[[Файл:Putin and Muslim religious leaders of Bashkortostan.jpg|thumb|300px|[[Владимир Путин]], [[Муртаза Рахимов]] и мусульманские религиозные лидеры Башкортостана в мечети]]
Архитектором проекта мечети является В. В.Вакиль Вагизович Давлятшин <ref name="kiziltan">[http://www.kiziltan.ru/tat/news/832.html Исполнилось десять лет со дня открытия мечети «Ляля-Тюльпан»]{{Недоступная ссылка|date=Июль 2018 |bot=InternetArchiveBot }} // Кызыл Тањ</ref><ref name="devl">[http://башкирская-энциклопедия.рф/index.php/2-statya/11870-davlyatshin-vakil-vagizovich Башкирская энциклопедия]</ref><ref name="tulp">[http://ogbus.ru/files/ogbus/authors/Kalimullin/Kalimullin_2.pdf Ф.Б. Калимуллин, Д.Б. Калимуллина «Тюльпаны у нефтяного университета» // Нефтегазовое дело, 2004]</ref>. Мечеть построена на пожертвования верующих и при содействии [[Правительство Республики Башкортостан|Правительства Башкортостана]]<ref name="kremlin">[http://president.kremlin.ru/sdocs/news.shtml?day=10&month=06&year=2001 Владимир Путин посетил православный храм близ Уфы и мечеть «Ляля-Тюльпан».// Официальный сайт Президента Российской Федерации.]{{Недоступная ссылка|date=Июль 2018 |bot=InternetArchiveBot }}</ref>. Строительство началось в 1989 году и завершено в 1998 году, а было осуществлено трестом «БНЗС».
В 1999—2005 гг. в здании мечети располагался [[Российский исламский университет (Уфа)|Российский исламский университет]].
