Протеомика: различия между версиями
| [отпатрулированная версия] | [отпатрулированная версия] |
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Minina (обсуждение | вклад) |
Minina (обсуждение | вклад) |
||
Строка 72:
== Биоинформатика в протеомике ==
С помощью масс-спектрометрии и чипов можно получить информацию о фрагментах белка, но не о белке целиком. В настоящий момент существуют программы, которые из фрагментарных данных масс-спектрометрии и чипов выдают данные о почти полностью собранных из этих фрагментов белков. Эти программы основаны на построении выравниваний фрагментов с известными белками из [[База данных|баз данных]] [[UniProt]]<ref>{{cite web|url=https://www.uniprot.org/|title=UniProt|website=www.uniprot.org}}</ref> и {{нп5|PROSITE||en|PROSITE}}<ref>{{cite web|url=http://prosite.expasy.org/|title=ExPASy — PROSITE|website=prosite.expasy.org}}</ref>.
В большинстве программ, анализирующих белки, не учитываются их посттрансляционные модификации<ref>{{cite pmid|23874192}}</ref>. Существующие в настоящий момент инструменты, определяющие посттрансляционные модификации, имеют лишь предсказательный характер<ref>{{cite pmid|23703210}}</ref>.
Строка 78:
Вычислительные методы [[Биоинформатика|биоинформатики]] активно используются для изучения белков-[[биомаркер]]ов. Так, с помощью компьютерных моделей удалось показать интенсивный обмен белками между организмом матери и плодом при [[Беременность|беременности]], причём для анализа требовался лишь неинвазивный забор крови у матери<ref>{{cite pmid|20186258}}</ref>.
Развивается такое направление, как {{нп5|протеогеномика||en|Proteogenomics}}, которая использует методы протеомики для подтверждения данных, полученных из [[геном]]ных [[Нуклеотидная последовательность|последовательностей]]<ref name="Gupta07">{{cite pmid|17690205}}</ref><ref name="Gupta08">{{cite pmid|18426904}}</ref>. Существует также структурная протеомика, которая занимается широкомасштабным исследованием структур белков на основе данных [[Рентгеноструктурный анализ|рентгеноструктурного анализа]] и [[ЯМР-спектроскопия|ЯМР-спектроскопии]]<ref name="What is Proteomics?">{{cite web |url=http://www.proteomic.org/html/proteomics_.html |title=What is Proteomics? |publisher=ProteoConsult}}{{MEDRS|date=November 2013}}</ref>.
== Практические приложения ==
| |||