Однонуклеотидный полиморфизм: различия между версиями

'''Однонуклеотидный полиморфизм''' (ОНП, {{lang-en|Single Nucleotide Polymorphism, SNP}}, произносится как ''снип'') — отличия последовательности [[ДНК]] размером в один [[нуклеотид]] (A, T, G или C) в [[геном]]е (или в другой сравниваемой последовательности) представителей одного вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом. Применяется в качестве [[ДНК-маркер|генетических маркеровма́ркеров]] для изучения [[Неравновесное сцепление генов|неравновесного сцепления]] [[локус]]ов и [[Полногеномный поиск ассоциаций|полногеномного поиска ассоциаций]] ({{lang-en2|GWAS}}).

Однонуклеотидный полиморфизм (наряду с [[Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов|полиморфизмом длин рестрикционных фрагментов]] ({{lang-en2|RFLP}}) и [[ДНК-маркер|ПДАФ]] ({{lang-en2|AFLP}})) широко используют в качестве [[Молекулярная генетика|молекулярно-генетических]] меток (ма́ркеровмаркеров), например, для построения [[Кладограмма|кладограмм]] [[Молекулярная генетика|молекулярно-генетической]] [[Биологическая систематика|систематики]] на основе дивергенции (расхождения) гомологичных участков ДНК в [[филогенез]]е. В данной области наиболее часто используются спейсеры генов[[ген]]ов [[рРНК|рибосомальной РНК]]. Ввиду того, что мутации в данных спейсерах не сказываются на структуре конечных продуктов гена (теоретически они не влияют на жизнеспособность), в первом приближении постулируется прямая зависимость между степенью полиморфизма и филогенетическим расстоянием между организмами.

Единой номенклатуры для ''SNPs'' нет: часто существуют несколько различных вариантов названия для одного конкретно выбранного ''SNP'', к какому-то согласию в этом вопросе прийти пока не удается. Один из подходов — писать SNPs с префиксом, точкой и знаком «больше чем», показывающим нуклеотид или [[Аминокислоты|аминокислоту]] дикого типа и измененную (например, ''c.76A>T'')<ref>{{статья|заглавие=Recommendations for the description of sequence variants|издание=Human Genome Variation Society|язык=en|тип=journal|автор=Den Dunnen J. T.|год=2008}}</ref>.

Однонуклеотидный полиморфизм встречается в пределах кодирующих последовательностей [[ген]]овгенов, в некодирующих участках или в участках между генами. ''SNPs'', встречающиеся в кодирующих участках, могут не менять [[Аминокислоты|аминокислотную]] последовательность белка из-за вырожденности [[Генетический код|генетического кода]].