Википедия

BHLH

(перенаправлено с «Спираль-петля-спираль»)

Основная структура спираль-петля-спираль (от англ. basic helix-loop-helix, сокр. bHLH) — это базовый структурный мотив, имеющийся у многих белков, принадлежащих к суперсемейству димеризующихся факторов транскрипции[2][3][4][5]. Эти белки и называют bHLH белками. Не следует путать этот белковый структурный мотив с другим, похожим структурным мотивом белков, так называемым мотивом «спираль-поворот-спираль». Слово «базовый» относится не к сложности, а к химическому составу мотива, поскольку факторы транскрипции обычно содержат оснóвные аминокислотные остатки, чтобы облегчить связывание с ДНК[6].

базовая структура спираль-петля-спираль ДНК-связывающего домена.
базовый структурный мотив спираль-петля-спираль ядерного транслокатора AHR (ARNT). Две α-спирали (синие) взаимодействуют с короткой петлёй (красная)[1].
базовый структурный мотив спираль-петля-спираль ядерного транслокатора AHR (ARNT). Две α-спирали (синие) взаимодействуют с короткой петлёй (красная)[1].
Идентификаторы
Символ bHLH
Pfam PF00010
InterPro IPR001092
SMART SM00353
PROSITE PDOC00038
SCOP 1mdy
SUPERFAMILY 1mdy
CDD cd00083
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

Структура править

Мотив характеризуется наличием двух α-спиралей, связанных петлёй. В общем, факторы транскрипции, включающие данный домен, являются димерными, каждый с одной спиралью, содержащей оснóвные аминокислотные остатки, которые облегчают связывание молекул ДНК[7]. В мотиве, одна спираль меньше и, благодаря гибкости петли, позволяет димеризоваться путём фолдинга и упаковки против другой спирали. Большая спираль обычно содержит участки связывания ДНК. bHLH-белки обычно связываются с консенсусной последовательностью, называемой E-box, CANNTG[8]. Каноническая последовательность E-box представляет собой CACGTG (палиндромную), однако некоторые факторы транскрипции bHLH, особенно из семейства bHLH-PAS, связываются с родственными непалиндромными последовательностями, которые похожи на E-box. bHLH TF могут гомодимеризоваться или гетеродимеризоваться с другими bHLH TF и ​​формировать большое разнообразие димеров, каждый из которых обладает определёнными функциями[9].

Примеры править

Примеры транскрипционных факторов, содержащих bHLH:

bHLH транскрипционные факторы часто важны в развитии или клеточной активности. BMAL1/Clock — это основной транскрипционный комплекс в циркадианных молекулярных осцилляторах. Другие гены, такие как c-Myc и HIF-1, были связаны с злокачественными опухолями, из-за их влияния на рост клеток и метаболизм.

Регуляция править

Поскольку многие транскрипционные факторы bHLH являются гетеродимерными[9], их активность часто сильно регулируется димеризацией субъединиц. Экспрессия или доступность одной субъединицы часто контролируется, тогда как другая субъединица конститутивно экспрессируется. Многие из известных регуляторных белков, таких как белок Drosophila extramacrochaetae, имеют структуру спираль-петля-спираль, но не имеют базовой области, что делает их неспособными самостоятельно связываться с ДНК. Они, однако, способны образовывать гетеродимеры с белками, которые имеют структуру bHLH, и таким образом дезактивируют свои способности в качестве факторов транскрипции[10].

История править

Человеческие белки с bHLH структурами править

AHR; AHRR; ARNT; ARNT2; ARNTL; ARNTL2; ASCL1; ASCL2; ASCL3; ASCL4; ATOH1; ATOH7; ATOH8; BHLHB2; BHLHB3; BHLHB4; BHLHB5; BHLHB8; CLOCK; EPAS1; FERD3L; FIGLA; HAND1; HAND2; HES1; HES2; HES3; HES4; HES5; HES6; HES7; HEY1; HEY2; HIF1A; ID1; ID2; ID3; ID4; KIAA2018; LYL1; MASH1; MATH2; MAX; MESP1; MESP2; MIST1; MITF; MLX; MLXIP; MLXIPL; MNT; MSC; MSGN1; MXD1; MXD3; MXD4; MXI1; MYC; MYCL1; MYCL2; MYCN; MYF5; MYF6; MYOD1; MYOG; NCOA1; NCOA3; NEUROD1; NEUROD2; NEUROD4; NEUROD6; NEUROG1; NEUROG2; NEUROG3; NHLH1; NHLH2; NPAS1; NPAS2; NPAS3; NPAS4; OAF1; OLIG1; OLIG2; OLIG3; PTF1A; SCL; SCXB; SIM1; SIM2; SOHLH1; SOHLH2; SREBF1; SREBF2; TAL1; TAL2; TCF12; TCF15; TCF21; TCF3; TCF4; TCFL5; TFAP4; TFE3; TFEB; TFEC; TWIST1; TWIST2; USF1; USF2;

Примечания править

  1. ↑ PDB 1x0o; Card P.B., Erbel P.J., Gardner K.H. Structural basis of ARNT PAS-B dimerization: use of a common beta-sheet interface for hetero- and homodimerization (англ.) // J. Mol. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2005. — October (vol. 353, no. 3). — P. 664—677. — doi:10.1016/j.jmb.2005.08.043. — PMID 16181639.
  2. ↑ Murre C., Bain G., van Dijk M.A., Engel I., Furnari B.A., Massari M.E., Matthews J.R., Quong M.W., Rivera R.R., Stuiver M.H. Structure and function of helix-loop-helix proteins (англ.) // Biochim. Biophys. Acta  (англ.) (рус. : journal. — 1994. — June (vol. 1218, no. 2). — P. 129—135. — doi:10.1016/0167-4781(94)90001-9. — PMID 8018712. Архивировано 10 октября 2018 года.
  3. ↑ Littlewood T.D., Evan G.I. Transcription factors 2: helix-loop-helix (неопр.) // Protein Profile. — 1995. — Т. 2, № 6. — С. 621—702. — PMID 7553065.
  4. ↑ Massari M.E., Murre C. Helix-loop-helix proteins: regulators of transcription in eucaryotic organisms (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2000. — January (vol. 20, no. 2). — P. 429—440. — doi:10.1128/MCB.20.2.429-440.2000. — PMID 10611221. — PMC 85097. Архивировано 30 мая 2020 года.
  5. ↑ Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. Choose your partners: dimerization in eukaryotic transcription factors (англ.) // Trends in Biochemical Sciences  (англ.) (рус. : journal. — Cell Press, 2008. — 1 May (vol. 33, no. 5). — P. 220—229. — ISSN 0968-0004. — doi:10.1016/j.tibs.2008.02.002. — PMID 18406148.
  6. ↑ Lawrence Zipursky. McGill Lodish 5E Package - Molecular Cell Biology & McGill Activation Code / Lawrence Zipursky, Arnold Berk, Monty Krieger … [и др.]. — San Francisco : W. H. Freeman, 2003-08-22. — ISBN 0-7167-8635-4.
  7. ↑ Lawrence Zipursky; Arnold Berk; Monty Krieger; Darnell, James E.; Lodish, Harvey F.; Kaiser, Chris; Matthew P Scott; Matsudaira, Paul T. McGill Lodish 5E Package - Molecular Cell Biology & McGill Activation Code (англ.). — San Francisco: W. H. Freeman  (англ.) (рус.. — ISBN 0-7167-8635-4.
  8. ↑ Chaudhary J., Skinner M.K. Basic helix-loop-helix proteins can act at the E-box within the serum response element of the c-fos promoter to influence hormone-induced promoter activation in Sertoli cells (англ.) // Mol. Endocrinol.  (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 13, no. 5. — P. 774—786. — doi:10.1210/mend.13.5.0271. — PMID 10319327.
  9. ↑ 1 2 Amoutzias, Gregory D.; Robertson, David L.; Oliver, Stephen G.; Bornberg-Bauer, Erich. Convergent evolution of gene networks by single-gene duplications in higher eukaryotes (англ.) // EMBO reports  (англ.) (рус. : journal. — 2004. — 1 March (vol. 5, no. 3). — P. 274—279. — ISSN 1469-221X. — doi:10.1038/sj.embor.7400096. — PMID 14968135. — PMC 1299007.
  10. ↑ Cabrera C.V., Alonso M.C., Huikeshoven H. Regulation of scute function by extramacrochaete in vitro and in vivo (англ.) // Development : journal. — 1994. — Vol. 120, no. 12. — P. 3595—3603. — PMID 7821225.

Ссылки править

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=BHLH&oldid=134437325