Наниково расположено примерно в 522 километрах (по шоссе)<ref>{{cite web|url=https://ve7.ru/route/2602166|title=Маршрут Феодосия — Береговое|publisher=Довезуха РФ|accessdate=2018-2-16|lang=}}</ref>от центра Феодосии (там же ближайшая [[железнодорожная станция]]) и в 6,5 км к северу от [[Коктебель|Коктебеля]]<ref>{{cite web|url=https://ve7.ru/route/2602168|title=Маршрут Наниково — Коктебель|publisher=Довезуха РФ|accessdate=2018-2-16|lang=}}</ref>, у южного подножия [[Гора Клементьева|горы Клементьева]] в Баракольской долине, высота центра села над уровнем моря 62 м<ref>{{cite web|url=http://weather.in.ua/krym/16614|title=Прогноз погоды в с. Наниково (Крым)|publisher=Weather.in.ua|accessdate=2015-12-13}}</ref>. До [[Феодосия|Феодосии]] — 17 км по шоссе, там же ближайшая железнодорожная станция [[Феодосия (станция)|Феодосия]] — в 19 км. Транспортное сообщение осуществляется по [[Автомобильные дороги России регионального значения|региональной автодороге]] {{табличка-ru|35|Н-594}} Наниково — до шоссе «Алушта — Судак — Феодосия»<ref>{{cite web|url=http://rk.gov.ru/rus/file/pub/pub_241151.pdf|title=Об утверждении критериев отнесения автомобильных дорог общего пользования… Республики Крым.|date=11.03.2015|publisher=Правительство Республики Крым|accessdate=2018-2-16}}</ref> (по украинской классификации — {{Табличка-Крым|С|0-11512}}<ref name="Перечень">{{cite web|url=http://zakon2.rada.gov.ua/krym/show/rb409p001-12/print1329936798073462#n10|title=Перечень автомобильных дорог общего пользования местного значения Автономной Республики Крым|date=2012|publisher=Совет министров Автономной Республики Крым|accessdate=2018-2-16}}</ref>).
