Суперсемейство белков: различия между версиями

[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 15:
=== Структурная гомологичность ===
 
[[Вторичная структура|Вторичная]] и [[третичная структура|третичная]] структуры белков, непосредственно влияющие на их функциональность (например, способность [[рецептор]]а распознавать [[лиганд]]ы — [[Антагонист (биохимия)|агонист]]ы и [[Антагонист (биохимия)|антагонист]]ы, или способность [[фермент]]а [[катализ]]ировать определённые [[химическая реакция|химические реакции]] — гораздо более [[эволюция|эволюционно]] [[консервативные последовательности|консервативна]], чем аминокислотная последовательность. Примером этого является суперсемейство PA протеаз. В нём очень немногие аминокислотные остатки белков проявляют значительную степень эволюционной консервативности, в то время как характерные элементы вторичной структуры, равно как и их пространственное упорядочение в третичных структурах, весьма высоко консервативно.
 
Программы структурного упорядочения и выравнивания, такие, как программа DALI, могут использовать трёхмерные вторичные и третичные структуры интересующих исследователя белков с имеющейся в них базой данных белковых структур с целью найти белки со сходным [[фолдинг белков|фолдингом]]. Сравнение трёхмерных вторичных и третичных структур белков в состоянии идентифицировать множество случаев эволюционно связанных (имеющих общего эволюционного предка) белков, сходство которых не было бы выявлено при простом анализе и сравнении их первичных структур (аминокислотных последовательностей).