Занял пост дожа в [[787 год]]у после своего отца, [[Гальбайо, Маурицио|Маурицио Гальбайо]]. Как и его отец, назначил в [[796 год]]у соправителем собственного сына, Маурицио, рассчитывая на преемственность. В [[804 год]]у дож, конфликтовавший с {{нп3|[[Патриархат Градо|патриархом Градо|it|Patriarcato di Grado}}]], попытался назначить своего ставленника, 16-летнего грека Христофора, главой одной из венецианских епархий. Но патриарх, недовольный анти-[[франки|франкскими]] высказываниями претендента на кафедру, отказался посвящать ставленника дожа в епископский сан. В ответ Джованни Гальбайо послал в Градо флотилию во главе со своим сыном, по приказу которого патриарха сбросили с дворцовой башни. Однако на место убитого патриарха был избран его племянник Фортунат, также противник дожа. В самой Венеции против Джованни Гальбайо возник заговор под руководством [[Обелерио, Антенорео|Антенорео Обелерио]], в результате которого семейство Гальбао вынуждено было бежать, а Антенорео Обелерио стал следующим дожем.
