С 1986 года по 1994 год служил в Новочеркасском Вознесенском кафедральном соборе.
В 1991 году [[Архимандрит Модест (Потапов)]] был переведён наместником во вновь образованный [[Иверский женский монастырь (Ростов-на-Дону)|Свято-Иверский женский монастырь]] Ростова-на-Дону.
Весной 1994 года [[Архимандрит Модест (Потапов)]] стал первым наместником возрождённого [[Донской Старочеркасский монастырь|Свято-Донского Старочеркасского мужского монастыря]] и служил там до самого окончания земного пути.
Скончался [[Архимандрит Модест (Потапов)]] 14 марта 2002 года и был похоронен за алтарем Свято-Донского храма в станице [[Старочеркасская|Старочеркасской]]. Архимандрит Модест стал известным подвижником благочестия на донской земле. Очень много паломников бывают на могилке у архимандрита Модеста и просят его молитв перед Богом и заступничества. На данный момент существуют множество свидетельств помощи нуждающимся по молитвам архимандрита Модеста как при жизни, так и после. Незадолго до смерти он говорил своим духовным чадам: «Приходите ко мне на могилу. Если заслужу благодать у Господа, то буду помогать вам». Сейчас на могиле старца всегда живые цветы, верующие люди приезжают, молятся и получают от Господа исцеления по молитвенному предстательству архимандрита Модеста. Готовится материал по канонизации и причисления к лику святых архимандрита Модеста.
