CDK5R1

Регуляторная субъединица 1 циклин-зависимой киназы 5, сокращённо CDK5R1 — один из нейрон-специфичных активаторов CDK5, наряду с CDK5R2. Имеет две формы, p35 и p25. P25 образуется при расщеплении p35 калпаином, при этом белок перемещается от периферии клетки к ядру и околоядерным областям. P25 дерегулирует активность CDK5, продлевая активацию этой киназы и изменяя её клеточное местоположение. У человека кодируется геном CDK5R1.

CDK5R1
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1H4L, 1UNG, 1UNH, 1UNL, 3O0G
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK5R1, CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1
Внешние ID	OMIM: 603460 MGI: 101764 HomoloGene: 31200 GeneCards: CDK5R1
Расположение гена (человек) Хр. 17-я хромосома человека Локус 17q11.2 Начало 32,486,993 bp Конец 32,491,253 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 11-я хромосома мыши Локус 11 B5|11 47.94 cM Начало 80,367,849 bp Конец 80,372,010 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в Region I of hippocampus proper Цитоархитектоническое поле Бродмана 23 Цитоархитектоническое поле Бродмана 9 Наибольшая экспрессия в medial dorsal nucleus medial ganglionic eminence olfactory tubercle medial geniculate nucleus dorsomedial hypothalamic nucleus Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция protein kinase activity calcium ion binding ephrin receptor binding cadherin binding cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity kinase activity связывание с белками плазмы protein kinase binding protein serine/threonine kinase activator activity protease binding actin binding ionotropic glutamate receptor binding alpha-tubulin binding beta-tubulin binding actin filament binding protein kinase activator activity Компонент клетки цитоплазма цитозоль мембрана Постсинаптическое уплотнение intracellular membrane-bounded organelle Конус роста Нервно-мышечный синапс Дендритный шипик аксон neuronal cell body дендрит protein kinase 5 complex perinuclear region of cytoplasm сократительные волокна клеточное ядро нуклеоплазма клеточная мембрана микротрубочка neuron projection пресинапс Биологический процесс positive regulation of protein kinase activity regulation of neuron differentiation G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity regulation of actin cytoskeleton organization embryo development ритмический процесс ephrin receptor signaling pathway neuron cell-cell adhesion regulation of microtubule cytoskeleton organization neuron migration cerebellum development positive regulation of protein serine/threonine kinase activity positive regulation of neuron apoptotic process развитие мозга ionotropic glutamate receptor signaling pathway layer formation in cerebral cortex peptidyl-serine phosphorylation neuron differentiation пролиферация peptidyl-threonine phosphorylation negative regulation of transcription, DNA-templated neuron projection development cerebral cortex radially oriented cell migration axonal fasciculation развитие гиппокампа negative regulation of axon extension regulation of dendritic spine morphogenesis regulation of macroautophagy superior olivary nucleus maturation positive regulation of protein targeting to membrane Аксональное наведение regulation of signal transduction by p53 class mediator serine phosphorylation of STAT protein microtubule cytoskeleton organization embryo development ending in birth or egg hatching positive regulation of microtubule polymerization positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity regulation of synaptic vesicle cycle activation of protein kinase activity Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 8851 12569 Ensembl ENSG00000176749 ENSMUSG00000048895 UniProt Q15078 P61809 RefSeq (мРНК) NM_003885 NM_009871 RefSeq (белок) NP_003876 NP_034001 Локус (UCSC) Chr 17: 32.49 – 32.49 Mb Chr 11: 80.37 – 80.37 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

При болезни Альцгеймера отмечается избыточное накопление p25 в мозге, что коррелирует с усилением активности CDK5 и может гипотетически сбивать процессы фосфорилирования белка тау, ассоциированного с микротрубочками, способствуя патологическому процессу.