Открыть главное меню

Гаплогруппа L0 — в популяционной генетике — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

Гаплогруппа L0
Тип мтДНК
Время появления 188—112,2 тыс. л. н.[1]
Место появления Южная Африка
Предковая группа Митохондриальная Ева
Субклады L0a'b'f'k, L0d
Мутации-маркеры 263!, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720[2]

Гаплогруппа L0 является одной из двух ветвей от самого последнего общего предка (MRCA) для общей материнской линии человека. Гаплогруппа L0 состоит из пяти основных ветвей (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Четыре из них были первоначально классифицированы в клады L1 как L1a, L1d, L1f и L1K.

Разделение линий L0 и L1′2′3 произошло 124 тыс. л. н. (95% доверительный интервал — 97−151 тыс. л. н.)[3].

В 2014 году у образца возрастом 2330 лет из Южной Африки (St Helena Bay) была выявлена субклада L0d2c1c[4].

В 2016 году у мумии из региона Тули на севере Ботсваны (поздний железный век) выявили митохондриальную гаплогруппу L0[5].

В 2017 году у трёх человек каменного века (Ballito Bay A, Ballito Bay B и Doonside), живших ок. 2 тыс. л. н., и одного человека железного века из замка Шампань (Champagne Castle), жившей 448—282 л. н., определена субклада L0d2[6].

В 2017 году у южноафриканского образца I9133 из Faraoskop Rock Shelter возрастом 2000 л. н. определена субклада L0d1b2b1b, у образца I9134 из Kasteelberg возрастом 1310 л. н. определена субклада L0d1a1a (некалиброванные даты). Субклада L0a определена у танзанийского образца из Пембы (I1048) возрастом 1520 лет назад. У малавийских образцов определены субклады L0f (Fingira, 2400 л. н.), L0a2 (7230 л. н.), L0k2 (10000—5000 л. н.) — все с горы Хора (Hora), L0k1 (4525 л. н.), L0k2 (5400—4800 л. н.) — оба из Chencherere, L0d1c (5290 л. н.), L0d1b2b (5270 л. н.) — оба из Fingira[7].

L0a2 (скорее всего) определена у кенийского образца I8931 (White Rock Point (GrJb2), южный берег залива Уинам (Winam Gulf) озера Виктория) из позднего каменного века (Later Stone Age, N/A), L0a определена у танзанийского образца I13981 (Gishimangeda Cave, Pastoral_Neolithic (other), 2730—2460 л. н.), L0a2d определена у кенийского образца I8758 (Naishi Rockshelter, Pastoral_Neolithic (other), 2700—2370 л. н.), L0f2a1 определена у танзанийского образца I13977 (Gishimangeda Cave, Pastoral_Neolithic (other), 2000—1890 л. н.), L0a1d определена у кенийского образца I8805 (Egerton Cave (GrJh10), Pastoral_Neolithic (Elmenteitan), 1870—1740 л. н.), L0f2a определена у кенийского образца I8892 (Ilkek Mounds/Ilkek II (Gilgil) (GsJj66), Pastoral Iron Age, 1170—980 л. н.), L0a1c1 определена у кенийского образца I12381 (Laikipia District Burial Site (GoJl45), Pastoral Iron Age, 650—560 л. н.)[8].

Область в Африке, где Тишкофф и др. нашли наибольший уровень разнообразия митохондриальной гаплогруппы L0 (зелёный) и регион, где Бехар и др. постулировали самое древнее деление в человеческой популяции (светло-коричневый)

Установлено, что чаще всего гаплогруппа L0 встречается в странах Африки к югу от Сахары. Она достигает своей наивысшей частоты у койсанских народов (73 %)[9], достигая в Намиби (!Xun) 79 %, ЮАР (Khwe/!Xun) 83 % и Ботсване (!Xun) 100 %[10].

При изучении митохондриальных геномов в группе койсанов Бехар (Behar) и др. в 2008 году обнаружили, что древние геномы койсанов ограничивались митохондриальными гаплогруппами L0d и L0k, по их оценке ранней митохондриальной ветви L0k, возникших приблизительно 144 000 лет назад, что составляет около 3/4 времени появления ближайшего митохондриального родственника (митохондриальной Евы)[11]. Другие оценки относят ответвление митохондриальной линии L0k к периоду между 120 000 и 160 000 лет назад[12][13]. Расхождение гаплогрупп L0d и L0a'b'f'k произошло ~ 119 000 (100 100–138 200) лет назад, расхождение гаплогрупп L0k и L0a'b'f произошло ~ 98 700 лет (от 82 300 до 115 400) лет назад, расхождение L0a произошло 42 400 (33 000–52 000) лет назад[14].

MRCA (мтДНК) 
   L0   
 
 
 
 

 L0a



 L0b




 L0f




 L0k




 L0d



 L1-6 
 

L1



 L2-6




Приведённое ниже филогенетическое дерево основано на публикации Ван Овена и Манфреда Кайзера[2] и последующих опубликованных исследованиях.

  • Митохондриальная Ева (MRCA)
    • L0
      • L0d
        • L0d3
        • L0d1’2
          • L0d1
            • L0d1a
            • L0d1b
            • L0d1c
              • L0d1c1
          • L0d2
            • L0d2a’b
              • L0d2a
                • L0d2a1
              • L0d2b
            • L0d2c
      • L0a’b'f’k
        • L0k
          • L0k1
          • L0k2
        • L0a’b'f
          • L0f
            • L0f1
            • L0f2
              • L0f2a
              • L0f2b
          • L0a’b
            • L0a
              • L0a1
                • L0a1a
                  • L0a1a2
                • L0a1b
                  • L0a1b1
                    • L0a1b1a
                  • L0a1b2
                • L0a1c
                • L0a1d
              • L0a2
                • L0a2a
                  • L0a2a1
                    • L0a2a1a
                      • L0a2a1a1
                      • L0a2a1a2
                  • L0a2a2
                    • L0a2a2a
                • L0a2b
                  • L0a2ba
                • L0a2c
                • L0a2d
              • L0a3
              • L0a4
            • L0b

Содержание

ПримечанияПравить

  1. Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen; MacAulay, Vincent. Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock (англ.) // The American Journal of Human Genetics (англ.) : journal. — 2009. — Vol. 84, no. 6. — P. 740—759. — DOI:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. — PMID 19500773.
  2. 1 2 Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation (англ.) // Human Mutation (англ.) : journal. — 2009. — Vol. 30, no. 2. — P. E386—94. — DOI:10.1002/humu.20921. — PMID 18853457.
  3. Emily H. M. Wong, Andrey Khrunin, Larissa Nichols, Dmitry Pushkarev, Denis Khokhrin, Dmitry Verbenko, Oleg Evgrafov, James Knowles, John Novembre, Svetlana Limborska, Anton Valouev. Reconstructing Genetic History of Siberian and Northeastern European Populations, 2015
  4. Alan G. Morris, Anja Heinze, Eva K.F. Chan, Andrew B. Smith, Vanessa M. Hayes. First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African (англ.) // Genome Biology and Evolution (англ.) : journal. — 2014. — DOI:10.1093/gbe/evu202.
  5. Frank J. Rühli, Maryna Steyn, Morongwa N. Mosothwane, Lena Öhrström, Molebogeng K. Bodiba, Abigail Bouwman. Radiological and genetic analysis of a Late Iron Age mummy from the Tuli Block, Botswana (англ.) // South African Journal of Science (англ.) : journal. — Vol. 112, no. 1/2. Архивировано 21 июня 2016 года.
  6. Carina M. Schlebusch et al.Ancient genomes from southern Africa pushes modern human divergence beyond 260,000 years ago, 2017
  7. Pontus Skoglund et al. Reconstructing Prehistoric African Population Structure, 21 September 2017
  8. Mary E. Prendergast et al. Ancient DNA reveals a multistep spread of the first herders into sub-Saharan Africa (Table S7. (separate file) mtDNA haplogroups), 2019
  9. Rosa, Alexandra; Brehm, Antonio; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Villems, Richard. MtDNA Profile of West Africa Guineans: Towards a Better Understanding of the Senegambia Region (англ.) // Annals of Human Genetics (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 68, no. 4. — P. 340—352. — DOI:10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. — PMID 15225159.
  10. Tishkoff, S. A.; Gonder, M. K.; Henn, B. M.; Mortensen, H.; Knight, A.; Gignoux, C.; Fernandopulle, N.; Lema, G.; Nyambo, T. B. History of Click-Speaking Populations of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation (англ.) // Molecular Biology and Evolution (англ.) : journal. — Oxford University Press, 2007. — Vol. 24, no. 10. — P. 2180—2195. — DOI:10.1093/molbev/msm155. — PMID 17656633.
  11. Behar, DM; Villems, R; Villems; Soodyall, H; Soodyall; Blue-Smith, J; Blue-smith; Pereira, L; Pereira; Metspalu, E; Metspalu; Scozzari, R; Scozzari; Makkan, H; Makkan; Tzur, S; Tzur; D. The dawn of human matrilineal diversity (англ.) // American Journal of Human Genetics (англ.) : journal. — 2008. — May (vol. 82, no. 5). — P. 1130—1140. — DOI:10.1016/j.ajhg.2008.04.002. — PMID 18439549.
  12. Soares, P; Ermini, L; Ermini; Thomson, N; Thomson; Mormina, M; Mormina; Rito, T; Rito; Röhl, A; Röhl; Salas, A; Salas; Oppenheimer, S; Oppenheimer; Macaulay, V; MacAulay; M. B. Correcting for purifying selection: an improved human mitochondrial molecular clock (англ.) // American Journal of Human Genetics (англ.) : journal. — 2009. — June (vol. 84, no. 6). — P. 740—759. — DOI:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. — PMID 19500773.
  13. Gonder, MK; Mortensen, HM; Mortensen; Reed, FA; Reed; de Sousa, A; De Sousa; Tishkoff, SA; Tishkoff. Whole-mtDNA genome sequence analysis of ancient African lineages (англ.) // Mol. Biol. Evol : journal. — 2007. — December (vol. 24, no. 3). — P. 757—768. — DOI:10.1093/molbev/msl209. — PMID 17194802.
  14. Daniel Shriner et al. Genetic Ancestry of Hadza and Sandawe Peoples Reveals Ancient Population Structure in Africa, Genome Biology and Evolution, Volume 10, Issue 3, 1 March 2018, Pages 875–882, 14 March 2018
  15. First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African
  16. Alan G. Morris et al. First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African

См. такжеПравить

Древо гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R O A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


СсылкиПравить

Общие сведенияПравить

Гаплогруппа L3Править