Толл-подобный рецептор 3

TLR3 (толл-подобный рецептор 3, CD283) — мембранный белок, относится к группе толл-подобных рецепторов, обеспечивающих функционирование врождённого иммунитета. TLR3 связывает двухцепочечную РНК вирусов и, таким образом, играет важную роль в противовирусной защите организма. Обнаружен в 2001 году.

Толл-подобный рецептор 3
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1ZIW, 2A0Z, 3ULU, 3ULV, 2MK9, 2MKA
Идентификаторы
Псевдонимы	TLR3, CD283, IIAE2, toll like receptor 3, IMD83
Внешние ID	OMIM: 603029 MGI: 2156367 HomoloGene: 20696 GeneCards: TLR3
Расположение гена (человек) Хр. 4-я хромосома человека Локус 4q35.1 Начало 186,069,155 bp Конец 186,088,073 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 8-я хромосома мыши Локус 8|8 B1.1 Начало 45,848,702 bp Конец 45,864,117 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в pancreatic epithelial cell pancreatic ductal cell Наибольшая экспрессия в conjunctival fornix stria vascularis secondary oocyte utricle Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание с белками плазмы связывание похожих белков RNA binding double-stranded RNA binding transmembrane signaling receptor activity signaling receptor activity Компонент клетки цитоплазма часть мембраны эндосома endoplasmic reticulum membrane мембрана Golgi membrane часть клеточной мембраны внутренний компонент клетки поверхность клетки lysosomal membrane early endosome эндоплазматический ретикулум endolysosome membrane endosome membrane внеклеточное пространство внеклеточный матрикс Биологический процесс positive regulation of interferon-beta production response to dsRNA defense response positive regulation of toll-like receptor signaling pathway positive regulation of protein phosphorylation развитие яичек positive regulation of inflammatory response positive regulation of interleukin-12 production positive regulation of type III interferon production cellular response to interferon-beta response to exogenous dsRNA negative regulation of osteoclast differentiation positive regulation of cytokine production immune system process response to virus activation of NF-kappaB-inducing kinase activity I-kappaB phosphorylation positive regulation of JNK cascade hyperosmotic response cellular response to dsRNA regulation of dendritic cell cytokine production microglial cell activation toll-like receptor signaling pathway TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway cellular response to mechanical stimulus microglial cell activation involved in immune response positive regulation of gene expression defense response to bacterium positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity defense response to virus necroptotic signaling pathway positive regulation of interleukin-8 production cellular response to exogenous dsRNA positive regulation of interleukin-6 production positive regulation of tumor necrosis factor production cellular response to interferon-gamma positive regulation of chemokine production positive regulation of apoptotic process positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling detection of virus воспалительная реакция Врождённый иммунитет I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling toll-like receptor 3 signaling pathway positive regulation of type I interferon production MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway передача сигнала положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор Некроптоз apoptotic signaling pathway negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway extrinsic apoptotic signaling pathway positive regulation of angiogenesis positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 7098 142980 Ensembl ENSG00000164342 ENSMUSG00000031639 UniProt O15455 Q99MB1 RefSeq (мРНК) NM_003265 NM_126166 NM_001357316 NM_001357317 RefSeq (белок) NP_003256 NP_569054 NP_001344245 NP_001344246 Локус (UCSC) Chr 4: 186.07 – 186.09 Mb Chr 8: 45.85 – 45.86 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Структура

TLR3 является интегральным мембранным белком, состоит из 904 аминокислот. Экстраклеточный регион молекулы белка состоит из цистеин-богатого N-концевого «шапочного» домена (Cap-домен), 23 лейцин-богатых доменов (LRR-домены) и второго цистеин-богатого домена. Лейцин-богатые домены формируют подково-образный соленоид, на внутренней стороне которого находятся участки гликозилирования (домены LRR10 и LRR18). Домены LRR12 и LRR20 значительно выступают из основной структуры молекулы рецептора, причём LRR20 является лиганд-связывающим участком. Трансмембранный домен состоит из единственной альфа-спирали. Цитоплазменный домен включает TIR-домен, связывающий адаптерные белки после активации рецептора.

Функционирование

Лиганды

Естественным лигандом рецептора является молекула двухцепочечной РНК. В силу своей симметричной природы РНКовый дуплекс обеспечивает связывание двух молекул TLR3, повёрнутых навстречу друг другу. Такая димеризация является сигналом, активирующим каскад последующих внутриклеточных процессов этого сигнального пути. В экспериментальных исследованиях используется аналог двухцепочечной РНК — поли(I:C). Чем длиннее этот полимер, тем лучше он активирует рецептор TLR3.

Локализация

Данный рецептор находится на внешней плазматической мембране клетки и в мембране эндосом. Таким образом, клетка отвечает на проникновение вирусной РНК, которая попадает внутрь клетки в процессе эндоцитоза. Двухцепочечные РНК самой клетки находится в цитоплазме и в силу своей локализации не попадает в зону действия TLR3. Однако, при разрушении соседних клеток высвобождающаяся РНК может вступить во взаимодействие с ТЛР3, что может вызвать неблагоприятные реакции организма.

Библиография

• Vercammen E., Staal J., Beyaert R. Sensing of viral infection and activation of innate immunity by toll-like receptor 3 (англ.) // Microbiology and Molecular Biology Reviews : journal. — American Society for Microbiology, 2008. — January (vol. 21, no. 1). — P. 13—25. — doi:10.1128/CMR.00022-07. — PMID 18202435.
• Matsumoto M., Seya T. TLR3: interferon induction by double-stranded RNA including poly(I:C) (англ.) // Adv. Drug Deliv. Rev. : journal. — 2008. — April (vol. 60, no. 7). — P. 805—812. — doi:10.1016/j.addr.2007.11.005. — PMID 18262679.
• Alexopoulou L., Holt A.C., Medzhitov R, Flavell R.A. Recognition of double-stranded RNA and activation of NF-kappaB by Toll-like receptor 3 (англ.) // Nature : journal. — 2001. — Vol. 413, no. 6857. — P. 732—738. — doi:10.1038/35099560. — PMID 11607032.