Модельные организмы: различия между версиями

[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
м →‎Растения: пунктуация и уточнение
Нет описания правки
Строка 17:
== Важные модельные организмы и области их использования ==
{{main|Список модельных объектов (биология)}}
 
=== [[Вирусы]] ===
* [[Фаг лямбда]] — [[молекулярная генетика]]
Строка 27 ⟶ 28 :
* ''[[Bacillus subtilis]]'' — грамположительная бактерия, молекулярная генетика, изучение [[споруляция|споруляции]], работы [[жгутик]]ов.
* ''[[Mycoplasma genitalium]]'' — «минимальный организм», имеет один из самых маленьких геномов среди всех клеточных организмов; в [[2007 год]]у близкий вид использован [[Вентер, Крейг|Крейгом Вентером]] для пересадки генома, в результате которой один вид бактерий был превращён в другой [http://elementy.ru/news/430553].
* ''[[Salmonella typhimurium]]''  — грамотрицательная бактерия, [[патогенность|патогенная]] для мышей и других мелких грызунов, условно патогенна для человека, используется в исследовании [[мутаген]]ного и [[канцероген]]ного эффекта различных химических веществ в [[тест Эймса|тесте Эймса]].
 
=== [[Протисты]] ===
 
* [[Хламидомонада]] ''[[Chlamydomonas reinhardtii]]'' — одноклеточная зелёная водоросль, изучение [[фотосинтез]]а, работы эукариотического [[жгутик]]а, клеточной подвижности, регуляция [[метаболизм]]а, [[клеточная адгезия]] («склеивание» гамет при половом размножении) и др. Хорошо изучена генетически <ref>[http://genome.jgi-psf.org/chlamy Chlamydomonas reinhardtii resources at the Joint Genome Institute]</ref> Геном секвенирован в 2007  г.<ref>[http://www.jgi.doe.gov/News/news_10_11_07.html Chlamydomonas genome sequenced] published in Science, [[October 12]], [[2007]]</ref>
* ''[[Dictyostelium discoideum]]'' — молекулярная биология и генетика (его геном секвенирован), эмбриология ([[межклеточная коммуникация]], [[клеточная дифференцировка]], [[апоптоз]]).
* ''[[Tetrahymena thermophila]]'' — пресноводная [[инфузория]]; молекулярная генетика (геном секвенирован).
Строка 46 ⟶ 47 :
[[Файл:Arabidopsis thaliana.jpg|thumb|Резуховидка Таля ''[[Arabidopsis thaliana]]'']]
 
* [[Мхи|Зеленый мох]] ''[[Physcomitrella patens]]''  — всё более широко используется в исследованиях развития и эволюционной биологии растений <ref name=Rensing>{{cite journal |author=Rensing SA, Lang D, Zimmer AD, ''et al.'' |title=The Physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants |journal=Science |volume=319 |issue=5859 |pages=64–9 |year=2008 |month=Jan |pmid=18079367 |doi=10.1126/science.1150646 |url=http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/319/5859/64}}</ref> Пока это единственный представитель мохообразных, чей геном полностью секвенирован; разработана методика генетической трансформации для данного вида
* [[Плауновидные|плауновидное]] [[плаунок]] ''[[Selaginella moellendorffii]]''  — эволюция растений, молекулярная биология; геном (один из самых коротких среди высших растений, около 100 мегабаз) секвенирован в 2007 году<ref>{{citation|title=Selaginella moellendorffii v1.0| year=2007| publisher=DOE Joint Genomics Institute| url=http://genome.jgi-psf.org/Selmo1/Selmo1.home.html| accessdate= 2011-05-17}}</ref>.
* [[Резуховидка Таля]] ''[[Arabidopsis thaliana]]'', наиболее популярное модельное растение, используемое во многих областях; однолетнее крестоцветное-[[эфемеры|эфемер]], имеющее крайне короткий жизненный цикл и небольшой размер генома (первое из растений, чей геном секвенирован) <ref name=TAIR>[http://www.arabidopsis.org/portals/education/aboutarabidopsis.jsp#hist About Arabidopsis on The Arabidopsis Information Resource page ([[TAIR]])]</ref> Закартировано и изучено множество морфологических и биохимических мутаций <ref name="TAIR"/> Генетическая база данных, содержащая и большое количество другой информации об этом виде — [[TAIR]]<ref name=TAIR/><br />''
* Виды рода [[тополь]] (''[[Populus]]'')  — модельные виды для изучения генетики и культивирования древесных растений. Имеют небольшой размер генома и быстрый рост, разработана методика трансформации. Полностью секвенирован геном североамериканского вида ''[[Populus trichocarpa]]''
* [[Люцерна]] ''[[Medicago truncatula]]''  — модельное бобовое, близкий родственник [[люцерна посевная|люцерны посевной (''Medicago sativa'')]] (молекулярная биология, агрономия)
* [[Кукуруза]] (''Zea mays'' L.) — одна из основных зерновых культур и классический генетический модельный организм; у этого диплоидного [[однодольные растения|однодольного]] растения 10 пар крупных хромосом, которые легко изучать под микроскопом, что облегчает цитогенетические исследования; известно большое число [[фенотип]]ически выраженных мутаций, гены которых закартированы (именно благодаря этому при изучении кукурузы были открыты [[транспозоны]]), и большое число потомков от каждого скрещивания (генетика, молекулярная биология, агрономия)именно у кукурузы было впервые обнаружено явление [[Цитоплазматическая мужская стерильность|цитоплазматической мужской стерильности]]. [[Геном]] кукурузы отсеквенирован практически полностью, существует специальная база данных<ref>[http://www.maizegdb.org/ MaizeGDB.org база данных изучения генома кукурузы]</ref>, посвящённая генетическим и молекулярнобиологическим исследованиям генома кукурузы.
* [[Рис]] ''(Oryza sativa)'' — одна из важнейших зерновых культур; имеет один из самых маленьких геномов среди зерновых злаков, который полностью секвенирован (агрономия, молекулярная биология)
* [[Allium test|Allium cepa]] (лук посевной) - — модельный организм в [[Хромосомные перестройки|генотоксикологических]] исследованиях. Имеет хорошо изученный геном (2n=16) и поэтому подходит для [[Ана-телофазный метод анализа хромосомных аберраций|ана-телофазного анализа]]. Результаты тестов с ''[[Allium test|A. cepa]]'' имеют корреляцию с другими тестами на животных, растительных и микроорганизмах, а также могут быть экстраполированы на человека.
[[Файл:Physcomitrella Sporophyt.JPG|thumb|''[[Physcomitrella patens]]'']]
 
=== [[Животные]] ===
 
==== [[Беспозвоночные]] ====
[[Файл:Caenorhabditis elegans.jpg|thumb|Круглый червь ''[[Caenorhabditis elegans]]'']]
 
* ''[[Nematostella vectensis]]'', нематостелла  — литоральная роющая [[актиния]] из семейства едвардсиид (Edwardsiidae), в последние годы ставшая главным модельным объектом для изучения молекулярной биологии и биологии развития [[книдарии|книдарий]]. В 2007 г геном нематостеллы был полностью секвенирован <ref>{{cite journal | title=Sea anemone genome reveals ancestral eumetazoan gene repertoire and genomic organization| author=Putnam NH, Srivastava M, Hellsten U, Dirks B, Chapman J ''et al.''| journal=Science| year=2007| volume=317| pages=86–94| pmid=17615350}}</ref>
* ''[[Symsagittifera roscoffensis]]'' (syn. ''Convoluta roscoffensis''), представитель примитивной группы «бескишечных турбеллярий» (ныне тип [[Acoelomorpha]])  — изучение эволюции плана строения двустороннесимметричных животных
* [[Триклады|Триклада]] ''[[Schmidtea mediterranea]]''  — биология развития, регенерация [http://elementy.ru/news?newsid=431577]; геном частично секвенирован [http://smedgd.neuro.utah.edu/]
* [[Нематоды|Нематода]] ''[[Caenorhabditis elegans]]'' (''C. elegans'')<ref>{{cite book |author=Riddle, Donald L. |title=C. elegans II |publisher=Cold Spring Harbor Laboratory Press |location=Plainview, N.Y |year=1997 |isbn=0-87969-532-3 |url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=ce2.TOC |format=Full text}}</ref> — генетический контроль развития и физиологических процессов (первый многоклеточный организм, чей геном был полностью секвенирован; в настоящее время секвенирован геном второго вида из этого рода, ''C. briggsae'')
* [[Дрозофилы]] (род ''[[Drosophila]]''), в частности, вид ''[[Drosophila melanogaster]]'' — плодовая мушка, знаменитый объект генетических исследований. Легко содержится и разводится в лаборатории, имеет быструю смену поколений и множество мутаций с различным фенотипическим выражением. Во второй половине XX века один из основных объектов биологии развития. Геном полностью секвенирован. Недавно стала использоваться для нейрофармакологических исследований <ref>{{cite journal |author=Manev H, Dimitrijevic N, Dzitoyeva S. |journal=Trends Pharmacol Sci. |title=Techniques: fruit flies as models for neuropharmacological research. |volume=24 |issue=1 |pages=41–3 |year=2003 |url=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0165614702000044 |doi=10.1016/S0165-6147(02)00004-4 <!--Retrieved from CrossRef by DOI bot-->}}</ref>.
Строка 68 ⟶ 70 :
* [[Кальмар]] ''[[Loligo pealei]]'', классический объект для изучения работы нервных клеток и их цитоскелета (имеет [[гигантские аксоны]] диаметром до 1 мм)
* [[Морские ежи]] ''[[Arbacia punctulata]]'' и ''[[Strongylocentrotus purpuratus]]'', классические объекты эмбриологии
* [[Асцидии|Асцидия]] ''[[Ciona intestinalis]]''  — эмбриология, эволюция генома хордовых
 
==== [[Позвоночные]] ====
[[Файл:Lightmatter lab mice.jpg|thumb|Лабораторные мыши]]
* [[Фугу (рыбы)|Фугу]] (''[[Takifugu rubripes]]'')  — рыба из семейства ''[[Tetraodontidae]]''  — имеет компактный геном с небольшим количеством некодирующих последовательностей. Геном секвенирован.
* [[Данио рерио|Полосатый данио]] (''Danio rerio''), почти прозрачная на ранних стадиях развития пресноводная рыбка; важный объект биологии развития, водной токсикологии и токсикопаталогии <ref>{{cite journal |author=Spitsbergen JM, Kent ML |title=The state of the art of the zebrafish model for toxicology and toxicologic pathology research—advantages and current limitations |journal=Toxicol Pathol |volume=31 |issue=Suppl |pages=62–87 |year=2003 |pmid=12597434 |pmc=1909756 |url=http://tpx.sagepub.com/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=12597434 |doi=10.1080/01926230390174959}}</ref>. Геном секвенирован.
* [[Гладкая шпорцевая лягушка|Африканская шпорцевая лягушка]] (''[[Xenopus laevis]]'')  — один из основных объектов биологии развития; ооциты используются также для изучения экспрессии генов. Геном секвенирован.
* [[Курица]] (''Gallus gallus domesticus'') — модельный объект эмбриологии [[амниоты|амниот]], используется с древнейших времен до наших дней, на цыплятах изучают механизмы памяти и обучения.
* [[Зебровая амадина]] (''Taeniopygia guttata'')  — разновидность ткачиков, объект исследования генетики поведения, механизмов обучения.
* [[Домовая мышь]] (''Mus musculus'')  — главный модельный объект среди млекопитающих. Получено множество [[инбридинг|инбредных]] [[чистые линии|чистых линий]], в том числе отобранных по признакам, представляющим интерес для медицины. этологии и др. (склонность к тучности. повышенный и пониженный интеллект, склонность к потреблению алкоголя, различная продолжительность жизни и  т.  п.). Геном полностью секвенирован. Разработаны методы получения [[трансгенные животные|трансгенных мышей]] с использованием стволовых клеток. Дополнительный интерес представляет как объект для изучения популяционной генетики и процессов видообразования, так как имеет сложную внутривидовую структуру (множество подвидов, различающиеся по [[кариотип]]у [[хромосомные расы]]).
* [[Серая крыса]] (''[[Rattus norvegicus]]'')  — важная модель для токсикологии, нейробиологии и физиологии; используется также, наряду с мышью, в молекулярной генетике и геномике. Геном полностью секвенирован.
* [[Кошка домашняя]] (''Felis domesticus'')  — используется в исследованиях физиологии мозга, дешевле в содержании по сравнению с [[Обезьяны|обезьянами]].
* [[Макак-резус]] (''Macaca mulatta'')  — медицинские исследования (в том числе изучение инфекционных болезней), этология, нейробиология
* [[Шимпанзе]] (два вида, [[шимпанзе обыкновенный]] (''Pan troglodytes'') и [[шимпанзе карликовый]] (''Pan paniscus'')  — ближайшие родственники человека среди ныне живущих видов. Сейчас используется в основном для изучения сложных форм поведения и познавательной деятельности животных. Геном ''Pan troglodytes'' секвенирован.
* [[Человек разумный]] ''(Homo sapiens)'' — геном полностью секвенирован. Клинические исследования, эволюционная биология, физиология, нейробиология и др. Наиболее полный список известных наследственных болезней. Важность для нейрофизиологических исследований определяется способностью сообщать о своих ощущениях и выполнять инструкции экспериментатора.
 
== Другие модельные организмы ==
Строка 89 ⟶ 91 :
 
== Другие модельные объекты в биологии ==
Кроме организмов, модельными объектами могут служит и биологические системы других уровней организации  — молекулы, клетки и их части (например, гигантский аксон кальмара), клеточные линии (например, линия клеток человека HeLa), органы (например, упомянутый в списке беспозвоночных стоматогастрический ганглий десятиногих раков), популяции и экосистемы.
 
== Примечания ==
{{примечания}}
 
== Ссылки ==
* [http://gmod.org/wiki/Main_Page] GMOD, Genetic Model Organism Database  — Базы данных о модельных объектах генетики.
<references/>
== Внешние ссылки ==
[http://gmod.org/wiki/Main_Page] GMOD, Genetic Model Organism Database — Базы данных о модельных объектах генетики.
 
{{Модельные организмы}}