Путь неблагоприятного исхода

Путь неблагоприятного исхода (ПНИ) — структурированное представление биологических событий, приводящих к нежелательным явлениям, которое считается важным для оценки риска [1][2][3]. ПНИ линейно соединяет существующие знания по одной или нескольким сериям ключевых событий, обладающих причинной связью, между двумя точками — молекулярным инициирующим событием и неблагоприятным исходом, которые происходят на уровне биологической организации, релевантном для оценки риска [2]. Связь между событиями описывается с помощью отношений ключевых событий, описывающих причинно-следственные связи между ними.

ПНИ важны для расширения использования механистических токсикологических данных для оценки риска и для нормативных документов с недавними приложениями в других дисциплинах, таких как климатология [2][4][5][6].

Справочная информация править

 
Схема ПНИ с гипотетическими событиями

В 2012 году Организация экономического сотрудничества и развития (ОЭСР) запустила новую программу по развитию путей неблагоприятных исходов. В руководстве подробно описано, как должны разрабатываться, пересматриваться, согласовываться и публиковаться ПНИ на уровне ОЭСР [7]. Предполагается, что рабочий процесс по разработке и пересмотру ПНИ должен осуществляться с помощью веб-инструмента управления ИТ: базу данных о путях неблагоприятных исходов (БД-ПНИ) [8], которая в настоящее время все еще находится в стадии разработки. Это удобный для пользователя инструмент на основе вики-разметки, предоставляющий интерфейс с открытым исходным кодом для совместного обмена имеющимися и создания новых ПНИ. БД-ПНИ дает научному сообществу возможность получать, делиться и обсуждать знания, связанные с ПНИ, в едином информационном пространстве. БД-ПНИ позволяет создавать ПНИ путем ввода и последующего связывания информации о молекулярном инициирующем событии, ключевом событии, неблагоприятном исходе и химических инициаторах. Зная, что элементы пути не обязательно уникальны для одного ПНИ, ценность существующих знаний увеличивается за счет облегчения повторного использования информации о молекулярном инициирующем событии, ключевом событии, неблагоприятном исходе в нескольких ПНИ, что предотвращает избыточность и делает коллективные знания об этих объектах доступными во всех ПНИ, в которых они появляются.

БД-ПНИ представляет собой комбинацию отдельно разработанных приложений, синхронизированных и организованных таким образом, чтобы предоставить пользователям возможность получать, проверять, просматривать и комментировать ПНИ, которыми делится сообщество заинтересованных лиц.

Проект БД-ПНИ — это инициатива Организации экономического сотрудничества и развития, которая осуществляется в тесном сотрудничестве между Объединенным исследовательским центром Европейской комиссии, Агентством по охране окружающей среды США и Центром инженерных исследований и разработок инженерного корпуса вооруженных сил США с целью реализации программы Организации экономического сотрудничества и развития по разработке ПНИ [3].

ПНИ также недавно применялся для лучшего понимания эффектов стрессовых факторов, связанных с климатом, что еще больше расширило потенциальные возможности ПНИ в других научных дисциплинах [6].

Более поздние разработки сосредоточены на анализе сетей ПНИ [9] и количественной оценке отношений ключевых событий с целью разработки математических моделей ПНИ, иногда называемых количественными ПНИ [10].

Научные семинары, проведенные для продвижения концепции ПНИ:

  • 2013 г.
    • 23–25 января, Балтимор, США. Формирование коллективного опыта для продвижения практического применения токсикологии, основанной на представлениях путей взаимосвязанных событий: Принцип действия печеночной токсичности [11]
  • 2014 г.
    • 2–7 марта, Сомма Ломбардо, Италия. Развитие путей неблагоприятного исхода (ПНИ) для комплексного применения в токсикологии и регуляторной практике [12]
    • 24 августа, Прага, Чешская Республика. ПНИ 101: Как и зачем разрабатывать и использовать [13]
    • 3–5 сентября, Бетесда, США. Семинар «Пути неблагоприятных исходов: от исследования к регулированию», проведенный Межведомственным центром НПТ по оценке альтернативных токсикологических методов (NICEATM) и Комитетом врачей по ответственной медицине. Материалы семинара, включая ссылки на видеозаписи пленарного заседания и резюме обсуждений в секционных группах, доступны на веб-сайте НПТ [14]

Ссылки править

  1. Toxicity testing in the 21st century : a vision and a strategy. — Washington : The National Academic Press, 2007. — ISBN 978-0-309-15173-3.
  2. 1 2 3 Ankley GT, Bennett RS, Erickson RJ, Hoff DJ, Hornung MW, Johnson RD, et al. (March 2010). "Adverse outcome pathways: a conceptual framework to support ecotoxicology research and risk assessment". Environmental Toxicology and Chemistry. 29 (3): 730—741. March 2010. doi:10.1002/etc.34. PMID 20821501.
  3. 1 2 Adverse Outcome Pathways, Molecular Screening and Toxicogenomics. OECD. Дата обращения: 15 мая 2023. Архивировано 16 мая 2023 года.
  4. "Adverse outcome pathways and ecological risk assessment: bridging to population-level effects". Environmental Toxicology and Chemistry. 30 (1): 64—76. January 2011. doi:10.1002/etc.375. PMID 20963853. Архивировано 2 августа 2023. Дата обращения: 15 мая 2023.
  5. Chapter 14:Adverse Outcome Pathways: A Way of Linking Chemical Structure to in Vivo Toxicological Hazards // In silico toxicology principles and applications. — Cambridge : Royal Society of Chemistry, 2010. — P. 346–371. — ISBN 978-1-84973-209-3. — doi:10.1039/9781849732093-00346. Архивная копия от 29 ноября 2014 на Wayback Machine
  6. 1 2 "How the Pacific Oyster Responds to Ocean Acidification: Development and Application of a Meta-Analysis Based Adverse Outcome Pathway". Frontiers in Marine Science. 7. 2020. doi:10.3389/fmars.2020.597441.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  7. The Development of AOPs. oecd.org. OECD. Дата обращения: 15 мая 2023. Архивировано 16 мая 2023 года.
  8. Adverse Outcome Pathway Knowledge Base (AOP-KB). Дата обращения: 15 мая 2023. Архивировано 15 мая 2023 года.
  9. "Development and analysis of an adverse outcome pathway network for human neurotoxicity". Archives of Toxicology. 93 (10): 2759—2772. October 2019. doi:10.1007/s00204-019-02551-1. PMID 31444508.
  10. "Towards a qAOP framework for predictive toxicology - Linking data to decisions". Computational Toxicology. 21: 100195. February 2022. doi:10.1016/j.comtox.2021.100195. PMID 35211660.
  11. "Building shared experience to advance practical application of pathway-based toxicology: liver toxicity mode-of-action". Altex. 31 (4): 500—519. 2014. doi:10.14573/altex.1401281. PMID 24535319.
  12. Advancing Adverse Outcome Pathways (AOP) for Integrated Toxicology and Regulatory Applications. Workshop. Somma Lombardo, Italy. March 2014. Archived from the original on 19 November 2014. Retrieved 16 September 2014. Архивировано из оригинала 19 ноября 2014. Дата обращения: 15 мая 2023.
  13. AOPs 101: The How and Why of Development and Use. Дата обращения: 17 сентября 2014. Архивировано 6 ноября 2014 года.
  14. Adverse Outcome Pathways: From Research to Regulation. NTP. Дата обращения: 16 сентября 2014. Архивировано 16 ноября 2014 года.