Эта классификация основана на положении N- и [[C-конец|C-концевых]] доменов и относится ко всем интегральным белкам мембраны. К I, II и III типам относятся белки, которые пересекают мембрану только один раз, а к типу IV относятся те белки, которые пересекают мембрану несколько раз. Трансмембранные белки I типа имеют N-концевую сигнальную последовательность и заякорены на липидной мембране при помощи ''последовательности остановки транслокации'', которая как высвобождается [[транслаконтранслокон]]ом, таким образом, что две части белка остаются торчать по разные стороны мембраны. Они расположены таким образом, что их N-конец направлен в просвет [[Эндоплазматический ретикулум|эндоплазматического ретикулума]] в процессе их синтеза и транслокации (N-конец будет направлен во внеклеточное пространство, если зрелый белок расположен на [[плазмалемма|плазмалемме]]). Белки II и III типа заякорены ''сигнальной якорной последовательностью'', которая расположена не на конце, а внутри полипептидной цепи. Белки II типа направлены в просвет ЭР своим [[C-конец|C-концом]], а белки III типа N-концом. Тип IV подразделяют на IV-A, у которых N-конец направлен в цитозоль и IV-B, у которых N-конец направлен в просвет ЭПР<ref>Harvey Lodish etc.; Molecular Cell Biology, Sixth edition, p.546</ref>. К V типу относятся интегральные белки, которые не являются трансмембранными и заякорены на липидной мембране при помощи ковалентно-связанных липидов. К типу VI относятся белки, которые имеют как трансмембранные домены, так и липидные якори<ref>Nelson, D. L., & Cox, M. M. (2008). Principles of Biochemistry (5th ed., p. 377). New York, NY: W.H. Freeman and Company.</ref>.
