Поскольку пероксисомы не содержат собственной ДНК и рибосом, все их белки [[синтез]]ируются в [[Клеточное ядро|ядре]] и должны импортироваться внутрь пероксисом из цитозоля. Некоторые белки пероксисом направляются в них с участием [[C-конец|С-концевого]] сигнала пероксисомального адресования (PTS1). Последовательности PTS1 гораздо короче, чем сигналы импорта других органелл, и часто состоят всего из трёх [[Аминокислоты|аминокислотных]] остатков. Каноническая последовательность PTS1 содержит [[серин]], [[цистеин]] или [[аланин]], после которого идёт остаток основной аминокислоты, а затем [[лейцин]]. Наличие дополнительных аминокислот вне PTS1 может усиливать адресный сигнал, особенно если последовательность PTS1 сильно отличается от канонической. Гораздо реже пероксисомные белки имеют сигнальную последовательность PTS2, которая находится на [[N-конец|N-конце]] белка и имеет большую длину, чем PTS1. PTS2 являются частью более крупного [[пептид]]а, который отщепляется после окончания импорта. Процесс импорта белков в пероксисомы изучен недостаточно, но известно, что в нём задействованы растворимые [[Клеточный рецептор|рецепторы]] в цитозоле, которые узнают сигнальную последовательность, и белки докинга на обращённой к цитозолю стороне пероксисом. Процесс импорта сопровождается [[гидролиз]]ом [[АТФ]], и в нём принимают участие около 23 различных белков, называемых {{нп5|Пероксины|пероксинами|en|Peroxin}}. Белки с PTS1 позиционируются на пероксисомах с участием рецептора Pex5p, а с PTS2 — Pex7p. У [[Млекопитающие|млекопитающих]] адресование белков с PTS2 происходит с участием белка, который представляет собой вариант [[Альтернативный сплайсинг|альтернативного сплайсинга]] Pex5p{{sfn|Кассимерис и др.|2016|с=349}}. Комплекс из 6 разных пероксинов образует мембранный транслокатор{{sfn|Альбертс и др.|2013|с=1110}}.
Процесс импорта белков пероксисом коренным образом отличается от транслокации белков в [[Эндоплазматический ретикулум|ЭПР]], митохондрии и хлоропласты в том отношении, что белки пероксисом импортируются после того, как они приобрели в цитозоле нативную или даже [[олигомер]]ную структуру. В этом отношении транспорт белков в пероксисомы напоминает перенос белков в ядро. При транспорте в ядро и в перокисому рецептор, узнающий сигнальную последовательность, переносится с субстратом через мембрану, потом рецептор отделяется и экспортируется в цитозоль для дальнейшего использования{{sfn|Кассимерис и др.|2016|с=349—350}}.
