Гистондеацетилаза 7

Гистондеацетилаза 7
Гистондеацетилаза 7
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	3C0Y, 3C0Z, 3C10, 3ZNR, 3ZNS
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC7, HD7A, HDAC7A, HD7, histone deacetylase 7
Внешние ID	OMIM: 606542 MGI: 1891835 HomoloGene: 9124 GeneCards: HDAC7
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	12-я хромосома человека
Конец	47,833,132 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	15-я хромосома мыши
Конец	97,742,383 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	sural nerve; ; left uterine tube; ; upper lobe of left lung; ; right uterine tube; ; right lobe of thyroid gland;
	Наибольшая экспрессия в
	saccule; ; otic placode;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с ионом металла; transcription corepressor activity; protein kinase binding; 14-3-3 protein binding; гидролазная активность; protein kinase C binding; chromatin binding; histone deacetylase activity; NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); связывание с белками плазмы; SUMO transferase activity;
Компонент клетки	нуклеоплазма; цитоплазма; клеточное ядро; histone deacetylase complex; цитозоль;
Биологический процесс	транскрипция, ДНК-зависимая; negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling; positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; cell-cell junction assembly; васкулогенез; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; histone H3 deacetylation; negative regulation of osteoblast differentiation; negative regulation of interleukin-2 production; ДНК-зависимая регуляция транскрипции; histone deacetylation; negative regulation of transcription, DNA-templated; chromatin organization; protein sumoylation;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	51564
	56233
	ENSG00000061273
	ENSMUSG00000022475
	Q8WUI4
	Q8C2B3
	NM_001098416; NM_001308090; NM_015401; NM_016596; NM_001368046
NM_001204275; NM_001204276; NM_001204277; NM_001204278; NM_001204279;
	NM_001204280; NM_001204281; NM_019572; NM_001378971
	NP_001091886; NP_001295019; NP_056216; NP_001354975
NP_001191204; NP_001191205; NP_001191206; NP_001191207; NP_001191208;
	NP_001191209; NP_001191210; NP_062518; NP_001365900
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Гистондеацетилаза 7 (англ. Histone deacetylase 7) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC7 ^[5]^[6]^[7].

Функция править

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном имеет гомологию последовательности с членами семейства гистондезацетилазы. Этот ген ортологичен с геном HDAC7 мыши, белок которого стимулирует репрессию опосредования корепрессора транскрипции SMRT. Несколько альтернативных вариантов сплайсинга, кодирующих несколько изоформ были найдены для этого гена^[7].

Взаимодействия править

HDAC7A, как было выявлено, взаимодействует с:

См также править

Деацетилазы гистонов

Примечания править

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000061273 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022475 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Marks P. A., Richon V. M., Rifkind R. A. Histone deacetylase inhibitors: inducers of differentiation or apoptosis of transformed cells (англ.) // Journal of the National Cancer Institute (англ.) (рус. : journal. — 2000. — August (vol. 92, no. 15). — P. 1210—1216. — doi:10.1093/jnci/92.15.1210. — PMID 10922406.
↑ Kao H. Y., Downes M., Ordentlich P., Evans R. M. Isolation of a novel histone deacetylase reveals that class I and class II deacetylases promote SMRT-mediated repression (англ.) // Genes & Development : journal. — 2000. — January (vol. 14, no. 1). — P. 55—66. — doi:10.1101/gad.14.1.55. — PMID 10640276. — PMC 316336.
↑ ¹ ² Entrez Gene: HDAC7A histone deacetylase 7A (неопр.).
↑ Lemercier C., Brocard M. P., Puvion-Dutilleul F., Kao H. Y., Albagli O., Khochbin S. Class II histone deacetylases are directly recruited by BCL6 transcriptional repressor (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — June (vol. 277, no. 24). — P. 22045—22052. — doi:10.1074/jbc.M201736200. — PMID 11929873.
↑ Lee H. J., Chun M., Kandror K. V. Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — May (vol. 276, no. 20). — P. 16597—16600. — doi:10.1074/jbc.C000909200. — PMID 11262386.
↑ ¹ ² Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel M. J., Voelter W., Verdin E. Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — September (vol. 276, no. 38). — P. 35826—35835. — doi:10.1074/jbc.M104935200. — PMID 11466315.
↑ Xiao H., Chung J., Kao H. Y., Yang Y. C. Tip60 is a co-repressor for STAT3 (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — March (vol. 278, no. 13). — P. 11197—11204. — doi:10.1074/jbc.M210816200. — PMID 12551922.
↑ Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — August (vol. 277, no. 31). — P. 27697—27705. — doi:10.1074/jbc.M201694200. — PMID 12015313.

Литература править

Verdin E., Dequiedt F., Kasler H. G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // Trends in Genetics (англ.) (рус. : journal. — Cell Press, 2003. — May (vol. 19, no. 5). — P. 286—293. — doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. — PMID 12711221.
Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1994. — January (vol. 138, no. 1—2). — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1997. — October (vol. 200, no. 1—2). — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
Lee H. J., Chun M., Kandror K. V. Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — May (vol. 276, no. 20). — P. 16597—16600. — doi:10.1074/jbc.C000909200. — PMID 11262386.
Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel M. J., Voelter W., Verdin E. Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — September (vol. 276, no. 38). — P. 35826—35835. — doi:10.1074/jbc.M104935200. — PMID 11466315.
Lemercier C., Brocard M. P., Puvion-Dutilleul F., Kao H. Y., Albagli O., Khochbin S. Class II histone deacetylases are directly recruited by BCL6 transcriptional repressor (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — June (vol. 277, no. 24). — P. 22045—22052. — doi:10.1074/jbc.M201736200. — PMID 11929873.
Bryant H., Farrell P. J. Signal Transduction and Transcription Factor Modification during Reactivation of Epstein-Barr Virus from Latency (англ.) // Journal of Virology (англ.) (рус. : journal. — 2002. — October (vol. 76, no. 20). — P. 10290—10298. — doi:10.1128/JVI.76.20.10290-10298.2002. — PMID 12239305. — PMC 136559.
Xiao H., Chung J., Kao H. Y., Yang Y. C. Tip60 is a co-repressor for STAT3 (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — March (vol. 278, no. 13). — P. 11197—11204. — doi:10.1074/jbc.M210816200. — PMID 12551922.
Dequiedt F., Kasler H., Fischle W., Kiermer V., Weinstein M., Herndier B. G., Verdin E. HDAC7, a thymus-specific class II histone deacetylase, regulates Nur77 transcription and TCR-mediated apoptosis (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2003. — May (vol. 18, no. 5). — P. 687—698. — doi:10.1016/S1074-7613(03)00109-2. — PMID 12753745.
Lee C. H., Chawla A., Urbiztondo N., Liao D., Boisvert W. A., Evans R. M., Curtiss L. K. Transcriptional repression of atherogenic inflammation: modulation by PPARdelta (англ.) // Science : journal. — 2003. — October (vol. 302, no. 5644). — P. 453—457. — doi:10.1126/science.1087344. — PMID 12970571.
Li X., Song S., Liu Y., Ko S. H., Kao H. Y. Phosphorylation of the histone deacetylase 7 modulates its stability and association with 14-3-3 proteins (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — August (vol. 279, no. 33). — P. 34201—34208. — doi:10.1074/jbc.M405179200. — PMID 15166223.
Kato H., Tamamizu-Kato S., Shibasaki F. Histone deacetylase 7 associates with hypoxia-inducible factor 1alpha and increases transcriptional activity (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — October (vol. 279, no. 40). — P. 41966—41974. — doi:10.1074/jbc.M406320200. — PMID 15280364.
Beausoleil S. A., Jedrychowski M., Schwartz D., Elias J. E., Villén J., Li J., Cohn M. A., Cantley L. C., Gygi S. P. Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2004. — August (vol. 101, no. 33). — P. 12130—12135. — doi:10.1073/pnas.0404720101. — PMID 15302935. — PMC 514446.
Jin J., Smith F. D., Stark C., Wells C. D., Fawcett J. P., Kulkarni S., Metalnikov P., O'Donnell P., Taylor P., Taylor L., Zougman A., Woodgett J. R., Langeberg L. K., Scott J. D., Pawson T. Proteomic, functional, and domain-based analysis of in vivo 14-3-3 binding proteins involved in cytoskeletal regulation and cellular organization (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 2004. — August (vol. 14, no. 16). — P. 1436—1450. — doi:10.1016/j.cub.2004.07.051. — PMID 15324660.

Ссылки править

MeSH HDAC7A+protein,+human

[refGRCh38EnsemblENSG00000061273-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000061273 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000022475-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022475 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10922406-5] Marks P. A., Richon V. M., Rifkind R. A. Histone deacetylase inhibitors: inducers of differentiation or apoptosis of transformed cells (англ.) // Journal of the National Cancer Institute (англ.) (рус. : journal. — 2000. — August (vol. 92, no. 15). — P. 1210—1216. — doi:10.1093/jnci/92.15.1210. — PMID 10922406.

[pmid10640276-6] Kao H. Y., Downes M., Ordentlich P., Evans R. M. Isolation of a novel histone deacetylase reveals that class I and class II deacetylases promote SMRT-mediated repression (англ.) // Genes & Development : journal. — 2000. — January (vol. 14, no. 1). — P. 55—66. — doi:10.1101/gad.14.1.55. — PMID 10640276. — PMC 316336.

[entrez-7] ¹ ² Entrez Gene: HDAC7A histone deacetylase 7A (неопр.).

[pmid11929873-8] Lemercier C., Brocard M. P., Puvion-Dutilleul F., Kao H. Y., Albagli O., Khochbin S. Class II histone deacetylases are directly recruited by BCL6 transcriptional repressor (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — June (vol. 277, no. 24). — P. 22045—22052. — doi:10.1074/jbc.M201736200. — PMID 11929873.

[pmid11262386-9] Lee H. J., Chun M., Kandror K. V. Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — May (vol. 276, no. 20). — P. 16597—16600. — doi:10.1074/jbc.C000909200. — PMID 11262386.

[pmid11466315-10] ¹ ² Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel M. J., Voelter W., Verdin E. Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — September (vol. 276, no. 38). — P. 35826—35835. — doi:10.1074/jbc.M104935200. — PMID 11466315.

[pmid12551922-11] Xiao H., Chung J., Kao H. Y., Yang Y. C. Tip60 is a co-repressor for STAT3 (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — March (vol. 278, no. 13). — P. 11197—11204. — doi:10.1074/jbc.M210816200. — PMID 12551922.

[pmid12015313-12] Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — August (vol. 277, no. 31). — P. 27697—27705. — doi:10.1074/jbc.M201694200. — PMID 12015313.

[5]

[6]

[7]

[1]

[2]

[3]

[4]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]