Матриксная металлопротеиназа 16

Матриксная металлопротеиназа 16
Матриксная металлопротеиназа 16
	PDB rendering based on 1rm8.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
	Список идентификаторов PDB 1RM8
Идентификаторы
Символ	MMP16 ; C8orf57; MMP-X2; MT-MMP2; MT-MMP3; MT3-MMP
Внешние ID	OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 ChEMBL: 2200 GeneCards: Ген MMP16
номер EC	3.4.24.-
Функция	• metalloendopeptidase activity; • calcium ion binding; • enzyme activator activity; • zinc ion binding;
Компонент клетки	• proteinaceous extracellular matrix; • Golgi lumen; • plasma membrane; • integral component of plasma membrane; • cell surface;
Биологический процесс	• proteolysis; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • collagen catabolic process; • positive regulation of catalytic activity;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Матриксная металлопротеиназа 16 (англ. matrix metallopeptidase 16, MMP16) — мембранная эндопептидаза подсемейства матриксных металлопротеиназ, кодируется геном человека MMP16.

Функция править

MMP16 расщепляет различные компоненты внеклеточного матрикса, включая коллаген III типа и фибронектин. Активирует прожелатиназу A. Участвует в перестройке сосудов.

Взаимодействует с CSPG4 через хондроитинсульфат-гликозаминогликановую цепь последнего.

Структура править

Синтезированный белок состоит из 607 аминокислот. После отщепления сигнального пептида и пропептида эндопептидазой фурином зрелый белок включает 488 аминокислот. Состоит из N-концевого внеклеточного участка (445 аминокислот), единственного трансмембранного фрагмента и короткого (22 аминокислоты) цитозольного участка. Внеклеточный участок включает 4 гемопексин-подобных доменов, цистеиновый переключатель, 4 участка связывания цинка и каталитический центр, 1 участок N-гликозилирования и 1 участок фосфорилирования (по тирозину-52).^[1]

Тканевая специфичность править

MMP15 экспрессируется в сердце, мозге, плаценте, яичниках и тонком кишечнике. Короткая изоформа синтезируется в яичниках.

См. также править

Матриксная металлопротеиназа

Примечания править

↑ Uniprot P51512 (неопр.). Дата обращения: 25 октября 2012. Архивировано 1 июня 2017 года.

Библиография править

Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Jung M., Römer A., Keyszer G., et al. mRNA expression of the five membrane-type matrix metalloproteinases MT1-MT5 in human prostatic cell lines and their down-regulation in human malignant prostatic tissue (англ.) // Prostate : journal. — 2003. — Vol. 55, no. 2. — P. 89—98. — doi:10.1002/pros.10194. — PMID 12661033.
Takino T., Koshikawa N., Miyamori H., et al. Cleavage of metastasis suppressor gene product KiSS-1 protein/metastin by matrix metalloproteinases (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 22, no. 30. — P. 4617—4626. — doi:10.1038/sj.onc.1206542. — PMID 12879005.
Rozanov D.V., Hahn-Dantona E., Strickland D.K., Strongin A.Y. The low density lipoprotein receptor-related protein LRP is regulated by membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) proteolysis in malignant cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 6. — P. 4260—4268. — doi:10.1074/jbc.M311569200. — PMID 14645246.
Lang R., Braun M., Sounni N.E., et al. Crystal structure of the catalytic domain of MMP-16/MT3-MMP: characterization of MT-MMP specific features (англ.) // J. Mol. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 336, no. 1. — P. 213—225. — doi:10.1016/j.jmb.2003.12.022. — PMID 14741217.
Shofuda T., Shofuda K., Ferri N., et al. Cleavage of focal adhesion kinase in vascular smooth muscle cells overexpressing membrane-type matrix metalloproteinases (англ.) // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 24, no. 5. — P. 839—844. — doi:10.1161/01.ATV.0000126680.78500.4c. — PMID 15044209.
Wang S.C., Lien H.C., Xia W., et al. Binding at and transactivation of the COX-2 promoter by nuclear tyrosine kinase receptor ErbB-2 (англ.) // Cancer Cell : journal. — 2004. — Vol. 6, no. 3. — P. 251—261. — doi:10.1016/j.ccr.2004.07.012. — PMID 15380516.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Kimura K., Wakamatsu A., Suzuki Y., et al. Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 1. — P. 55—65. — doi:10.1101/gr.4039406. — PMID 16344560. — PMC 1356129.

[1] Uniprot P51512 (неопр.). Дата обращения: 25 октября 2012. Архивировано 1 июня 2017 года.

[1]