Генетическая карта: различия между версиями

[непроверенная версия][непроверенная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 1:
[[Файл:Genomic chicks.jpg|280px|thumb|Генетическая карта (карта [[Сцепление генов|сцепления]]) [[Курица#Генетика|куриного генома]]<ref>{{статья|автор=Groenen M. A., Cheng H. H., Bumstead N., Benkel B. F., Briles W. E., Burke T., Burt D. W., Crittenden L. B., Dodgson J., Hillel J., Lamont S., de Leon A. P., Soller M., Takahashi H., Vignal A.|заглавие=A consensus linkage map of the chicken genome|ссылка=http://www.molecularcytogenetics.org/content/4/1/22|язык=en|издание={{en2|Genome Research}}|тип=журнал|место=[[Cold Spring Harbor]], [[Нью-Йорк (штат)|NY]], [[USA]]|издательство={{en2|Cold Spring Harbor Laboratory Press}}|год=2000|volumeтом=10|номер=1|pagesстраницы=137—147|issn=1088-9051|doi=10.1101/gr.10.1.137|pmid=10645958|archiveurl=http://www.webcitation.org/6X9SD3znP|archivedate=2015-03-19}}{{v|19|3|2015}}</ref>]]
'''Генети́ческая ка́рта''' — схема взаимного расположения [[Структурный ген|структурных генов]], регуляторных элементов и [[ДНК-маркер|генетических маркеров]], а также относительных расстояний между ними на [[Хромосома|хромосоме]] ([[Группа сцепления|группе сцепления]])<ref>{{cwкнига|urlзаглавие=http://dic.academic.ru/dic.nsf/genetics/5049|titleчасть=генетическая карта|workгод=Словари и энциклопедии на Академике: Биология: Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь|publisherавтор=Академик|descriptionязык=Источник: ''Арефьев В. А., Лисовенко Л. А.'' Англо-русский толковый словарь генетических терминов / Науч. ред. Л. И. Патрушев. — {{М.}}: Изд-во [[ВНИРО]], 1995. — 407 с|accessdate=2015-03-22|archiveurl=http://www.webcitation.org/6XEFZzHLv|archivedate=2015-03-22ru}}</ref><ref name=genexp>{{книга|автор=Тарантул B. З.|часть=Генетические карты сцепления: общие сведения|заглавие=Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский|ссылка=http://humbio.ru/humbio/genexp/0004bd28.htm|место=M.|издательство=Языки славянских культур|год=2009|страниц=936|isbn=978-5-9551-0342-6}}{{v|22|3|2015}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6XEEzKUDv|2015-03-22}}</ref>. Метод построения генетических карт называется '''генетическим картированием'''<ref>{{книга|автор=Тарантул B. З.|часть=Генетическое картирование|заглавие=Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский|ссылка=http://humbio.ru/humbio/tarantul_sl/00000572.htm|место=M.|издательство=Языки славянских культур|год=2009|страниц=936|isbn=978-5-9551-0342-6}}{{v|22|3|2015}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6XEDkvP8x|2015-03-22}}</ref>.
 
== История генетического картирования ==
Строка 11:
Помимо генетических, существуют и другие карты хромосом:
* '''[[Цитогенетика|Цитогенетическая]] карта'''<ref>{{книга|автор=Тарантул B. З.|часть=Цитогенетическое картирование (cytogenetic mapping)|заглавие=Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский|ссылка=http://humbio.ru/humbio/tarantul_sl/000017ca.htm|место=M.|издательство=Языки славянских культур|год=2009|страниц=936|isbn=978-5-9551-0342-6}}{{v|23|3|2015}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6XEqY3YSu|2015-03-23}}</ref><ref>{{cw|url=http://humbio.ru/humbio/genexp/001503c4.htm|title=Цитогенетические хромосомные карты|author=Александров А. А., Ковалёв П. В.|work=База знаний по молекулярной и общей биологии человека|publisher=HUMBIO; ООО «Лайт Телеком»|location={{M.}}|accessdate=2015-03-23|archiveurl=http://www.webcitation.org/6XEvZWZeP|archivedate=2015-03-23}}</ref> — пространственное представление порядка взаимного расположения структурных элементов хромосом (например, их дифференциально [[Окрашивание по Романовскому — Гимзе|окрашенных]] участков на [[идеограмма]]х) или [[локус]]ов [[Гибридизация ДНК|гибридизации]] меченых [[ДНК-зонд]]ов (см. [[Флуоресцентная гибридизация in situ|Флуоресцентная гибридизация ''in situ'']]).
* '''Физическая карта'''<ref>{{книга|автор=Тарантул B. З.|часть=Физическая карта (physical map)|заглавие=Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский|ссылка=http://humbio.ru/humbio/tarantul_sl/000016b5.htm|место=M.|издательство=Языки славянских культур|год=2009|страниц=936|isbn=978-5-9551-0342-6}}{{v|23|3|2015}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6XEyplHNC|2015-03-23}}</ref> — представление порядка следования физических маркеров (фрагментов [[Молекула|молекулы]] [[ДНК]]), расстояние между которыми определяется в парах [[нуклеотид]]ов (п. н.)<ref name=genexp/><ref>''Ren C. W., Lee M.-K., Yan B., Ding K., Cox B., Romanov M. N., Price J. A., Dodgson J. B., Zhang H.-B.'' [http://genome.cshlp.org/content/13/12/2754 A BAC-based physical map of the chicken genome] // Genome Research. — 2003. — Vol. 13. — No. 12. — P. 2754—2758.{{ref-en}}{{v|15|2|2015}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6WMm2GmaY|2015-02-15}}</ref><ref>{{статья|автор=Wallis J. W., Aerts J., Groenen M. A., Crooijmans R. P., Layman D., Graves T. A., Scheer D. E., Kremitzki C., Fedele M. J., Mudd N. K., Cardenas M., Higginbotham J., Carter J., McGrane R., Gaige T., Mead K., Walker J., Albracht D., Davito J., Yang S. P., Leong S., Chinwalla A., Sekhon M., Wylie K., Dodgson J., Romanov M. N., Cheng H., de Jong P. J., Osoegawa K., Nefedov M., Zhang H., McPherson J. D., Krzywinski M., Schein J., Hillier L., Mardis E. R., Wilson R. K., Warren W. C.|заглавие=A physical map of the chicken genome|ссылка=http://www.nature.com/nature/journal/v432/n7018/full/nature03030.html|язык=en|издание=[[Nature]]|тип=журнал|место=[[London]], [[Великобритания|UK]]|издательство=[[Nature Publishing Group]]|год=2004|volumeтом=432|номер=7018|pagesстраницы=793—800|issn=1476-4687|doi=10.1038/nature03030|pmid=15592415|archiveurl=http://www.webcitation.org/6X3COUQHm|archivedate=2015-03-15}}{{v|15|3|2015}}</ref>.
* '''Рестрикционная карта'''<ref>{{книга|автор=Тарантул B. З.|часть=Рестрикционная карта, карта рестрикции (restriction map)|заглавие=Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский|ссылка=http://humbio.ru/humbio/tarantul_sl/000012cf.htm|место=M.|издательство=Языки славянских культур|год=2009|страниц=936|isbn=978-5-9551-0342-6}}{{v|23|3|2015}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6XEycvyNl|2015-03-23}}</ref> — вид физической карты, на которой указан порядок следования и расстояния между [[Сайт рестрикции|сайтами расщепления]] [[Эндонуклеазы рестрикции|ДНК-рестриктазами]] (обычно участок узнавания рестриктазы размером 4—6 п. н.). Маркерами этой карты являются рестрикционные фрагменты ([[Сайт рестрикции|сайты рестрикции]]).
 
Конечной целью изучения [[геном]]а данного организма является интеграция его генетических, цитогенетических и физических карт<ref>{{статья|автор=Romanov M. N., Price J. A., Dodgson J. B.|заглавие=Integration of animal linkage and BAC contig maps using overgo hybridization|ссылка=http://www.karger.com/Article/Abstract/75763|язык=en|издание={{en2Нп3|Cytogenetic and Genome Research}}|тип=журнал|место=[[Базель|Basel]], [[Швейцария|Switzerland]]|издательство={{en2|Karger Publishers}}|год=2003|volumeтом=102|номер=1—4|pagesстраницы=277—281|issn=1424-8581|doi=10.1159/000075763|pmid=14970717|archiveurl=http://www.webcitation.org/6XF717AqI|archivedate=2015-03-23}}{{v|23|3|2015}}</ref><ref>{{cite conference|last=Dodgson J. B., Romanov M. N., Sizemore F. G., Price J. A.|date=2003-02-05|title=Integration of genetic and physical maps of the chicken genome|conference=Conference “Advances in Genome Biology and Technology, in cooperation with Automation in Mapping and DNA Sequencing”, {{en2|Marco Island}}, Februaury 5—8, 2003|publisher=Advances in Genome Biology and Technology|location=Marco Island, [[Флорида|FL]], USA|pages=25|url=http://kar.kent.ac.uk/46428/|accessdate=2015-03-23}}{{ref-en}} {{webarchive|http://www.webcitation.org/6XF7cMCwI|2015-03-23}}</ref><ref>{{статья|автор=Romanov M. N., Daniels L. M., Dodgson J. B., Delany M. E.|заглавие=Integration of the cytogenetic and physical maps of chicken chromosome 17|ссылка=https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-005-1506-3|язык=en|издание=Chromosome Research|тип=журнал|место=[[Berlin]]—[[Heidelberg]], [[Germany]]|издательство=[[Springer Science+Business Media]]|год=2005|volumeтом=13|номер=2|pagesстраницы=215—222|issn=0967-3849|doi=10.1007/s10577-005-1506-3|pmid=15861310|archiveurl=http://www.webcitation.org/6XF8D3FhL|archivedate=2015-03-23}}{{v|23|3|2015}}</ref>, а также их привязка к полной геномной [[Секвенирование|последовательности]]<ref>{{cite conference|last=Dodgson J. B., Romanov M. N.|date=2004-06-06|title=The chicken genome: from maps to sequence|conference=International Symposium on Avian Endocrinology, [[Scottsdale]], June 6—11, 2004|conferenceurl=https://web.archive.org/web/20070810101758/http://lsweb.la.asu.edu/isae/Conference%20Schedule.htm|booktitle=Symposium Talk and Plenary Lecture Abstracts|publisher=[[Arizona State University]]|location=Scottsdale, [[Аризона|AZ]], USA|url=http://lsweb.la.asu.edu/isae/TALK%20abstracts.htm|accessdate=2006-09-02|id=Abstract T26}}{{ref-en}} {{webarchive|https://web.archive.org/web/20060902152557/http://lsweb.la.asu.edu/isae/TALK%20abstracts.htm|2006-09-02}}</ref>.
 
== Генетическое и физическое картирование ==