Лизоцим: различия между версиями
[непроверенная версия] | [непроверенная версия] |
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Urfind (обсуждение | вклад) Дополнение статьи |
Ytret (обсуждение | вклад) м викификация |
||
Строка 5:
== История ==
В 1909
Значительно позже, в [[1922 год]]у
▲В 1909 году [[Лащенков, Павел Николаевич|Павел Николаевич Лащенков]] (Томск) открыл в курином белке протеолитический фермент, который селективно повреждал клеточные стенки, содержащие [[пептидогликан]]ы.
▲Значительно позже, в [[1922 год]]у — [[Флеминг, Александр|Александр Флеминг]]<ref>{{cite journal|title=On a Remarkable Bacteriolytic Element Found in Tissues and Secretions | author=Alexander Fleming| journal=The Journal of Biological Chemistry | issue=93 | pages=306-317 | date=1922}}</ref> обнаружил в носовой слизи пациента, страдающего от простуды, вещество, которое может уничтожать некоторые бактерии, такие как ''Micrococcus lysodeikticus''. Он назвал это вещество <nowiki>''</nowiki>лизоцим".
После первоначальной эйфории в погоне за антибактериальными веществами, оказалось, что лизоцим имеет малое клиническое значение в качестве антибактериального средства, и после открытия пенициллина интерес к лизоциму угас, пока не был выделен и очищен лизоцим из яичного белка курицы (HEWL).
Строка 14 ⟶ 13 :
Лизоцим стал второй белковой структурой и первой ферментной структурой, которая была получена с помощью рентгеновской кристаллографии, и первым ферментом, который содержит полную последовательность всех двадцати стандартных [[Аминокислоты|аминокислот]]<ref name="Canfield1963">{{cite journal | journal=J Biol Chem | volume=238 | issue=8 | pages=2698–2707 | date=1963 | author=Canfield, RE | title=The Amino Acid Sequence of Egg White Lysozyme | pmid=14063294 | url = http://www.jbc.org/content/238/8/2698.short }}</ref>.
== HEWL
HEWL является одной полипептидной цепью (14,3 кДа), содержащий 129 аминокислотных остатков с четырьмя внутримолекулярных дисульфидных мостиков и изоэлектрической точкой вблизи ≈ 11.3, который легко растворим в водной среде.
В качестве фермента, HEWL катализирует гидролиз B-1,4 гликозидной связи между N-ацетилмурамовой кислотой и N-ацетилглюкозамином в пептидогликане клеточной стенки бактерий. Исторически сложилось так, что этот белок является одним из наиболее изученных белков в области биохимии. В отличие от большинства белков, лизоцим кристаллизуется легко и эти кристаллы имеют хорошие преломляющие свойства. Полная первичная структура HEWL впервые была освещена в 1963<ref>{{Статья|автор=Canfield, R. E.|заглавие=The amino acid sequence of egg white lysozyme|ссылка=|язык=|издание=J. Biol. Chem.|тип=|год=|месяц=|число=|том=238|номер=|страницы=2698–2707|issn=}}</ref> , и чуть позднее в 1965 году была создана трёхмерная структура HEWL. Распутывание трёхмерной структуры HEWL и HEWL-субстратного комплекса проложили путь для понимания специфики лизоцима и механизма его каталитической активности.
Исследования по агрегации HEWL стало важным, когда выяснилось, что точечные мутации в человеческом лизоциме (с которой HEWL имеет 60 % идентичных последовательностей) коррелировали с наследственным системным амилоидозом<ref name=autogenerated1>{{Статья|автор=Pepys, M. B., Hawkins, P. N., Booth, D. R., Vigushin, D. M., Tennent, G. A., Soutar, A. K., et al.|заглавие=Human lysozyme gene mutations cause hereditary systemic amyloidosis.|ссылка=|язык=|издание=Nature|тип=|год=|месяц=|число=|том=362|номер=|страницы=553–557|issn=}}</ref>.
Это заболевание было симптоматическим с отложением амилоидных фибрилл человеческого лизоцима (иногда в килограммовых количествах) в почках, желудочно-кишечном тракте, лимфатических узлах, кровеносных сосудах, селезёнки и печени. Лизоцим, пожалуй, единственный фермент, который образует амилоид в естественных условиях.
== Лизоцим человека ==
Человеческий лизоцим является гликозидазой, которая функционирует в качестве антибактериального средства . Человеческий лизоцим (ЕС 3.2.1.17) содержит 130 остатков, принадлежащих к классу С-типа, и широко распространён в различных тканях и жидкостях организма, в том числе печени, суставных хрящах, крови, слюне, слезной жидкости и молоке<ref>{{Статья|автор=Reitamo, S., Klockars, M., Adinolfi, M., Osserman, E. F.|заглавие=Human lysozyme (origin and distribution in health and disease)|ссылка=|язык=|издание=Ric. Clin. Lab.|тип=|год=|месяц=|число=|том=8|номер=|страницы=211–231|issn=}}</ref>. Он кодируется геном, расположенным на 12 хромосоме, и состоит из 4 экзонов и 3 интронов.<ref>{{Статья|автор=Peters, C. W., Kruse, U., Pollwein, R., Grzeschik, K. H., Sippel, A. E.|заглавие=The human lysozyme gene. Sequence organization and chromosomal localisation.|ссылка=|язык=|издание=Eur. J. Biochem.|тип=|год=|месяц=|число=|том=|номер=182|страницы=507–516|issn=}}</ref>
Лизоцим гидролизует преимущественно B-1,4 гликозидные связи между N-ацетилмурамовой кислоты и N-ацетилглюкозамина, содержащиеся в структуре пептидогликана клеточной стенки некоторых микроорганизмов, особенно грамположительных бактерий, и, следовательно, играет определённую роль в защите хозяина. Фермент заставляет сахар мурамовой кислоты находится в напряжённой конформации, и при совместном действии двух ключевых остатков: глутаминовой кислоты в положении 35 и аспарагиновой кислоты в положении 52, гидролизует гликозидные связи.
Лизоцим высоко экспрессируется в кроветворных клетках, где он находится в гранулоцитах, моноцитах и макрофагах, а также в их предшественниках в костном мозге. Обычная концентрация лизоцима в плазме составляет от 4 до 13 мг / л, но только следы можно увидеть в моче здоровых субъектов. В случае нормальных субъектов, по меньшей мере, 500
За последние 30 лет, человеческий лизоцим и HEWL были использованы в качестве системы отсчёта для изучения многих аспектов структуры и функции белков, в том числе стабильности белка и механизма его сворачивания. Были установлены шесть природных мутаций в человеческом лизоциме<ref>{{Статья|автор=Pepys, M. B., Hawkins, P. N., Booth, D. R., Vigushin, D. M., Tennent, G. A., Soutar, A. K., et al.|заглавие=|ссылка=|язык=|издание=Nature|тип=|год=|месяц=|число=|том=362|номер=|страницы=553–557|issn=}}</ref> , и аминокислотные замены (все расположены в B-домена области нативной структуры лизоцима)<ref>{{Статья|автор=Dumoulin, M., Kumita, J. R., Dobson, C. M.|заглавие=Normal and aberrant biological self-assembly: insights from studies of human lysozyme and its amyloidogenic variants.|ссылка=|язык=|издание=Acc. Chem. Res.|тип=|год=|месяц=|число=|том=39|номер=|страницы=603–610|issn=}}</ref>.
== Применение ==
В пищевой промышленности зарегистрирован в качестве [[E1000-E1999|пищевой добавки '''E1105''']] (консервант).
Строка 50 ⟶ 48 :
== Механизм лизиса ==
Фермент атакует пептидогликаны (в частности, [[муреин]]), входящие в состав клеточных стенок бактерий (особенно много его в клеточных стенках [[Грамположительные бактерии|грам-положительных бактерий]] — до 50-80 %). Лизоцим гидролизует β(1→4)-гликозидную связь между [[N-ацетилмурамовая кислота|N-ацетилмурамовой кислотой]] и [[N-ацетилглюкозамин]]ом. Пептидогликан при этом связывается с активным центром фермента (в форме кармана), расположенным между двумя его структурными доменами. Сорбционный центр лизоцима представляет 6 карманов (A, B, C, D, E, F), причём в A, C и E может связываться только N-ацетилглюкозамин, а в B, D и F — как N-ацетилглюкозамин, так и N-ацетилмурамовая кислота. Молекула субстрата в активном центре принимает конформацию, близкую к конформации переходного состояния. В соответствии с механизмом Филлипса, лизоцим связывается с гексасахаридом, затем переводит 4-й остаток в цепи в конформацию твист-кресла. В этом напряжённом состоянии гликозидная связь между центрами D и E легко разрушается. Ингибитором лизоцима служит, в частности, трисахарид N-ацетилглюкозамина, связывающийся с каталитически неактивными центрами A, B и C и препятствующий связыванию субстрата.
|