Открыть главное меню

Псевдоуридин (сокращённо обозначается греческой буквой пси- Ψ) — это C-гликозид, изомер нуклеозида уридина. Это наиболее часто встречающееся модифицированное основание из более чем сотни различных модифицированных оснований, которые встречаются в РНК[1]. Псевдоуридин встречается во всех видах и многих классах РНК[2][3][4][5]. Он синтезируется ферментом псевдоуриднсинтазой, который посттранскрипционно изомеризует определённые остатки уридина в РНК. Такой процесс называют псевдоуридинилирование[6].

Псевдоуридин
Pseudouridine.svg
Общие
Систематическое
наименование
5-​[​(2S,3R,4S,5R)​-​3,4-​Дигидрокси-​5-​​(гидроксиметил)​-​оксолан-​2-​ил]-​1H-​пиримидин-​2,4-​дион
Хим. формула C9H12N2O6
Физические свойства
Состояние Белый гранулированный порошок
Молярная масса 244.20 г/моль
Химические свойства
Растворимость
 • в воде хорошо растворим в воде
Классификация
Рег. номер CAS 1445-07-4
PubChem
SMILES
InChI
ChEBI 17802
ChemSpider
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.
Синтез псевдоуридина из уридина при помощи псевдоуридинсинтазы.

Широко распространён в тРНК, где находится в комплексе с тимидином и цитозином в так называемом TΨC плече. Относится к консервативной, инвариантной части тРНК. Функция псевдоуридина в РНК остаётся неясной, но как предполагают, он играет роль во взаимодействии с аминоацилтрансферазами и, следовательно, в инициации трансляции. Недавние исследования показали, что он возможно обеспечивает защиту от радиации[7].

тРНКAla из S. cerevisiae.
Псевдоуридин= Ψ
Взаимодействие пары оснований A-Ψ.

См. такжеПравить

ПримечанияПравить

  1. Hamma T., Ferré-D'Amaré A. R. Pseudouridine synthases (неопр.) // Chem. Biol. (англ.). — 2006. — Т. 13, № 11. — С. 1125—1135. — DOI:10.1016/j.chembiol.2006.09.009. — PMID 17113994.
  2. Charette M., Gray M. W. Pseudouridine in RNA: what, where, how, and why (неопр.) // IUBMB Life. — 2000. — Т. 49, № 5. — С. 341—351. — DOI:10.1080/152165400410182. — PMID 10902565.
  3. Liang X. H., Xu Y. X., MIchaeli S. The spliced leader-associated RNA is a trypanosome-specific sn(o) RNA that has the potential to guide pseudouridine formation on the SL RNA (англ.) // RNA : journal. — 2002. — Vol. 8, no. 2. — P. 237—246. — DOI:10.1017/S1355838202018290. — PMID 11911368.
  4. Carlile Thomas. Pseudouridine profiling reveals regulated mRNA pseudouridylation in yeast and human cells (англ.) // Nature : journal. — 2014. — 5 September. — DOI:10.1038/nature13802.
  5. Schwartz Schraga. Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread Dynamic-Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 2014. — 11 September. — DOI:10.1016/j.cell.2014.08.028.
  6. Ferré-D'Amaré A. R. RNA-modifying enzymes (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 2003. — Vol. 13, no. 1. — P. 49—55. — DOI:10.1016/S0959-440X(02)00002-7. — PMID 12581659.
  7. Monobe, Manami; Arimoto-Kobayashi, Sakae; Ando, Koichi. β-Pseudouridine, a beer component, reduces radiation-induced chromosome aberrations in human lymphocytes (англ.) // Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis : journal. — 2003. — Vol. 538, no. 1—2. — P. 93—99. — DOI:10.1016/S1383-5718(03)00094-9. — PMID 12834758.