15 ноября 1879 года в [[Хвалынск]]е хиротонисан во епископа [[Самарская и Саратовская епархия|Самарского и Симбирского]]. Хиротонию возглавилсовершил архиепископ Измаильский Виссарион в сослужении других архиереев<ref>А. Ю. Писаревский {{Google books|R24RAQAAIAAJ|Старообрядческие иерархи: справочные материалы|выделить="Алексий (Середкин)"|страница=10|коммент=2002}}</ref>.
Хиротония состоялась несмотря на то, что московская[[Русская православная старообрядческая церковь|Московская архиепископия]] не почисляла на покой его предшественника епископа [[Амвросий (Гераськов)|Амвросия (Гераськова)]], который, впрочем, ни активностью ни образованностью не отличался. Лишь в [[1885 году год]]у епископ Амвросий официально ушёл на покой, а в 1886 году на Самарскую и Симбирскую кафедру был возведен епископ Алексий.