Промотор: различия между версиями

Коровая [[РНК-полимераза]] бактерий (состоящая из субъединиц α2ββ'ω) может инициировать транскрипцию в любом месте генома. Однако, в клетке инициации происходит только в участках промоторов. Такая специфичнойспецифичность обеспечивается σ-субъединицей, которая в комплексе вс коровым ферментовферментом образует [[РНК-полимераза II#Бактериальная РНК-полимераза|голоэнзим]]. Основным σ-фактором клеток ''Escherichia coli'' является σ{{sub|70}}-субъединица <ref name="MBOG">{{cite book | author=Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann AA, Levine M, Losick RM | title=Molecular Biology of the Gene | publisher=Pearson | edition=7th | year=2014}}</ref>.

Характерной чертой промоторов, распознаваемых полимеразой с σ{{sub|70}}-субъединицей, являются две консервативные последовательности длиной по 6 нуклеотидов, расположенные выше сайта начала транскрипции на 10 и 35 п.о., разделенные 17 нуклеотидами. Эти элементы называются соответственно [[Прибнов-бокс |'''-10''']] и '''-35 регионы''' (элементы). Эти регионы не идентичны во всех промоторах, но для них можно получить консенсусные последовательности.

Некоторые σ{{sub|70}} промоторы не имеют -35-региона, зато имеют -10-регион, расширенный вверх на несколько нуклеотидов. Таков промотор [[галактозный оперон | галактозного оперона]] ''E.coli''. Иногда ниже -10-элемента располагается ещё один связывающий элемент – '''дискриминатор'''.

Альтернативные σ-субъединицы РНК-полимеразы меняют специфичность узнавания промоторов. Например, σ{{sub|32}}-субъединица вызывает узнавание промоторов генов ответа на тепловой шок, σ{{sub|54}} связана вс генами метаболизма азота.

Коровый промотор эукариот – это минимальный набор элементов последовательности, необходимый для связывания РНК-полимеразы II и транскрипционных факторов, необходимых для старта инициации транскрипции. Обычно длина корового промотора составляет 40-60 п.о., а располагаться он может или выше, или ниже точки старта транскрипции. Полный набор элементов корового промотрапромотора включаетсявключает в себя [[BRE|BRE-элемент]], [[ТАТА-бокс]], Inr (инициатор) и/или нижележащие элементы (DPE, DCE и MTE).

Обычно, в промоторе находится подмножествокомбинация из этих элементов. Например, в одном промотрепромоторе обычно не встречаются DPE и TATA-бокс одновременно. Часто встречается комбинация TATA-бокса, DPE и Inr.

Промотор гена рРНК содержит коровые элементы (координаты около -45 +20) и UCE (''upstream control element'', координаты около -150 -100). ИнициацииИнициация транскрипции этого гена также требует несколько факторов транскрипции – TBP, SL1 (состоит из белков TBP и трех TAF) и UBF. UBF связывает UCE-элемент, SF1 – коровый промотор. Связанный UBF стимулирует связывание полимеразы с участком корового промотора.

РНК-полимераза III задействована св транскрипции генов некоторых [[Некодирующие РНК|некодирующих РНК]] клетки ([[тРНК]], 5sРНК).

Другие промоторы могут содержать A- и C-боксы (например 5sРНК), для инициации требуются факторы транскрипции TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC. Группа промоторов РНК-полимеразы III содержит [[ТАТА-бокс]]ы.