Ленточная диаграмма (биохимия)

Ленточная диаграмма — схематичное трёхмерное изображение структуры белка. Альфа-спирали на диаграмме изображаются лентами, бета-листы — стрелками, случайные спирали — линиями или тонкими трубками. Направление, в котором рассматривается цепочка, может быть отображено плавным изменением цвета ленты.

Ленточная диаграмма мономера триозофосфатизомеразы, рисунок Джейн Ричардсон

См. также править

Литература править

Томас Дж. Смит (2005) "Displaying and Analyzing Atomic Structures on the Macintosh". Danforth Plant Science Center.

Ричардсон, Д. С.; Ричардсон, Дж. С. (2002). "Teaching Molecular 3-D Literacy". Biochemistry and Molecular Biology Education. 30 (1): 21–26. doi:10.1002/bmb.2002.494030010005.

Ричардсон, Дж. С. (2000), "Early ribbon drawings of proteins", Nature Structural Biology, 7 (8): 624–625, doi:10.1038/77912, PMID 10932243, S2CID 52856546.

Ричардсон, Дж. С. (1985), Schematic Drawings of Protein Structures, Methods in Enzymology, vol. 115, pp. 359–380, doi:10.1016/0076-6879(85)15026-3, ISBN 978-0-12-182015-2, PMID 3853075.

Ричардсон, Дж. С. (1981), Anatomy and Taxonomy of Protein Structures, Advances in Protein Chemistry, vol. 34, pp. 167–339, doi:10.1016/S0065-3233(08)60520-3, ISBN 978-0-12-034234-1, PMID 7020376.

Артур М. Леск; Карл Д. Хардман. (1982), "Computer-Generated Schematic Diagrams of Protein Structures", Science, 216 (4545): 539–540, Bibcode:1982Sci...216..539L, doi:10.1126/science.7071602, PMID 7071602.

М. Карсон; С. Е. Багг (1986), "Algorithm for Ribbon Models of Proteins", Journal of Molecular Graphics, 4 (2): 121–122, doi:10.1016/0263-7855(86)80010-8.

Ричардсон, Д. C.; Ричардсон, Дж. С. (1992), "The kinemage: a tool for scientific communication", Protein Science, 1 (1): 3–9, doi:10.1002/pro.5560010102, PMC 2142077, PMID 1304880

В. Б. Чен; И. В. Дэвис; Ричардсон Д. C. (2009), "KING (Kinemage, Next Generation): A versatile interactive molecular and scientific visualization program", Protein Science, 18 (11): 2403–2409, doi:10.1002/pro.250, PMC 2788294, PMID 19768809

Томас Д. Годдард; Конрад С. Хуанг; Томас Е. Феррин (2005) "Software Extensions to UCSF Chimera for Interactive Visualization of Large Molecular Assemblies", Structure, 13 (3): 473–482, doi:10.1016/j.str.2005.01.006, PMID 15766548.

Аксел Т. Брангер; Джеймс. А. Веллс (2009), "Warren L. DeLano, 21 June 1972-3 November 2009", Nature Structural & Molecular Biology, 16 (12): 1202–1203, doi:10.1038/nsmb1209-1202, PMID 19956203.