С января 2014 года член правления Содружества современной христианской культуры «Артос».
1618 декабря<ref>[http://www.colta.ru/news/9631 Уволен заместитель главного редактора Издательства Московской Патриархии]</ref> 2015 года решением главного редактора Издательства Московской патриархии протоиерея Владимира Силовьева во исполнение распоряжения патриарха Кирилла был уволен с должности ответственного редактора «Журнала Московской Патриархии»<ref сname="C" подачи/> патриархаКириллаСогласно утверждению самого Чапнина, патриаршее распоряжение гласило: «Чапнина оставлять в должности ответственного редактора считаю нецелесообразным из-за ''его неподобающих высказываний, назначить исполняющим обязанности Евгения Стрельчика.»<ref name="C">''Анна Голубева''. [http://www.colta.ru/articles/media/9668 «В России прямо на наших глазах умирает журналистика. И светская, и церковная»] "[[Colta.ru]]", 22.12.2015</ref>''. СМИ связывали это с выступлением в Московском центре Карнеги с докладом «Православие в публичном пространстве: война и насилие, герои и святые», где высказал тревогу по поводу будущего церкви, исчезновения в ней "«идеологического многообразия"» и усиления «правого крыла»<ref name="S">''Александр Черных''. [https://slon.ru/posts/61598 Сергей Чапнин: «Запрос на “священную войну” на Украине в РПЦ уже есть»] "[[Slon.ru]]", 22.12.2015</ref><ref name="C"/>. Он отметил, что увольнение произошло по соглашению сторон. «В общей сложности я проработал в Московской Патриархии почти 15 лет – последние 6,5 лет в журнале – и с декабря больше не работаю»<ref>[http://www.pravmir.ru/sergey-chapnin-uvolen-s-dolzhnosti-otvetstvennogo-redaktora-zhurnala-moskovskoy-patriarhii/ Сергей Чапнин уволен с должности ответственного редактора журнала] "Православие и мир"</ref>.
В 2015 году являлся куратором выставки современных иконописцев, также занимался изданием независимого альманаха о современной христианской культуре «Дары<ref name="S"/>».
