Основными способами определения экспрессиэкспрессии генов в данное время являются [[секвенирование РНК]], содержащих поли-А ([[мРНК]]), а также применение экспрессионных [[ДНК-микрочип]]ов. Секвенирование РНК становится все более распространенным методом в связи с усовершенствованием [[Методы секвенирования нового поколения|методов секвенирования нового поколения]]. Секвенирование РНК не только позволяет определить уровень экспрессии каждого белоккодирующего гена в геноме, но и различать варианты мРНК, получающиеся в результате [[Альтернативный сплайсинг|альтернативного сплайсинга]].
