Джонсон и режиссёр [[Тейлор-Джонсон, Сэм|Сэм Тейлор-Вуд]] начали встречаться после знакомства на съёмках фильма «[[Стать Джоном Ленноном]]» в 2009 году; на момент начала отношений Джонсону было 1819 лет, а Тейлор-Вуд — 42 года<ref>{{Cite news|title=She's Having His Baby!|author=Jessen, Monique; Chi, Paul|url=https://people.com/archive/shes-having-his-baby-vol-73-no-17/|work=[[People]]|date=3 мая 2010|language=en}}</ref>. Они объявили о помолвке в октябре 2009 года и поженились 21 июня 2012 года. Они оба сменили фамилии на «Тейлор-Джонсон», которые также используют профессионально<ref>{{Cite news|title=Aaron Johnson, Sam Taylor-Wood Marry|author=Buchanan, Kyle|url=http://www.vulture.com/2012/06/aaron-johnson-sam-taylor-wood-marry.html|work=Vulture|date=22 июня 2012|language=en}}</ref>. У пары есть две дочери — Уайлда Рэй (род. 7 июля 2010) и Роми Хиро (род. 18 января 2012). Он также является отчимом двух дочерей жены от предыдущего брака<ref>{{Cite news|title=Sam Taylor Wood husband Aaron Taylor-Johnson appearance overhaul in Joe Wright's Anna Karenina|author=de Lacey, Martha|url=http://www.dailymail.co.uk/femail/article-2197719/Sam-Taylor-Wood-husband-Aaron-Taylor-Johnson-appearance-overhaul-Joe-Wrights-Anna-Karenina.html|work=[[Daily Mail]]|date=3 сентября 2012|language=en}}</ref>.
