С 10 июля 2009 года руководил [[новороссийск]]им «[[Черноморец (футбольный клуб, Новороссийск)|Черноморцем]]», 3 сентября подал в отставку, официальной причиной такого решения стали семейные обстоятельства<ref>[http://www.championat.ru/football/_russia1d/news-299159.html Главный тренер «Черноморца» ушёл в отставку] {{Wayback|url=http://www.championat.ru/football/_russia1d/news-299159.html |date=20090905120536 }} // championat.ru</ref>.
22 июня 2016 года возглавил [[Химки (футбольный клуб)|ФК «Химки»]]<ref>[{{Cite web |url=http://www.fckhimki.ru/modules/news/index.php?current_id=1&news_id=5545 |title=ФК «Химки» определился с новым тренерским штабом] |accessdate=2016-06-22 |archiveurl=https://web.archive.org/web/20160806082203/http://www.fckhimki.ru/modules/news/index.php?current_id=1&news_id=5545 |archivedate=2016-08-06 |deadlink=yes }}</ref>. В связи с истечением контракта покинул клуб<ref>[{{Cite web |url=http://www.fckhimki.ru/modules/news/index.php?current_id=1&news_id=6433 |title=Александр Ирхин покидает «Химки»] |accessdate=2017-06-07 |archiveurl=https://web.archive.org/web/20170805223447/http://www.fckhimki.ru/modules/news/index.php?current_id=1&news_id=6433 |archivedate=2017-08-05 |deadlink=yes }}</ref>.
7 сентября 2017 года вновь возглавил «Химки»<ref>[{{Cite web |url=http://www.fckhimki.ru/modules/news/index.php?current_id=1&news_id=6663 |title=ОЛЕГ СТОГОВ ПОКИДАЕТ «ХИМКИ». АЛЕКСАНДР ИРХИН ВОЗВРАЩАЕТСЯ] |accessdate=2017-09-08 |archiveurl=https://web.archive.org/web/20170908063613/http://www.fckhimki.ru/modules/news/index.php?current_id=1&news_id=6663 |archivedate=2017-09-08 |deadlink=yes }}</ref>. 8 февраля 2018 клуб расторг контракт.<ref>[https://news.sportbox.ru/Vidy_sporta/Futbol/Russia/1st_division/spbnews_NI823455_Khimki_rasstalis_s_Irkhinym «Химки» расстались с Ирхиным]</ref>
