Фосфатаза пируватдегидрогеназы

Фосфатаза пируватдегидрогеназы
Фосфатаза пируватдегидрогеназы
Идентификаторы
Псевдонимы	PDP1, PDH, PDP, PDPC, PPM2C, PPM2A, pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, pyruvate dehydrogenase phosphatase catalytic subunit 1
Внешние ID	OMIM: 605993 MGI: 2685870 HomoloGene: 31928 GeneCards: PDP1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	8-я хромосома человека
Конец	93,926,068 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	4-я хромосома мыши
Конец	11,966,452 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	Цитоархитектоническое поле Бродмана 23; ; middle temporal gyrus; ; corpus epididymis; ; trigeminal ganglion;
	Наибольшая экспрессия в
	medial dorsal nucleus; ; medial geniculate nucleus; ; olfactory tubercle; ; piriform cortex;
	Дополнительные справочные данные
	н/д
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	protein serine/threonine phosphatase activity; связывание с белками плазмы; активность катализатора; phosphoprotein phosphatase activity; гидролазная активность; cation binding; связывание с ионом металла; [pyruvate dehydrogenase (lipoamide) phosphatase activity];
Компонент клетки	Митохондриальный матрикс; митохондрия;
Биологический процесс	protein dephosphorylation; regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate; peptidyl-threonine dephosphorylation; positive regulation of pyruvate dehydrogenase activity;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	54704
	381511
	ENSG00000164951
	ENSMUSG00000049225
	Q9P0J1
	Q3UV70
	NM_001161778; NM_001161779; NM_001161780; NM_001161781; NM_018444
	NM_001033453; NM_001098230; NM_001098231; NM_001290387; NM_001290391
	NP_001155251; NP_001155252; NP_001155253; NP_060914
	NP_001028625; NP_001091700; NP_001091701; NP_001277316; NP_001277320
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Каталитическая субъединица фосфатазы пируватдегидрогеназы 1 (PDPC 1), также известная как протеинфосфатаза 2C, является ферментом, который в организме человека кодируется геном PDP-1^[5]^[6]. PDPC 1 представляет собой фермент, который служит для отмены эффектов киназы пируватдегидрогеназы на пируватдегидрогеназу, активируя пируватдегидрогеназу.

Функция править

Пируватдегидрогеназа (E1) является одним из трех компонентов (E1, E2 и E3) большого комплекса пируватдегидрогеназы. Киназы пируватдегидрогеназы катализируют фосфорилирование сериновых остатков E1, чтобы инактивировать компонент E1 и ингибировать комплекс. Фосфатазы пируватдегидрогеназы катализируют дефосфорилирование и активацию компонента E1, чтобы обратить действие киназ пируватдегидрогеназы.

Фосфатаза пируватдегидрогеназы представляет собой гетеродимер, состоящий из каталитических и регуляторных субъединиц. Сообщалось о двух каталитических субъединицах; один из них преимущественно экспрессируется в скелетных мышцах, а другой в гораздо большем количестве в печени. Каталитическая субъединица, кодируемая этим геном, является первой и принадлежит к суперсемейству протеинфосфатазы 2C (PP2C). Наряду с пируватдегидрогеназным комплексом и пируватдегидрогеназными киназами этот фермент находится в митохондриальном матриксе^[5].

Регуляция править

Фосфатаза пируватдегидрогеназы стимулируется инсулином, ФЕП и АМФ, но конкурентно ингибируется АТФ, НАДН и Ацетил-КоА.

Клиническое значение править

Мутация в этом гене вызывает дефицит фосфатазы пируватдегидрогеназы^[5].

Примечания править

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164951 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000049225 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ ¹ ² ³ Entrez Gene: pyruvate dehydrogenase phosphatase catalytic subunit 1 (неопр.).
↑ "Molecular cloning and expression of the catalytic subunit of bovine pyruvate dehydrogenase phosphatase and sequence similarity with protein phosphatase 2C". Biochemistry. 32 (35): 8987—93. Sep 1993. doi:10.1021/bi00086a002. PMID 8396421.

Дальнейшее чтение править

Piccinini M, Mostert M, Alberto G, Ramondetti C, Novi RF, Dalmasso P, Rinaudo MT (Apr 2005). "Down-regulation of pyruvate dehydrogenase phosphatase in obese subjects is a defect that signals insulin resistance". Obesity Research. 13 (4): 678—86. doi:10.1038/oby.2005.76. PMID 15897476.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T, Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (Jan 2006). "Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Research. 16 (1): 55—65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R, Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (Aug 2000). "Gene expression profiling in the human hypothalamus-pituitary-adrenal axis and full-length cDNA cloning". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (17): 9543—8. Bibcode:2000PNAS...97.9543H. doi:10.1073/pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Auffray C, Behar G, Bois F, Bouchier C, Da Silva C, Devignes MD, Duprat S, Houlgatte R, Jumeau MN, Lamy B (Feb 1995). "[IMAGE: molecular integration of the analysis of the human genome and its expression]". Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 318 (2): 263—72. PMID 7757816.
Lejeune F, Li X, Maquat LE (Sep 2003). "Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities". Molecular Cell. 12 (3): 675—87. doi:10.1016/S1097-2765(03)00349-6. PMID 14527413.
Cameron JM, Maj M, Levandovskiy V, Barnett CP, Blaser S, Mackay N, Raiman J, Feigenbaum A, Schulze A, Robinson BH (Apr 2009). "Pyruvate dehydrogenase phosphatase 1 (PDP1) null mutation produces a lethal infantile phenotype". Human Genetics. 125 (3): 319—26. doi:10.1007/s00439-009-0629-6. PMID 19184109.
Maj MC, MacKay N, Levandovskiy V, Addis J, Baumgartner ER, Baumgartner MR, Robinson BH, Cameron JM (Jul 2005). "Pyruvate dehydrogenase phosphatase deficiency: identification of the first mutation in two brothers and restoration of activity by protein complementation". The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 90 (7): 4101—7. doi:10.1210/jc.2005-0123. PMID 15855260.
Sugden MC, Holness MJ (May 2003). "Recent advances in mechanisms regulating glucose oxidation at the level of the pyruvate dehydrogenase complex by PDKs". American Journal of Physiology. Endocrinology and Metabolism. 284 (5): E855-62. doi:10.1152/ajpendo.00526.2002. PMID 12676647.
Kato J, Kato M (Mar 2010). "Crystallization and preliminary crystallographic studies of the catalytic subunits of human pyruvate dehydrogenase phosphatase isoforms 1 and 2". Acta Crystallographica Section F. 66 (Pt 3): 342—5. doi:10.1107/S1744309110003131. PMC 2833053. PMID 20208177.
Korotchkina LG, Patel MS (Jun 1995). "Mutagenesis studies of the phosphorylation sites of recombinant human pyruvate dehydrogenase. Site-specific regulation". The Journal of Biological Chemistry. 270 (24): 14297—304. doi:10.1074/jbc.270.24.14297. PMID 7782287.
Stellingwerff T, Spriet LL, Watt MJ, Kimber NE, Hargreaves M, Hawley JA, Burke LM (Feb 2006). "Decreased PDH activation and glycogenolysis during exercise following fat adaptation with carbohydrate restoration". American Journal of Physiology. Endocrinology and Metabolism. 290 (2): E380-8. doi:10.1152/ajpendo.00268.2005. PMID 16188909.
Ito M, Kobashi H, Naito E, Saijo T, Takeda E, Huq AH, Kuroda Y (Jul 1992). "Decrease of pyruvate dehydrogenase phosphatase activity in patients with congenital lactic acidemia". Clinica Chimica Acta; International Journal of Clinical Chemistry. 209 (1—2): 1—7. doi:10.1016/0009-8981(92)90327-M. PMID 1327585.
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (Sep 1995). "Initial assessment of human gene diversity and expression patterns based upon 83 million nucleotides of cDNA sequence". Nature. 377 (6547 Suppl): 3—174. PMID 7566098.
Caruso M, Maitan MA, Bifulco G, Miele C, Vigliotta G, Oriente F, Formisano P, Beguinot F (Nov 2001). "Activation and mitochondrial translocation of protein kinase Cdelta are necessary for insulin stimulation of pyruvate dehydrogenase complex activity in muscle and liver cells". The Journal of Biological Chemistry. 276 (48): 45088—97. doi:10.1074/jbc.M105451200. PMID 11577086.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (Sep 1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Research. 6 (9): 791—806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
Huang B, Gudi R, Wu P, Harris RA, Hamilton J, Popov KM (Jul 1998). "Isoenzymes of pyruvate dehydrogenase phosphatase. DNA-derived amino acid sequences, expression, and regulation". The Journal of Biological Chemistry. 273 (28): 17680—8. doi:10.1074/jbc.273.28.17680. PMID 9651365.

Ссылки править

MeSH Pyruvate+Dehydrogenase+Phosphatase

[refGRCh38EnsemblENSG00000164951-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164951 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000049225-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000049225 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] ¹ ² ³ Entrez Gene: pyruvate dehydrogenase phosphatase catalytic subunit 1 (неопр.).

[pmid8396421-6] "Molecular cloning and expression of the catalytic subunit of bovine pyruvate dehydrogenase phosphatase and sequence similarity with protein phosphatase 2C". Biochemistry. 32 (35): 8987—93. Sep 1993. doi:10.1021/bi00086a002. PMID 8396421.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]