Википедия:Кандидаты в хорошие статьи/4 мая 2020: различия между версиями

* Статья напоминает слабый студенческий реферат. Информации даже меньше, чем в книжке десятилетней давности (ISBN 978-5-9963-2401-9) -- можно было бы взять и переписать своими словами, пользы было бы больше. Отсутствует структура изложения, нет иллюстраций. В преамбуле нет краткого описания методов и области применения. Нет истории. Рассуждения про "ключ-замок" не имеют отношения к проблеме. Половина статьи написана не на русском языке ("В этой аналогии партнёры докинга — жёсткие тела, что неверно для молекулярных систем"; "сканирования библиотек различных соединений, как низкомолекулярных, так и комплексных"; "молекулярная поверхность рецептора описывается с точки зрения её доступности площади поверхности"). Постановка задачи не сформулирована. В раздел "сфера применения" навалены случайные факты, не связанные друг с другом. Раздел "подходы к моделированию" не соответствует реальности и не содержит даже самых распространённых методов (обратный образ сайта связывания, сборка лиганда в сайте, генетический алгоритм, жёсткий докинг). Для методов не изложена теория, не приведены блок-схемы алгоритмов. Затем происходит переход к виртуальному скринингу методом докинга, который вообще не имеет отношения к теме статьи: докинг -- это исключительно метод генерации способов связывания лиганда с рецептором и выбора оптимального среди них; возможность применения этого метода as is для виртуального скрининга является полезной плюшкой, но далеко не все методы докинга вообще стоит применять для виртуального скрининга. В статье регулярно употребляются жаргонизмы типа "симуляция", "стыковка", "поза", машинный перевод "цель" (на самом деле "мишень"). Оценочные функции, играющие ключевую роль в докинге, рассмотрены одним мини-абзацем, в котором упоминается только один тип из нескольких регулярно применяемых (эмпирические, статистические, на силовых полях, нейросетевые, мишень-специфичные и т.д.). Список программ приведён [[ВП:НЕКАТАЛОГ|без каких-либо пояснений]] -- должны быть указаны как минимум алгоритм докинга, доступные оценочные функции, время выода первой версии, статья с описанием программы, разработчик, лицензия. Раздел про оценку алгоритмов вообще не имеет смысла -- фактор обогащения является метрикой успешности виртуального скрининга, но про другие метрики из примерно десятка базовых ни слова; словосочетание "сопоставительный анализ" [[ВП:ОРИСС|не используется]], методы не описываются. В общем, статья крайне сырая. {{против|Отказать.}} [[U:Starless|Bible Black]] 21:11, 17 мая 2020 (UTC)

* Статья была скорректирована и доработана в т.ч. постановка задачи, подходы к моделированию. Жаргонизмы исправлены, часть терминов принятых к употреблению (симуляция и поза) оставлены. Программы потенциально можно просто удалить, в связи с их огромным количеством и постоянным изобретением новых, вряд-ли это необходимо в контексте статьи. {{unsigned2| 18:30, 20 мая 2020‎| Evel147 }}

 

=== Комментарии ===