Интегрин бета-6
Интегрин бета-6 (β6) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGB6, бета-субъединица интегрина αVβ6, рецептора для фибронектина и цитотактина. Ген был впервые клонирован в 1990 году. [1]
| Интегрин бета-6 | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Доступные структуры | |||||||||||
| PDB | Поиск ортологов: PDBe, RCSB | ||||||||||
Список идентификаторов PDB | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | ITGB6 | ||||||||||
| Внешние ID | OMIM: 147558 MGI: 96615 HomoloGene: 685 ChEMBL: 4876 GeneCards: Ген ITGB6 | ||||||||||
| |||||||||||
| Профиль экспрессии РНК | |||||||||||
 | |||||||||||
 | |||||||||||
| Больше информации | |||||||||||
| Ортологи | |||||||||||
| Вид | Человек | Мышь | |||||||||
| Entrez | 3694 | 16420 | |||||||||
| Ensembl | ENSG00000115221 | ENSMUSG00000026971 | |||||||||
| UniProt | P18564 | Q9Z0T9 | |||||||||
| RefSeq (мРНК) | NM_000888 | NM_001159564 | |||||||||
| RefSeq (белок) | NP_000879 | NP_001153036 | |||||||||
| Локус (UCSC) | Chr 2: 160.96 – 161.13 Mb |
Chr 2: 60.6 – 60.72 Mb |
|||||||||
| Поиск в PubMed | Искать | Искать | |||||||||
Функции править
Интегрин альфа-V/бета-6 (αVβ6) является рецептором для фибронектина и цитотактина. Распознаёт специфическую аминокислотную последовательность глицин-пролин-аргинин (R-G-D) в этих лигандах. Клатрин-опосредованный эндоцитоз интегрина αVβ6 способствует инвазивности клеток карциномы.[2]
Интегрин β6 взаимодействует с FLNB и HAX1. αVβ6 является лигандом для фактора роста TGFB1.[3] Кроме этого, он связывается с белком VP1 вируса ящура, с белками оболочки вирусов Коксаки A9 и B1 и действует как рецептор этих вирусов.
Структура править
Интегрин бета-6 состоит из 767 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 85,9 кДа. N-концевой участок (688 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и внутриклеточный фрагмент (58 аминокислот). Внеклеточный фрагмент включает 4 повтора, VWFA домен, до 9 участков N-гликозилирования. Цитозольный участок содержит последовательность для связывания HAX1.
Интегрин бета-6 образует гетеродимерный комплекс, связываясь с альфа-субъединицей альфа-V.
См.также править
Примечания править
- ↑ Sheppard D., Rozzo C., Starr L., Quaranta V., Erle D.J., Pytela R. Complete amino acid sequence of a novel integrin beta subunit (beta 6) identified in epithelial cells using the polymerase chain reaction (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1990. — July (vol. 265, no. 20). — P. 11502—11507. — PMID 2365683.
- ↑ Uniprot database entry for ITGB6 (accession number P18564). Дата обращения: 14 марта 2012. Архивировано 22 июля 2017 года.
- ↑ Munger J.S., Huang X., Kawakatsu H., et al. The integrin alpha v beta 6 binds and activates latent TGF beta 1: a mechanism for regulating pulmonary inflammation and fibrosis (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — February (vol. 96, no. 3). — P. 319—328. — PMID 10025398.
Библиография править
- Bowen J.A., Hunt J.S. The role of integrins in reproduction. (англ.) // Experimental Biology and Medicine : journal. — 2000. — Vol. 223, no. 4. — P. 331—343. — doi:10.1046/j.1525-1373.2000.22348.x. — PMID 10721002.
- Munger J.S., Huang X., Kawakatsu H., et al. The integrin alpha v beta 6 binds and activates latent TGF beta 1: a mechanism for regulating pulmonary inflammation and fibrosis. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 96, no. 3. — P. 319—328. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80545-0. — PMID 10025398.
- Wixler V., Geerts D., Laplantine E., et al. The LIM-only protein DRAL/FHL2 binds to the cytoplasmic domain of several alpha and beta integrin chains and is recruited to adhesion complexes. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 43. — P. 33669—33678. — doi:10.1074/jbc.M002519200. — PMID 10906324.
- Arihiro K., Kaneko M., Fujii S., et al. Significance of alpha 9 beta 1 and alpha v beta 6 integrin expression in breast carcinoma. (англ.) // Breast Cancer : journal. — 2000. — Vol. 7, no. 1. — P. 19—26. — PMID 11029766.
- Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination. (англ.) // Genome Research : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
- Arend L.J., Smart A.M., Briggs J.P. Mouse beta(6) integrin sequence, pattern of expression, and role in kidney development. (англ.) // Journal of the American Society of Nephrology : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 12. — P. 2297—2305. — PMID 11095652.
- Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs. (англ.) // Genome Research : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 3. — P. 422—435. — doi:10.1101/gr.GR1547R. — PMID 11230166. — PMC 311072.