После смерти Майкла Джаджа несколько его друзей и знакомых раскрыли информацию о том, что он был геем. При этом подчёркивалось, что Джадж соблюдал [[целибат]], будучи монахом.<ref name="advocate">{{citation |title=Our Heroes |periodical=[[The Advocate]] |url=http://findarticles.com/p/articles/mi_m1589/is_2001_Oct_23/ai_79236008/pg_2 |date=October 23, 2001 |first=Mubarak |last=Dahir |accessdate=2007-10-24 |format= – <sup>[http://scholar.google.co.uk/scholar?hl=en&lr=&q=author%3ADahir+intitle%3AOur+Heroes&as_publication=&as_ylo=&as_yhi=&btnG=Search Scholar search]</sup> }} {{dead link|date=April 2009}} {{Dead link|date=September 2010|bot=H3llBot}}</ref><ref>{{cite news | url=http://www.tampabaycoalition.com/files/1003FatherMikeBW.htm | title=Tributes keep flowing for NYC Fire Dept. chaplain Mychal Judge, one of those who died in the World Trade Center attacks | publisher=Bay Windows | date=2001-09-27 | last=Cassels | first=Peter | accessdate=2004-04-16 | archiveurl=https://web.archive.org/web/20040426124201/http://www.tampabaycoalition.com/files/1003FatherMikeBW.htm | archivedate=2004-04-26 }}</ref>. Томас Фон Эссен комиссар противопожарной службы говорил об отце Майкле: ''«Я действительно знал о его гомосексуальности. Я хранил это в тайне. Он мне сам об этом сообщил. Мы часто смеялись над этим и над тем, как сложно было бы другим пожарным принять это просто как это сделал я. Он был необыкновенным, добрым и искренним человеком. Тот факт, что он был геем, не имел к этому никакого отношения.»''<ref>{{cite journal |journal=[[New York Magazine]] |title=The Firemen's Friar |url=http://newyorkmetro.com/nymetro/news/sept11/features/5372/index2.html |date=November 12, 2001 |last=Senior |first=Jennifer |accessdate=2006-09-14 |archiveurl=https://web.archive.org/web/20060326222030/http://newyorkmetro.com/nymetro/news/sept11/features/5372/index2.html |archivedate=2006-03-26 }}</ref>
Факт гомосексуальности отца Майкла пытался оспорить адвокат Деннис Линч в статье, опубликованной на католическом сайте catholic.org. Он утверждал, что попытки прекрепить Майклу Джаджу ярлык гея является попыткой [[ЛГБТ]]-активистов совершить нападки на церковь и превратить священника в гей-икону.<ref>[http://www.catholic.org/featured/headline.php?ID=19 A September 11th Hijacking]</ref>.
Майкл Джадж являлся членом католической ЛГБТ-организации [[DignityUSA]], которая выступала за изменение и пересмотр позиции католической церкви в отношении ЛГБТ-сообщества.<ref name=autogenerated2 /><ref>[http://www.dignityusa.org/faq.html#1 What is Dignity?] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20070404151759/http://www.dignityusa.org/faq.html |date=2007-04-04 }}</ref>. В 1986 году Ватикан издает особый указ, в котором резко осуждает гомосексуальность. После церковь отказывается опекать [[DignityUSA]]. Тогда отец Майкл берет под опеку своей церкви людей, больных [[СПИД]]ом, которых курировала опальная организация. Таким образом Майкл Джадж нарушил указ Ватикана.<ref>pp. 119—120: Ford, Michael, Ibid (2002)</ref>.
Своё несогласие с официальной позицией Ватикана в отношении гомосексуальности Майкл Джадж обозначил так: ''«Неужели в мире так много любви, что мы можем себе позволить роскошь отвергать какую-либо любовь?».''<ref>p. 124: Ford, Michael, Ibid (2002)</ref>
