Промотор: различия между версиями

Промотор асимметричен, что позволяет РНК-полимеразе начать транскрипцию в правильном направлении и указывает на то, какая из двух цепей ДНК будет служить матрицей для синтеза РНК. Матричная цепь ДНК называется некодирующей, при этом другая, кодирующая цепь совпадает с полученной РНК по последовательности (исключая замену [[тимин]]а на [[урацил]]).

 

 

Коровая [[РНК-полимераза]] бактерий (состоящая из субъединиц α2ββ'ω) может инициировать транскрипцию в любом месте генома. Однако, в клетке инициации происходит только в участках промоторов. Такая специфичной обеспечивается σ-субъединицей, которая в комплексе в коровым ферментов образует [[РНК-полимераза II#Бактериальная РНК-полимераза|голоэнзим]]. Основным σ-фактором клеток ''Escherichia coli'' является σ{{sub|70}}-субъединица <ref name="MBOG">{{cite book | author=Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann AA, Levine M, Losick RM | title=Molecular Biology of the Gene | publisher=Pearson | edition=7th | year=2014}}</ref>.

 

 

Характерной чертой промоторов, распознаваемых полимеразой с σ{{sub|70}}-субъединицей, являются две консервативные последовательности длиной по 6 нуклеотидов, расположенные выше сайта начала транскрипции на 10 и 35 п.о, разделенные 17 нуклеотидами. Эти элементы называются соответственно [[Прибнов-бокс |'''-10''']] и '''-35 регионы''' (элементы). Эти регионы не идентичны во всех промоторах, но для них можно получить консенсусные последовательности.

Некоторые σ{{sub|70}} не имеют -35-региона, зато имеют -10-регион, расширенный вверх на несколько нуклеотидов. Таков промотор [[галактозный оперон | галактозного оперона]] ''E.coli''. Иногда ниже -10-элемента располагается ещё один связывающий элемент – '''дискриминатор'''.

 

Альтернативные σ-субъединицы РНК-полимеразы меняют специфичность узнавания промоторов. Например, σ{{sub|32}}-субъединица вызывает узнавание промоторов генов ответа на тепловой шок, σ{{sub|54}} связана в генами метаболизма азота.

 

Клетки эукариот содержат несколько типов РНК-полимераз. Транскрипцией мРНК занимается [[РНК-полимераза II]] вместе с набором белковых [[общие факторы транскрипции | факторов транскрипции]].

 

Коровый промотор эукариот – это минимальный набор элементов последовательности, необходимый для связывания РНК-полимеразы II. Обычно длина корового промотора составляет 40-60 п.о., а располагаться он может или выше, или ниже точки старта транскрипции. Полный набор элементов корового промотра включается в себя BRE-элемент, [[ТАТА-бокс]], Inr (инициатор) или нижележащие элементы (DPE, DCE и MTE).

Обычно, в промоторе находится подмножество из этих элементов. Например, в одном промотре обычно не встречаются DPE и TATA-бокс одновременно. Часто встречается комбинация TATA-бокса, DPE и Inr.

 

 

РНК-полимераза I в клетках эукариот транскрибирует единственный ген-предшественник [[рРНК]], присутствующий в геноме во многих копиях.

 

Промотор гена рРНК содержит коровые элементы (координаты около -45 +20) и UCE (''upstream control element'', координаты около -150 -100). Инициации транскрипции этого гена также требует факторов транскрипции TBP, SL1 (состоит из белков TBP и трех TAF) и UBF. UBF связывает UCE-элемент, SF1 – коровый промотор. Связанный UBF стимулирует связывание полимеразы с участком корового промотора.

 

РНК-полимераза III задействована с транскрипции генов некоторых РНК клетки ([[тРНК]], 5sРНК).

 

Промоторы РНК-полимеразы III очень разнообразны и обычно лежат ниже точки старта транскрипции. Промоторы генов тРНК, в частности, содержат A- и B-боксы, для инициации требуются факторы транскрипции TFIIIB и TFIIIC.

Другие промоторы могут содержать A- и C-боксы (например 5sРНК),для инициации требуются факторы транскрипции TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC. Группа промоторов РНК-полимеразы III содержит [[ТАТА-бокс]]ы.

 

== См. также ==