25 июля 1932 судно вышло из [[Киль (город)|Киля]] в учебное плавание по БалтийскмуБалтийскому морю. Первую остановку шхуна совершила в городе [[Варнемюнде]], где встала на стоянку на ночь. Утром «Ниобе» снялась с якоря. В 13:00 шхуна миновала [[плавучий маяк]] Ферман-Бельт, с которым велись переговоры посредством [[Семафорная азбука|флажковых сигналов]]. В юго-западном направлении [[Марс (мореплавание)|марсовые]] заметили грозовые облака. Командир судна [[капитан-лейтенант]] Генрих Руфус приказал убрать верхние паруса и зарифить остальные.
В 14:27 с юга неожиданно налетел сильный грозовой [[шквал]] с силой ветра [[Шкала Бофорта|до 7 баловбаллов]], позже изменив направление на юго-западное. Одновременно с этим, большая приливная волна накренила парусник примерно на 40 — 50 градусов, что привело в итоге к его опрокидыванию. С маяка к судну немедленно отправилась шлюпка под руководством [[Смотритель маяка|смотрителя]], кроме того на помощь направился проходивший поблизости пароход «Тереза Русс». Позже к месту трагедии прибыли другие корабли и суда: крейсеракрейсеры [[Köln (1928)|«Кёльн»]] и [[Königsberg (1927)|«Кёнигсберг»]] и другие. Вся спасательная операция продолжалась 30 минут, спасено было 40 моряков, в том числе и капитан — лейтенанткапитан—лейтенант Руфус. Число погибших в общем составило 69 человек (3 офицера, корабельный врач, казначей, 10 кандидатов в офицеры, 8 унтер-офицеров, 36 кандидатов в унтер-офицеры, 9 матросов и кок)<ref>Морская кампания № 2, 2008</ref>.
Как впоследствии удалось установить, [[Иллюминатор|иллюминаторы]] нижних [[Дек|деков]] парусника по неосмотрительности вахтенных офицеров были открыты, в результате чего вода быстро заполнила помещения левого борта<ref>[http://www.zeit.de/1952/30/der-untergang-der-niobe ZEIT-online: Der Untergang der ''Niobe'', 24. Juli 1952], Abgerufen am 11. September 2015</ref> . Первый помощник попытался повернуть судно по ветру, но оно быстро накренилось и опрокинулось в течение трех минут<ref name="К"/>.
