В [[Рабоче-крестьянская Красная армия|РККА]] с марта 1919 года. Вступил добровольно, сразу после возвращения из плена. Служил в Витебском пехотном полку войск [[ВЧК]]. С августа 1919 — командир 99-го стрелкового [[полк]]а, а с июля — командир 97-го стрелкового полка (оба полка входили в состав [[11-я стрелковая дивизия|11-й Петроградской стрелковой дивизии]]). С ноября 1919 года командовал 32-й стрелковой бригадой. Участник [[Гражданская война в России|Гражданской войны]]: в 1919 году воевал на [[Северный фронт (РККА)|Северном фронте]] в [[Латвия|Латвии]] и в [[Эстония|Эстонии]], участник обороны [[Петроград]]а от армии генерала [[Юденич, Николай Николаевич|Н. Н. Юденича]], участник операций против войск генерала [[Булак-Балахович, Станислав Никодимович|С. Н. Булак-Балаховича]]. Летом 1920 года бригада была переброшена на [[Советско-польская война|Польский фронт]], там отличился в боях, был ранен, награждён [[Орден Красного Знамени|орденом Красного Знамени]]. В марте 1921 года во главе этой [[бригада|бригады]] участвовал в подавлении [[Кронштадтское восстание (1921)|Кронштадтского мятежа]] (1921), одним из первых ворвался в крепость и вновь был ранен. Награждён вторым орденом Красного Знамени, что было огромной редкостью в то время. Член [[Коммунистическая партия Советского Союза|РКП(б)]] с 1922 года.
После войны служил в той же 11-й Петроградской стрелковой дивизии: командир 33-й стрелковой бригады, командир 31-й стрелковой бригады, помощник начальника дивизии. Участник [[Вторая советско-финская война|боевых действий в Карелии против финских войск]] в 1922 году. Окончил [[Военно-академические курсы высшего комсостава РККА]] в 1923 году в [[Москва|Москве]]. С сентября 1923 года временно исполнял должность начальника 11-й стрелковой дивизии. С октября 1924 — командир [[2-я Приамурская стрелковая дивизия|2-й Приамурской стрелковой дивизии]] ([[Благовещенск]]). С марта 1926 по декабрь 1929 года — командир [[36-я стрелковая дивизия (формирования 1918 года)|36-й Забайкальской стрелковой дивизии]] ([[Чита]]). В 1927 году окончил курсы усовершенствования высшего начсостава, а в 1929 году во главе дивизии участвовал в боевых действиях на КВЖД.
В декабре 1929 года был откомандирован в промышленность, командовал Закавказским промышленным округом [[ВОХР (охрана)|военизированной охраны]] промышленных предприятий и государственных сооружений [[ВСНХ СССР]], успешно руководил борьбой с [[диверсант]]ами и [[Басмачество|басмачами]]. В связи передачей в 1931 году военизированной охраны Наркомтяжпрома СССР в ОГПУ СССР, работал заместителем начальника [[Противовоздушная оборона|противовоздушной]] и [[Противопожарная оборона|противопожарной обороны]] при [[ВСНХ СССР]]<ref>Селявкин А. И. В трех войнах на броневиках и танках. — X.: Прапор, 1981. глава «Часовые промышленности»</ref>. Затем возвращён в РККА и в сентябре 1932 года назначен командиром [[73-я стрелковая дивизия (1-го формирования)|73-й Омской стрелковой дивизии]] в [[СибВО|Сибирском военном округе]]. В сентябре 1933 года направлен на учёбу и в 1935 году окончил [[Военная академия имени М. В. Фрунзе|Военную академию РККА имени М. В. Фрунзе]]. С ноября 1935 года служил в 2-м отделе [[Штаб РККА|штаба РККА]]. С апреля 1936 года — начальник 3-го (с августа 1938 - — 5-го) отдела в Управлении боевой подготовки РККА.
В декабре 1938 году был уволен из Красной Армии, но арестован не был. В июне 1939 года приказ об увольнении был отменён. Тем не менее, будучи восстановленным в РККА, Рейтер ещё полгода оставался без нового назначения и только в январе 1940 года был назначен помощником командующего по военно-учебным заведениям [[СКВО|Северо-Кавказского военного округа]], с июля 1940 — заместителем командующего, а в июне 1941 года стал временно исполнять обязанности командующего войсками военного округа.
