Интерактомика

Интерактомика (англ. Interactomics) — это дисциплина, находящаяся на стыке биоинформатики и биохимии, которая занимается экспериментальными и биоинформатическими исследованиями белок-белковых взаимодействий и последствий этих взаимодействий между белками и другими молекулами внутри клетки^[1]. Целью интерактомики является изучение функции белков (в форме стабильных или динамических белковых комплексов) в живых системах, определение корреляций между молекулами на основе анализа больших наборов полногеномных и протеомных данных. Интерактомика является примером науки, которая позволяет взглянуть на организм или биосистему в целом. Например, посредством сравнения сетей взаимодействий (то есть интерактомов) у различных видов, тем самым определяя консервативные и вариабельные участки таких сетей. Изучение взаимодействий между белками и другими молекулами и последствий этих взаимодействий позволяет формулировать новые гипотезы об ответных реакциях этих молекул, которые могут быть проверены в новых экспериментах^[2].

В качестве физического инструментария для исследования белок-белковых взаимодействий используются твёрдофазная аффинная хроматография, молекулярный фишинг на оптических чипах и магнитных наночастицах ^[3].

См. также править

Примечания править

↑ Kiemer, L (2007). «Comparative interactomics: comparing apples and pears?». TRENDS in Biotechnology 25 (10): 448—454. DOI:10.1016/j.tibtech.2007.08.002. PMID 17825444.
↑ Bruggeman, F J (2006). «The nature of systems biology». TRENDS in Microbiology 15 (1): 45-50. DOI:10.1016/j.tim.2006.11.003. PMID 17113776.
↑ Иванов А.С., Ершов П.В., Мезенцев Ю.А., Поверенная Е.В., Лисица А.В., Арчаков А.И. Протоколы белковой интерактомики: молекулярный фишинг на оптических чипах и магнитных наночастицах // Биомедицинская химия. — 2013. — Т. 59, № 2. — С. 171-182. — doi:10.18097/pbmc20135902171. — PMID 23789344. Архивировано 1 сентября 2017 года.

[1] Kiemer, L (2007). «Comparative interactomics: comparing apples and pears?». TRENDS in Biotechnology 25 (10): 448—454. DOI:10.1016/j.tibtech.2007.08.002. PMID 17825444.

[2] Bruggeman, F J (2006). «The nature of systems biology». TRENDS in Microbiology 15 (1): 45-50. DOI:10.1016/j.tim.2006.11.003. PMID 17113776.

[3] Иванов А.С., Ершов П.В., Мезенцев Ю.А., Поверенная Е.В., Лисица А.В., Арчаков А.И. Протоколы белковой интерактомики: молекулярный фишинг на оптических чипах и магнитных наночастицах // Биомедицинская химия. — 2013. — Т. 59, № 2. — С. 171-182. — doi:10.18097/pbmc20135902171. — PMID 23789344. Архивировано 1 сентября 2017 года.

[1]

[2]

[3]