После свержения режима [[Ион Антонеску|Антонеску]] в 1944 вернулась на родину. В 1945—1948 гг. — член Политбюро и секретарь ЦК РКП. После объединения (1948) РКП и Социал-демократической партии в Румынскую рабочую партию (РРП), с февраля 1948 по май 1952 член Политбюро ЦК и секретарь ЦК РРП. В декабре 1947 — июле 1952 гг. — министр иностранных дел Румынии.
В 1948 г. журнал [[Time]] поместил её портрет на обложке и описал её как «самую влиятельную из живущих женщин». Однако вскоре её деятельность подверглась внутрипартийной критике. Во-первых, Паукер обвиняли в «политике [[социал-демократическогодемократ]]ического типа»: массовой вербовке более 500 000 новых членов коммунистической партии без проверки — в том числе бывших членов [[Железная гвардия|Железной гвардии]]. Во-вторых, в 1949 г. она не поддержала строительство [[Канал Дунай — Чёрное море (Румыния)|канала Дунай-Черное море]] — личное предложение Сталина. В-третьих, она сопротивлялась репрессиям внутри румынской компартии в ходе [[Сталин, Иосиф Виссарионович|сталинского]] [[Советско-югославский конфликт|конфликта]] с [[Броз Тито, Иосип|Тито]]: так, она была против преследования объявленных «титоистами» румынских ветеранов республиканских [[интербригады|интербригад]] в Гражданскую войну в Испании и отрядов [[Движение Сопротивления (Франция)|французского Сопротивления]]. Кроме того, её обвиняли в «саботаже» процесса против коммунистического министра юстиции [[Лукрециу Пэтрэшкану]].
ОнаПаукер также способствовала эмиграции примерно 100 000 евреев в [[Израиль]] (1950—1952) и решительно выступила против принудительной коллективизации, проведенной по приказу из Москвы летом 1950 г. В 1947 г. добилась повышения закупочных цен на сельхозпродукцию. Историк [[Нойман Наймарк]] позже сравнивал её политику с первоначальным курсом [[Гомулка, Владислав|Владислава Гомулки]]: коалиции с «историческими» партиями, компромиссы с «буржуазными» политиками, пресечение преследований социал-демократов и либералов<ref>Norman Naimark, ''Slavic Review'', Vol. 61, No. 2 (Summer 2002), p. 389.</ref>.
