Святой Исаак был одним из плодовитейших писателей. По свидетельству сирскогосириского писателя начала XIV века Эбед-Иезу, «св. Исаак Ниневийский составил семь томов о водительстве Духа, о Божественных тайнах, о судах и о благочинии (politia)». Даниил Тубанита, епископ Беф-Гармэ, по свидетельству того же Эбед-Иезу, «написал разрешение вопросов божественного пятого тома св. Исаака Ниневийского». Что это за «томы», о которых говорит Эбед-Иезу, неизвестно, и, по-видимому, они не все до нас дошли. В [[1909 год]]у в первый раз вышел в свет печатный сирский текст сочинений святого Исаака под заглавием: «''Mar Isaacus Ninivita de perfectione religiosa, quam edidit P. Bedjan''». Здесь, судя по заглавию, помещено 107 слов, или глав, но издатель говорит, что это только «первая часть сочинения св. Исаака», что он мог бы издать и 2-й и 3-й тома этого сочинения, если бы только мог сверить имеющиеся у него манускрипты с другими параллельными. И издатель очень жалеет, что не может этого сделать и издать эти новые тома, жалеет потому, что там «много прекрасных страниц».
