По состоянию на 2011 год станция служит конечной для дневных и ночных пассажирских поездов сообщением Батуми — Тбилиси и Тбилиси — Батуми, во время курортного сезона она также является конечным пунктом следования поезда Ереван — Батуми. Так как на станции всего двое путей, то пассажирские вагоны отстаиваются на станции Чакви либо Батуми-Сортировочная.
Из пригородных поездов на станции останавливаются электропоезда сообщением Батуми — Кутаиси и Кутаиси — Батуми, а также Батуми — Озургети и Озургети — Батуми. Электропоезда отставиваютсяотстаиваются в депо Батуми, которое находится на территории станции Батуми-Сортировочная.
В мае 2010 года на станции Махинждаури была проведена презентация нового проекта "«Скоростная железная дорога - — из Тбилиси в Батуми за 3 часа"». На территории станции были заменены пути на более современные, позволяющие поездам развивать максимальную скорость до 120 км/ч. Также общественности были представлены новые электропоезда ВМК производства АО "«Вагоностроительная компания"». На презентации пристутствовалиприсутствовали генеральный директор Грузинской железной дороги Ираклий Эзугбая и президент Грузии Михаил Саакашвили.
=== Возможный перенос вокзала в Батуми ===
Из-за постоянного роста пассажироперевозок станции Махинджаури становится все сложнее осблуживатьобслуживать пассажиров и обеспечивать им комфортные условия. Ранее проблемы ограничивались лишь наплывом отдыхающих во время курортного сезона, но в последние пару лет проблемы носят круглогодичный характер. Здание вокзала уже не может вместить все растущее количество пассажиров, что создает огромные неудобства, особенно при дожде, частом в этих местах. Кроме того, пгт Махинджаури находится в 6 км от города [[Батуми]] и до него неудобно добираться ранним утром, когда отправляются многие поезда. Еще в 2002 году было начато строительство новой станции Батуми-Пассажирская с большим количеством путей и вокзалом пропускной способностью 3000 человек в час, но после [[Аджарский кризис (2004)|аджарского кризиса 2003—2004]] годов работы были остановлены. Ныне завршениезавершение строительства нового вокзала могло бы решить все проблемы, но на данный момент неизвестно, будет ли достроен новый вокзал.
