Рибосома: различия между версиями

4 байта убрано ,  11 лет назад
Ссылка не на ту транслокацию
м (робот добавил: bn:রাইবোজোম)
(Ссылка не на ту транслокацию)
После ассоциации, fMET-[[тРНК]] оказывается в P (peptidyl-) центре рибосомы. Следующая тРНК, несущая на 3'-конце аминокислоту, и комплементарная второму [[кодон]]у на [[мРНК]], связывается с помощью фактора [[EF-Tu]] на А (аминоацил-) центре рибосомы. Затем, на большой субъединице, в пептидил-трансферазном центре рибосомы, образуется пептидная связь между формилметионином (связанным с тРНК, находящейся в Р-центре) и аминокислотой, находящейся в А-центре. По поводу деталей механизма катализа образования пептидной связи в пептидил-трансферазном центре консенсус до сих пор не достигнут. На данный момент существует несколько гипотез механизма катализа рибосомой: 1. оптимальное позиционирование субстратов (induced fit)<ref> Sievers A, Beringer M, Rodnina MV, Wolfenden R. The ribosome as an entropy trap. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 May 25;101(21):7897-901.</ref>, 2. исключение из активного центра воды, способной прервать образование пептидной цепи посредством гидролиза <ref>T.M. Schmeing, K.S. Huang, S.A. Strobel and T.A. Steitz, An induced-fit mechanism to promote peptide bond formation and exclude hydrolysis of peptidyl-tRNA. Nature 438 (2005), pp. 520—524.</ref>, 3. участие нуклеотидов [[рРНК]] (таких как А2450 и А2451) в переносе протона<ref>A.E. Hesslein, V.I. Katunin, M. Beringer, A.B. Kosek, M.V. Rodnina and S.A. Strobel, Exploration of the conserved A+C wobble pair within the ribosomal peptidyl transferase center using affinity purified mutant ribosomes, Nucleic Acids Res. 32 (2004), pp. 3760-3770.</ref><ref>P. Nissen, J. Hansen, N. Ban, P.B. Moore and T.A. Steitz, The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis, Science 289 (2000), pp. 920—930.</ref>, 4. участие 2'-гидроксильной группы 3'-концевого нуклеотида [[тРНК]] (А76) в переносе протона <ref>T.M. Schmeing, K.S. Huang, D.E. Kitchen, S.A. Strobel and T.A. Steitz, Structural insights into the roles of water and the 2′ hydroxyl of the P site tRNA in the peptidyl transferase reaction, Mol. Cell 20 (2005), pp. 437—448</ref>; а также комбинации этих механизмов.
 
После образования пептидной связи, полипептид оказывается связанным с тРНК, находящейся в А-центре. Следующим шагом является движение деацилированной тРНК из Р- в Е (exit-) центр, а пептидил-тРНК из А- в Р-центр. Этот процесс называется [[транслокация]] и происходит с помощью фактора [[EF-G]].
[[тРНК]], комплементарная следующему [[кодон]]у [[мРНК]], связывается с А-центром рибосомы, что ведет к повторению описанных шагов. Стоп-[[кодон]]ы (UGA, UAG и UAA) сигнализируют об окончании трансляции. Обрыв полипептидной цепи и диссоциация субъединиц (для приготовления к связыванию следующей мРНК и синтезу соответствующего белка) происходит при участии факторов (RF1, RF2, RF3, RRF в прокариотах).