Протеом: различия между версиями

6434 байта добавлено ,  7 лет назад
Нет описания правки
м (r2.7.3) (робот добавил: sr:Proteom)
Протеом — термин для обозначения всей совокупности [[белок|белков]] (протеинов) организма, производимых клеткой, тканью или организмом в определённый период времени. Или, более строго, это совокупность [[экспрессия|экспрессированных]] протеинов в данном типе [[клетка (биология)|клеток]] или в организме, в данный период времени при данных условиях. Термин произошёл путём [[словослияние|слияния слов]] "протеин" и "[[геном]]".
'''Протеом''' — термин для обозначения совокупности [[белки|белков]] (протеинов) организма.
 
Термин применялся к нескольким разным типам биологических систем. ''Клеточный протеом'' - коллекция белков, найденных в определённой клетке при определённых внешних условиях, как например действие заданных [[гормон]]ов. ''Полный протеом'' организма - полный набор белков всех его клеточных протеомов. Огрубляя, можно сказать, что он является белковым эквивалентом генома. Термином "протеом" также обозначался набор белков субклеточного организма, например [[вирус]]а (виральный протеом).
Термин был предложен в [[1994 год]]у австралийским исследователем [[Марк Уилкинс|Марком Уилкинсом]].
 
Протеом, особенно у [[эукариота|эукариот]], больше, чем геном, то есть количество белков превышает количество [[ген]]ов. Это связано с [[альтернативный сплайсинг|альтернативным сплайсингом]], а также с [[посттрансляционная модификация|посттрансляционной модификацией]] белков, например, их [[гликозилирование]]м (присоединением к ним остатков [[углеводов]]) и [[фосфорилирование]]м (присоединением к ним остатка [[фосфорная кислота|фосфорной кислоты]]).
Исследование протеома — крупный международный научный проект. В [[2001 год]]у для работы над ним была создана международная [[Организация протеома человека]] ([[Human Proteome Organization]]/[[HUPO]]). Особое внимание участников проекта вызывают белки крови, печени и головного мозга.
 
Протеом имеет по крайней мере два уровня сложности, отсутствующих в геноме. В то время как геном определяется последовательностью [[нуклеотид]]ов, протеом не сводится к сумме последовательностей [[аминокислота|аминокислот]]. Знание протеома включает в себя также знание пространственных структур всех содержащихся в нём белков (см. [[вторичная структура#вторичная структура белка|]], [[третичная структура#третичная структура белков|]]) и функционального взаимодействия между ними.
{{mol_bio-stub}}
 
[[Протеомика]], наука о протеомах, развивалась в значительной степени путём разделения белков методом двумерного [[электрофорез белков|электрофореза]]. Первое измерение - разделение белков на основе их электрического заряда методом [[изоэлектрическое фокусирование|изоэлектрического фокусирования]]. Второе измерение - разделение белков на основе их молекулярного веса методом [[:en:SDS-PAGE]].
{{rq|sources|stub|img}}
 
Дополнительную информацию о белках даёт [[масс-спектрометрия]]. [[:en:Peptide mass fingerprinting|Отпечатки пептидных масс]] - метод, позволяющий идентифицировать белок путём разделения его на короткие [[пептид]]ы и сравнения наблдаемых пептидных масс с [[:en:sequence database|базой данных последовательностей]]. Другой способ идентифицировать белок - [[:en:Tandem mass spectrometry|тандемная масс-спектрометрия]] (см. [[Масс-спектрометрия#масс-анализатор|]]), при которой индивидуальные пептиды изолируются, соударяются с [[молекула]]ми [[инертный газ|инертного газа]], а затем получившиеся [[ион]]ы фрагментов каталогизируются.
[[Категория:Белки]]
 
== История==
 
Термин "протеом" предложил в 1994 году [[Австралия|австралийский]] генетик [[Уилкинс, Марк|Марк Уилкинс]] <ref>{{cite journal
|last=Wilkins
|first=Marc
|authorlink=
|year=2009|month=Dec.
|title=Proteomics data mining
|journal=[[Expert review of proteomics]]
|volume=6
|issue=6
|pages=599–603
|publisher= |location = [[England]]| pmid = 19929606
|doi = 10.1586/epr.09.81
| bibcode = | oclc =| id = | url = | language = | format = | accessdate = | laysummary = | laysource = | laydate = | quote =
}}</ref> на симпозиуме 2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" в городе [[Сиена]], [[Италия]]. В печать термин появился в 1995 <ref>{{cite journal| author=Wasinger VC, Cordwell SJ, Cerpa-Poljak A, Yan JX, Gooley AA, Wilkins MR, Duncan MW, Harris R, Williams KL, Humphery-Smith I.| journal=Electrophoresis| year=1995| title= Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium| pmid = 7498152| volume=7| pages=1090–94| issue=7| doi=10.1002/elps.11501601185}}</ref> в публикации части Ph.D. тезиса Уилкинса.
 
Исследование протеома  — крупный международный научный проект. В [[2001 год]]угоду для работы над ним была создана международная [[Организация протеома человека]] ([[Human Proteome Organization]]/[[HUPO]]). Особое внимание участников проекта вызывают белки крови, печени и головного мозга.
 
== См. также ==
* [[Протеомика]]
* [[:en:Metabolome]]
* [[:еn:Cytome]]
* [[Биоинформатика]]
* [[:en:List of omics topics in biology]]
* [[:en:Plant Proteome Database]]
* [[Транскриптом]]
 
==Ссылки==
{{Reflist}}
 
== Внешние ссылки ==
* [http://bioinformatics.oupjournals.org/ Bioinformatics Journal]
* Базы данных: PIR | Swissprot | Pfam
 
[[Категория:биоинформатика]]
[[Категория:Белкибелок]]
 
[[zh-min-nan:Nn̄g-pe̍h-thé]]
[[cs:Proteom]]
[[de:Proteom]]
[[en:Proteome]]
[[eo:Proteinaro]]
[[es:Proteoma]]
[[eo:Proteinaro]]
[[fa:پروتئوم]]
[[fr:Protéome]]
[[heko:פרוטאום단백체]]
[[is:Prótínmengi]]
[[it:Proteoma]]
[[he:פרוטאום]]
[[ja:プロテオーム]]
[[ko:단백체]]
[[nl:Proteoom]]
[[ja:プロテオーム]]
[[pl:Proteom]]
[[pt:Proteoma]]
[[en:Proteome]]
[[sr:Proteom]]
[[sv:Proteom]]
[[uk:Протеом]]
[[zh:蛋白质组]]
[[zh-min-nan:Nn̄g-pe̍h-thé]]