Википедия

TNP1

Переходный ядерный белок сперматид номер один (англ. Spermatid nuclear transition protein 1) — белок, который у человека кодируется геном TNP1[5][6]. Данный белок имеет центральное значение в сперматогенезе. Мутации в этом гене могут вызывать нарушения образования сперматозоидов, тем самым приводя к бесплодию[7]. Белок TNP1 состоит из 54 остатков аминокислот с общей молекулярной массой 6,2 кДа. Аминокислоты аргинин и лизин распределены равномерно и составляют около 40% белка. Цистеин отсутствует. Исследования in vitro показали, что белок TNP1 снижает температуру плавления ДНК, высвобождая ее из нуклеосом[8]. В удлиняющихся сперматозоидах млекопитающих участвует в замене гистонов на протамин[9].

TNP1
Идентификаторы
ПсевдонимыTNP1, TP1, transition protein 1
Внешние IDOMIM: 190231 MGI: 98784 HomoloGene: 136517 GeneCards: TNP1
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме TNP1
Расположение в геноме TNP1
Локус2q35Начало216,859,458 bp[1]
Конец216,860,064 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме TNP1
Расположение в геноме TNP1
Локус1 C3|1 36.94 cMНачало73,054,233 bp[2]
Конец73,055,068 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • caput epididymis

  • corpus epididymis

  • left lobe of thyroid gland

  • right lobe of thyroid gland

  • right uterine tube

  • right lobe of liver
Наибольшая экспрессия в
  • seminiferous tubule

  • interventricular septum
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

7141

21958

Ensembl

ENSG00000118245

ENSMUSG00000026182

UniProt

P09430

P10856

RefSeq (мРНК)

NM_003284

NM_009407

RefSeq (белок)

NP_003275

NP_033433

Локус (UCSC)Chr 2: 216.86 – 216.86 MbChr 1: 73.05 – 73.06 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Примечания править

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118245 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026182 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Luerssen H., Mattei M. G., Schroter M., Grzeschik K. H., Adham I. M., Engel W. Nucleotide sequence of the gene for human transition protein 1 and its chromosomal localization on chromosome 2 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1991. — January (vol. 8, no. 2). — P. 324—330. — doi:10.1016/0888-7543(90)90289-7. — PMID 2249851.
  6. ↑ Entrez Gene: TNP1 transition protein 1 (during histone to protamine replacement). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. ↑ Shuai Zhang, Yan Zhang, Chunhong Yang, Wei Zhang, Zhihua Ju. TNP1 Functional SNPs in bta-miR-532 and bta-miR-204 Target Sites Are Associated with Semen Quality Traits in Chinese Holstein Bulls1 (англ.) // Biology of Reproduction. — 2015-06-01. — Vol. 92, iss. 6. — ISSN 1529-7268 0006-3363, 1529-7268. — doi:10.1095/biolreprod.114.126672.
  8. ↑ Torres-Flores U., Hernández-Hernández A. The Interplay Between Replacement and Retention of Histones in the Sperm Genome (англ.) // Frontiers in Genetics. — 2020. — Vol. 11. — P. 780. — ISSN 1664-8021. — doi:10.3389/fgene.2020.00780.
  9. ↑ UniProtKB - P09430 (STP1_HUMAN) (англ.). uniprot. Дата обращения: 3 января 2021. Архивировано 7 мая 2021 года.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=TNP1&oldid=130787061