Гистондеацетилаза 9

(перенаправлено с «HDAC9»)

Гистондеацетилаза 9 (англ. Histone deacetylase 9) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC9[5][6][7].

Гистондеацетилаза 9
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1TQE

Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, histone deacetylase 9
Внешние IDOMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 GeneCards: HDAC9
Расположение гена (человек)
7-я хромосома человека
Хр.7-я хромосома человека[1]
7-я хромосома человека
Расположение в геноме HDAC9
Расположение в геноме HDAC9
Локус7p21.1Начало18,086,949 bp[1]
Конец19,002,416 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
12-я хромосома мыши
Хр.12-я хромосома мыши[2]
12-я хромосома мыши
Расположение в геноме HDAC9
Расположение в геноме HDAC9
Локус12|12 A3Начало34,097,579 bp[2]
Конец34,967,094 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001204144
NM_001204145
NM_001204146
NM_001204147
NM_001204148

NM_014707
NM_058176
NM_058177
NM_178423
NM_178425
NM_001321868
NM_001321869
NM_001321870
NM_001321871
NM_001321872
NM_001321873
NM_001321874
NM_001321875
NM_001321876
NM_001321877
NM_001321878
NM_001321879
NM_001321884
NM_001321885
NM_001321886
NM_001321887
NM_001321888
NM_001321889
NM_001321890
NM_001321891
NM_001321893
NM_001321894
NM_001321895
NM_001321896
NM_001321897
NM_001321898
NM_001321899
NM_001321900
NM_001321901
NM_001321902

NM_001271386
NM_024124

RefSeq (белок)
NP_001191073
NP_001191074
NP_001191075
NP_001191076
NP_001191077

NP_001308797
NP_001308798
NP_001308799
NP_001308800
NP_001308801
NP_001308802
NP_001308803
NP_001308804
NP_001308805
NP_001308806
NP_001308807
NP_001308808
NP_001308813
NP_001308814
NP_001308815
NP_001308816
NP_001308817
NP_001308818
NP_001308819
NP_001308820
NP_001308822
NP_001308823
NP_001308824
NP_001308825
NP_001308826
NP_001308827
NP_001308828
NP_001308829
NP_001308830
NP_001308831
NP_055522
NP_478056
NP_848510
NP_848512

NP_001258315
NP_077038

Локус (UCSC)Chr 7: 18.09 – 19 MbChr 12: 34.1 – 34.97 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функция править

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном имеет гомологию последовательности с членами семейства гистондезацетилазы. Этот ген ортологичен генам Xenopus и MITR мыши. Белку MITR недостаёт каталитического домена гистондезацетилазы. Он подавляет активность MEF2 посредством рекрутирования многокомпонентных корепрессорных комплексов, которые включают CtBP и HDAC(ы). Это кодируемый белок может играть роль в кроветворении. Несколько альтернативных вариантов сплайсинга были описаны для этого гена, но в полный мере характер некоторых из них не был определён[7].

Взаимодействия править

HDAC9, как было выявлено, взаимодействует с:

См. также править

Примечания править

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000048052 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000004698 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Wang A.H., Bertos N.R., Vezmar M., Pelletier N., Crosato M., Heng H.H., Th'ng J., Han J., Yang X.J. HDAC4, a human histone deacetylase related to yeast HDA1, is a transcriptional corepressor (англ.) // Mol Cell Biol  (англ.) : journal. — 1999. — November (vol. 19, no. 11). — P. 7816—7827. — PMID 10523670. — PMC 84849.
  6. Sparrow D.B., Miska E.A., Langley E., Reynaud-Deonauth S., Kotecha S., Towers N., Spohr G., Kouzarides T., Mohun T.J. MEF-2 function is modified by a novel co-repressor, MITR (англ.) // EMBO J  (англ.) : journal. — 1999. — November (vol. 18, no. 18). — P. 5085—5098. — doi:10.1093/emboj/18.18.5085. — PMID 10487760. — PMC 1171579.
  7. 1 2 Entrez Gene: HDAC9 histone deacetylase 9.
  8. 1 2 Zhang C.L., McKinsey T.A., Olson E.N. Association of class II histone deacetylases with heterochromatin protein 1: potential role for histone methylation in control of muscle differentiation (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) : journal. — 2002. — October (vol. 22, no. 20). — P. 7302—7312. — doi:10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002. — PMID 12242305. — PMC 139799.
  9. 1 2 3 Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — May (vol. 278, no. 18). — P. 16059—16072. — doi:10.1074/jbc.M212935200. — PMID 12590135.
  10. Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5 (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — February (vol. 97, no. 3). — P. 1056—1061. — doi:10.1073/pnas.97.3.1056. — PMID 10655483. — PMC 15519.
  11. Miska E.A., Karlsson C., Langley E., Nielsen S.J., Pines J., Kouzarides T. HDAC4 deacetylase associates with and represses the MEF2 transcription factor (англ.) // EMBO J.  (англ.) : journal. — 1999. — September (vol. 18, no. 18). — P. 5099—5107. — doi:10.1093/emboj/18.18.5099. — PMID 10487761. — PMC 1171580.
  12. Lemercier C., Verdel A., Galloo B., Curtet S., Brocard M.P., Khochbin S. mHDA1/HDAC5 histone deacetylase interacts with and represses MEF2A transcriptional activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — May (vol. 275, no. 20). — P. 15594—15599. — doi:10.1074/jbc.M908437199. — PMID 10748098.
  13. Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros-CtIP interactions do not require C-terminal binding protein and participate in a deacetylase-independent mode of repression (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — June (vol. 277, no. 26). — P. 23143—23149. — doi:10.1074/jbc.M202079200. — PMID 11959865.

Литература править

Ссылки править