Цветовая схема моделей Кори — Полинга — Колтуна
В химии, раскраска по CPK (англ. Corey-Pauling-Koltun, рус. Кори-Полинг-Колтун) — популярная схема цветового обозначения атомов различных химических элементов в молекулярных моделях. Данная схема названа в честь молекулярной модели CPK, созданной Робертом Кори и Лайнусом Полингом и усовершенствованной Уолтером Колтуном.
История править
В 1952 году, Кори и Полинг опубликовали описание объёмной модели белков и других биомолекул, которую они создали в Калифорнийском технологическом институте.[1] Их модель представляла атомы деревянными шариками, раскрашенными в яркие цвета, соответствующие химическим элементам. Их цветовая модель включала:
Они также построили уменьшенные модели, используя пластиковые шарики такой же цветовой схемы.
В 1965 году Колтун запатентовал улучшенную версию модели Кори-Полинга.[2] В своём патенте он упоминает следующие цвета:
Типичные цветовые обозначения править
Типичные цветовые обозначения в CPK включают:
| водород (H) | белый | |
| углерод (C) | чёрный | |
| азот (N) | синий | |
| кислород (O) | красный | |
| фтор (F), хлор (Cl) | зелёный | |
| бром (Br) | тёмно-красный | |
| иод (I) | тёмно-фиолетовый | |
| благородные газы (He, Ne, Ar, Xe, Kr) | циановый | |
| фосфор (P) | оранжевый | |
| сера (S) | жёлтый | |
| бор (B), большинство переходных металлов | бежевый | |
| щелочные металлы (Li, Na, K, Rb, Cs) | фиолетовый | |
| щелочноземельные металлы (Be, Mg, Ca, Sr, Ba, Ra) | тёмно-зелёный | |
| титан (Ti) | серый | |
| железо (Fe) | темно-оранжевый | |
| другие элементы | розовый |
Некоторые из цветов CPK мнемонически связаны с цветами чистых элементов или их соединений. Например, водород — бесцветный газ, углерод в виде угля или графита чёрный, многие формы серы имеют жёлтый цвет, хлор — зеленоватый газ, бром — тёмно-красная жидкость, иод в эфире фиолетовый, одна из аллотропных модификаций фосфора имеет красный цвет, железная ржавчина имеет тёмно-оранжевый оттенок, и т. д. В случае других элементов, таких как кислород и азот, выбор цвета менее понятен. Вероятно, красный цвет для кислорода был выбран потому что он часто ассоциируется с горением, а синий цвет для азота обусловлен тем, что это главный компонент земной атмосферы, имеющей синии тона.
Современные варианты править
Следующая таблица представляет собой цвета, назначаемые каждому элементу в популярных компьютерных программах. Колонка C содержит изначальные цвета Кори и Полинга,[1] колонка K содержит цвета из патента Колтуна.[2] Колонка J описывает цветовую схему, используемую молекулярным визуализатором Jmol.[3] Колонка R описывает цветовую схему, используемую программой RasMol; в случае если указаны два цвета, второй актуален для версий 2.7.3 и выше.[3][4] Все цвета даны приблизительно и могут зависеть от дисплея и настроек видео.
| Атомный номер | Символ | Название | Цвета | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| С | K | J | R | |||
| 1 | H | водород | ||||
| 1 | 2H (D) | дейтерий | ||||
| 1 | 3H (T) | тритий | ||||
| 2 | He | гелий | ||||
| 3 | Li | литий | ||||
| 4 | Be | бериллий | ||||
| 5 | B | бор | ||||
| 6 | C | углерод | ||||
| 6 | 13C | углерод-13 | ||||
| 6 | 14C | углерод-14 | ||||
| 7 | N | азот | ||||
| 7 | 15N | азот-15 | ||||
| 8 | O | кислород | ||||
| 9 | F | фтор | ||||
| 10 | Ne | неон | ||||
| 11 | Na | натрий | ||||
| 12 | Mg | магний | ||||
| 13 | Al | алюминий | ||||
| 14 | Si | кремний | ||||
| 15 | P | фосфор | ||||
| 16 | S | сера | ||||
| 17 | Cl | хлор | ||||
| 18 | Ar | аргон | ||||
| 19 | K | калий | ||||
| 20 | Ca | кальций | ||||
| 21 | Sc | скандий | ||||
| 22 | Ti | титан | ||||
| 23 | V | ванадий | ||||
| 24 | Cr | хром | ||||
| 25 | Mn | марганец | ||||
| 26 | Fe | железо | ||||
| 27 | Co | кобальт | ||||
| 28 | Ni | никель | ||||
| 29 | Cu | медь | ||||
| 30 | Zn | цинк | ||||
| 31 | Ga | галлий | ||||
| 32 | Ge | германий | ||||
| 33 | As | мышьяк | ||||
| 34 | Se | селен | ||||
| 35 | Br | бром | ||||
| 36 | Kr | криптон | ||||
| 37 | Rb | рубидий | ||||
| 38 | Sr | стронций | ||||
| 39 | Y | иттрий | ||||
| 40 | Zr | цирконий | ||||
| 41 | Nb | ниобий | ||||
| 42 | Mo | молибден | ||||
| 43 | Tc | технеций | ||||
| 44 | Ru | рутений | ||||
| 45 | Rh | родий | ||||
| 46 | Pd | палладий | ||||
| 47 | Ag | серебро | ||||
| 48 | Cd | кадмий | ||||
| 49 | In | индий | ||||
| 50 | Sn | олово | ||||
| 51 | Sb | сурьма | ||||
| 52 | Te | теллур | ||||
| 53 | I | иод | ||||
| 54 | Xe | ксенон | ||||
| 55 | Cs | цезий | ||||
| 56 | Ba | барий | ||||
| 57 | La | лантан | ||||
| 58 | Ce | церий | ||||
| 59 | Pr | празеодим | ||||
| 60 | Nd | неодим | ||||
| 61 | Pm | прометий | ||||
| 62 | Sm | самарий | ||||
| 63 | Eu | европий | ||||
| 64 | Gd | гадолиний | ||||
| 65 | Tb | тербий | ||||
| 66 | Dy | диспрозий | ||||
| 67 | Ho | гольмий | ||||
| 68 | Er | эрбий | ||||
| 69 | Tm | тулий | ||||
| 70 | Yb | иттербий | ||||
| 71 | Lu | лютеций | ||||
| 72 | Hf | гафний | ||||
| 73 | Ta | тантал | ||||
| 74 | W | вольфрам | ||||
| 75 | Re | рений | ||||
| 76 | Os | осмий | ||||
| 77 | Ir | иридий | ||||
| 78 | Pt | платина | ||||
| 79 | Au | золото | ||||
| 80 | Hg | ртуть | ||||
| 81 | Tl | таллий | ||||
| 82 | Pb | свинец | ||||
| 83 | Bi | висмут | ||||
| 84 | Po | полоний | ||||
| 85 | At | астат | ||||
| 86 | Rn | радон | ||||
| 87 | Fr | франций | ||||
| 88 | Ra | радий | ||||
| 89 | Ac | актиний | ||||
| 90 | Th | торий | ||||
| 91 | Pa | протактиний | ||||
| 92 | U | уран | ||||
| 93 | Np | нептуний | ||||
| 94 | Pu | плутоний | ||||
| 95 | Am | америций | ||||
| 96 | Cm | кюрий | ||||
| 97 | Bk | берклий | ||||
| 98 | Cf | калифорний | ||||
| 99 | Es | эйнштейний | ||||
| 100 | Fm | фермий | ||||
| 101 | Md | менделевий | ||||
| 102 | No | нобелий | ||||
| 103 | Lr | лоуренсий | ||||
| 104 | Rf | резерфордий | ||||
| 105 | Db | дубний | ||||
| 106 | Sg | сиборгий | ||||
| 107 | Bh | борий | ||||
| 108 | Hs | хассий | ||||
| 109 | Mt | мейтнерий | ||||
| 110 | Ds | дармштадтий | ||||
| 111 | Rg | рентгений | ||||
| 112 | Cn | коперниций | ||||
| 113 | Nh | нихоний | ||||
Примечания править
- ↑ 1 2 Robert B. Corey and Linus Pauling (1953): Molecular Models of Amino Acids, Peptides, and Proteins. Review of Scientific Instruments, Volume 24, Issue 8, pp. 621—627. doi:10.1063/1.1770803
- ↑ 1 2 Walter L. Koltun (9165), Space filling atomic units and connectors for molecular models. U. S. Patent 3170246.
- ↑ 1 2 Jmol color table Архивная копия от 9 октября 2007 на Wayback Machine на sourceforge.net.
- ↑ Rasmol color table Архивировано 13 мая 2001 года. на bio.cmu.edu.