory sequences, то у него ведь есть стандартный перевод — «регуляторные последовательности» ([1], [2]). --Bff (обс.) 21:24, 8 мая 2018 (UTC)
        • Мы исправили этот термин. Однако регуляторные участки ДНК и последовательности - это синонимы. Под регуляторными участками подразумеваются те участки ДНК (а участки ДНК это последовательности нуклеотидов), в которых происходит регуляция генов - с уважением, Naguest (обс.) 08:53, 9 мая 2018 (UTC)
          • Если в преамбуле сейчас используется термин «регуляторные последовательности», то, наверно, и во всём тексте его надо использовать (либо в преамбуле указать «регуляторные последовательности (участки)»). --Bff (обс.) 15:54, 15 мая 2018 (UTC)
  • (!) Комментарий: Для генома человека данные FAIRE-seq доступны как часть проекта ENCODE в UCSC Genome Browser. FAIRE-seq — метод, поэтому, наверно, неправильно говорить про «данные метода», надо как-то переформулировать. Кроме того, ENCODE имеет русское название. Про UCSC Genome Browser статьи в русском разделе нет, но несколько слов про этот сайт можно написать. --Bff (обс.) 22:37, 7 мая 2018 (UTC)
    • Формулировку подправили. Внесли дополнение по UCSC Genome Browser. ENCODE (русскоязычный аналог - энциклопедия ДНК - используется редко). - с уважением, Mmutilda (обс.) 21:18, 8 мая 2018 (UTC)
  • Мне кажется, что не обязательно использовать в тексте слово «детекция»: есть много русских слов, способных его заменить. --Bff (обс.) 15:58, 15 мая 2018 (UTC)
    • Спасибо, мне тоже не нравится "детекция". Заменили его и "детектировать" на наши родные "определение" и "выявлять". - Mmutilda (обс.) 21:45, 16 мая 2018 (UTC)

Итог править

✔ Статья избрана. Требованиям ВП:ТДС соответствует. — Eruvanda (обс.) 05:15, 21 мая 2018 (UTC)