[[Файл:Вид на Лебединський монастир.jpg|thumb|слева|255px|<center><small>{{iw|Лебединский Николаевский монастырь||uk|Миколаївський Лебединський жіночий монастир УПЦ}}</small></center>]]
В январе 1850 года онаФиларета Шлиппенбах была назначена настоятельницей Одесского женского училищного монастыря и посвящена в сан игумении; 13 марта 1853 года переведена на должность настоятельницы Лебединского женского монастыря, но так как прежняя его настоятельница не перешла в [[Одесса|Одессу]], как было назначено ранее, то игумении Филарете пришлось жить в монастыре в числе сестер. В это-то время она занялась воспитанием девиц духовного и светского звания<ref name="Викитека РБС"/>.
20 февраля 1858 года онаФиларета Шлиппенбах была вновь назначена настоятельницеюнастоятельницей монастыря и в 1859 году открыла при нем шестиклассное училище для воспитания бедных девиц, преимущественно духовного звания, с программою епархиальных женских училищ. С самыми малыми средствами она содержала это училище до конца своей жизни, в течение 17 лет своего управления монастырем, и довела число учениц до 104-х<ref name="Викитека РБС"/>.
Филарета Шлиппенбах умерла 26 апреля 1875 года во вверенной ей обители.
