BLAST: различия между версиями

[непроверенная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Нет описания правки
викификация
Строка 12:
}}
 
'''BLAST''' ({{lang-en|'''B'''asic '''L'''ocal '''A'''lignment '''S'''earch '''T'''ool}} - — средство поиска основного локального выравнивания) — семейство компьютерных программ, служащих для поиска [[Гомология (биология)|гомологов]] [[белок|белков]] или [[Нуклеиновая кислота|нуклеиновых кислот]], для которых известна первичная структура (последовательность) или её фрагмент. Используя BLAST, исследователь может сравнить имеющуюся у него последовательность с последовательностями из базы данных и найти последовательности предполагаемых гомологов. Является важнейшим инструментом для молекулярных биологов, биоинформатиков, систематиков. Программа BLAST была разработана учёными [[Stephen Altschul]], [[Warren Gish]], [[Webb Miller]], [[Eugene Myers]], и [[David J. Lipman]] в системе [[Национальные институты здравоохранения США|Национальных институтов здравоохранения США]] и была опубликована в журнале ''{{не переведено|:en:Journal of Molecular Biology|Journal of Molecular Biology}}'' в 1990<ref>S. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. Myers, and D. Lipman. Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology, 215(3):403–410403-410, October 5, 1990.</ref>.
 
== Классификация программ серии BLAST ==
 
Семейство программ серии BLAST делится на 5 основных групп:
 
Строка 51 ⟶ 50 :
 
== Принципы работы BLAST ==
 
Все выравнивания принято делить на глобальные (последовательности сравниваются полностью) и локальные (сравниваются только определённые участки последовательностей). Программы серии BLAST производят локальные выравнивания, что связано с наличием в различных белках сходных доменов и паттернов. Кроме этого локальное выравнивание позволяет сравнить иРНК с геномной ДНК. В случае глобального выравнивания обнаруживается меньшее сходство последовательностей, особенно их доменов и паттернов.