Классификация дискуссионна. Изначально считался подвидом ''[[Saimiri scuireussciureus]]'', по результатам генетических исследований (Carretero-Pinzon, 2009) был поднят до ранга вида<ref name=handbook/><ref name=all/><ref>{{cite journal|title=The Taxonomy and Conservation Status of Saimiri sciureus albigena: A Squirrel Monkey Endemic to Colombia |author=Carretero-Pinzón, X. |author2=Ruiz-García, M. |author3-link=Thomas Defler |author3=Defler, T. |url=https://www.researchgate.net/publication/228369497 |journal=Primate Conservation |volume=24 |pages=59–64 |year=2009 |accessdate=2019-01-13|doi=10.1896/052.024.0102 }}</ref>. Более поздние исследования (Alfaro, 2014) указывают на то, что ''[[Saimiri macrodon]]'' является синонимом ''Saimiri cassiquiarensis''<ref>{{cite journal |title=Biogeography of squirrel monkeys (genus ''Saimiri''): South-central Amazon origin and rapid pan-Amazonian diversification of a lowland primate |author=Lynch Alfaro, J.W. |display-authors=et al |pages=436–454 |journal=Molecular Phylogenetics and Evolution |volume=82 |year=2015 |doi=10.1016/j.ympev.2014.09.004 |pmid=25305518}}</ref>. Некоторые исследователи также считают, что ''S. macrodon'' следует классифицировать как подвид ''S. cassiquiarensis macrodon''<ref>{{cite web|title=Primates of the Neoptropics|url=http://www.primate-sg.org/primates_of_neotropics/|publisher=IUCN Primate Specialist Group|date=September 2018|accessdate=2019-02-04}}</ref><ref>{{cite web|title=Saimiri cassiquiarensis macrodon|url=https://mammaldiversity.org/species-account.php?genus=saimiri&species=macrodon|publisher=Mammal Diversity Database|accessdate=2019-02-04}}</ref>.
