Гем С — вид гема, отличается от гема B наличием тиольных групп.
| Гем С | |
|---|---|
 | |
| Общие | |
| Хим. формула | C34H36FeN4O4S2 |
| Рац. формула | C34H36O4N4S2Fe |
| Физические свойства | |
| Молярная масса | 684,651 г/моль |
| Классификация | |
| Рег. номер CAS | 26598-29-8 |
| PubChem | 444125 |
| SMILES | |
| InChI | |
| ChEBI | 60562 |
| ChemSpider | 392105 и 26331983 |
| Безопасность | |
| NFPA 704 | |
| Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное. | |
 Медиафайлы на Викискладе | |
История
правитьТочная структура гема С была опубликована в середине XX века шведским биохимиком К. Г. Паулем.[1] Эта работа подтвердила верность формулы, предположенной ранее великим шведским биохимиком Хуго Теореллем. В 1975 году структура гема С была подтверждена экспериментально методами ядерного магнитного резонанса и инфракрасного излучения на восстановленной, Fe(II), форме гема.[2] Впервые структура гема С, включая абсолютную стереохимическую конфигурацию тиоэфирных связей, была показана для белка позвоночного[3], а ныне и для многих других гем-С-содержащих белков.
Свойства
правитьГем С отличается от гема В тем, что два боковых винильных радикала заменены двумя ковалентными тиоэфирными связями с ферментом. Эти связи не позволяют ему так легко отсоединится от холопротеина или цитохрома с по сравнению с гемом В, который может отсоединится от гемопротеиновых комплексов даже при мягких условиях. Это делает возможным существование неизмеримо большого числа различных структур цитохромов, выполняющих различные функции, и работающих в основном как переносчики электронов.
Количество молекул гема С, присоединённых к одной молекуле белка достаточно широко варьирует. Для клеток позвоночных животных действует правило: один белок — один гем, но у бактерий обычно бывает 2, 4, 5, 6 или даже 16 гемов С на один холопротеин. Считается, что определённое количество и взаиморасположение гемов, не только связано с функциями белка, но и абсолютно необходимы. Например, белки содержащие несколько гемов С участвуют во множественном переносе электронов, особенно важной является реакция 6-ти электронного восстановления, необходимая для восстановления атмосферного азота до двух молекул аммиака. Для бактериальных гемопротеинов характерно высокое соотношение гемов С к аминокислотам, поэтому внутренняя часть некоторых цитохромов с часто оказываются полностью упакованной большим количеством групп гемов, по сравнению с обычными гемопротеинами. Некоторые из них, обычно из одноклеточных организмов, могут содержать до пяти гемов С.[4] Ещё одним важным ферментом, содержащим гем С, является Коэнзим Q - цитохром c редуктаза.
Тиоэфирные связи, по-видимому, многократно увеличивают функциональность холопротеинов. Обычно цитохромы с можно «точно настроить» на большое количество окислительно-восстановительных потенциалов, чем цитохромы b. Возможно именно по этой причине цитохром с практически вездесущ на всех уровнях жизни. Гем С также играет важную роль в апоптозе клеток, когда всего несколько цитоплазматических молекул цитохрома с, содержащих гем С, приводят к программируемой смерти клеток.[5]
Вдобавок к ковалентным связям, железо в геме С дополнительно координируется двумя аминокислотными цепями по 5-й и 6-й координационным связям,, что делает его шестикоординированным. Именно это позволяет железу в цитохроме менять свою валентность, в отличие от железа в гемоглобине, которое вне зависимости от присоединения или отдачи кислорода остаётся двухвалентным. Например, цитохром с млекопитающих и тунца содержит единственный гем С одновременно скоординированный цепями из гистидина и метионина[6]. Возможно именно из-за двух ковалентных связей, удерживающих гем, железо в геме С иногда лигируется аминогруппой лизина или даже водой.
Источники
править- ↑ Paul, K.G.; Högfeldt, Erik; Sillén, Lars Gunnar; Kinell, Per-Olof. The splitting with silver salts of the cysteine-porphyrin bonds in cytochrome c (англ.) // Acta Chemica Scandinavica[англ.] : journal. — 1950. — Vol. 4. — P. 239—244. — doi:10.3891/acta.chem.scand.04-0239.
- ↑ Caughey, W.S. et al. Heme A of Cytochrome c Oxidase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1975. — Vol. 250. — P. 7602—7622.
- ↑ Takano T., Trus B.L., Mandel N., Mandel G., Kallai O.B., Swanson R., Dickerson R.E. Tuna cytochrome c at 2.0 A resolution. II. Ferrocytochrome structure analysis. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1977. — Vol. 252. — P. 776—785. — PMID 188826.
- ↑ Diode or Tunnel-Diode Characteristics? Resolving the Catalytic Consequences of Proton Coupled Electron Transfer in a Multi-Centered Oxidoreductase. Дата обращения: 28 октября 2012. Архивировано 30 мая 2020 года.
- ↑ Bowman, S.E.J., Bren, K.L. The chemistry and biochemistry of heme C: functional bases for covalent attachment (англ.) // Nat. Prod. Rep.[англ.] : journal. — 2008. — Vol. 25, no. 6. — P. 1118—1130. — doi:10.1039/b717196j. — PMID 19030605. — PMC 2654777.
- ↑ Yeh, S.R., Han, S., and Rousseau, D.L. Cytochrome c folding and unfolding (англ.) // Accounts of Chemical Research[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 31, no. 11. — P. 727—735. — doi:10.1021/ar970084p.