С 2017 года Бэджли женат на певице Домино Кёрк<ref>{{Cite news|title=Gossip Girl's Penn Badgley Marries Domino Kirke|author=King, Brittany|url=https://people.com/celebrity/gossip-girl-penn-badgley-married-domino-kirke/|website=[[People]]|date=2017-02-27|lang=en}}</ref>. 11 августа 2020 родился ребёнок.сын <ref>{{Cite web|url=http://www.spletnik.ru/buzz/baby/98528-penn-bedzhli-i-domino-kerk-stali-roditelyami-posle-dvukh-vykidyshey.html|title=Пенн Бэджли и его жена Домино Керк стали родителями после двух перенесенных выкидышей|website=www.spletnik.ru|accessdate=2020-09-21}}</ref><ref>{{Cite web|lang=uk|url=https://yandex.ua/news/story/Penn_Behdzhli_stal_otcom_zhena_zvezdy_seriala_Spletnica_podtverdila_rozhdenie_rebenka--7539e50a5f9d86a1abda8cae18103d23?from=newswizard&lang=ru&persistent_id=113020706&rubric=showbusiness&wizard=story|title=Пенн Бэджли стал отцом: жена звезды сериала «Сплетница» подтвердила рождение ребенка|website=Яндекс.Новости|date=2020-09-21|accessdate=2020-09-21}}</ref>
